Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 21 gene–annotation pairs matching IPR001107 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 215 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 21
SpeciesGene IDInterPro termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0092.g9.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0179.g39.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0092.g8.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0156.g51.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0156.g51.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0179.g45.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0179.g39.t2IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0002.g401.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0002.g401.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0179.g34.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0179.g34.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0060.g37.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0161.g30.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0161.g30.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0022.g31.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0022.g31.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0179.g34.t2IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0179.g34.t2IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0179.g34.t3IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0179.g34.t3IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0049.g16.t1IPR001107Band 7 domainInterproscanJBrowse

TOP