Functional Domain Search

Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

InterPro Pfam KEGG pathway Gene Ontology PANTHER

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox · matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 16 gene–annotation pairs matching IPR001388 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 357 ms.

Species with hits:← all species AGEMM 16

Species	Gene ID	InterPro term	Match	Source	Browser
AGEMM	agem_s0069.g44.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0069.g44.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0069.g44.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0069.g44.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0124.g70.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0124.g70.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0124.g70.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0124.g70.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0248.g3.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0248.g3.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0248.g3.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0203.g13.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0203.g13.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0127.g41.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0127.g41.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse
AGEMM	agem_s0127.g41.t1	IPR001388	Synaptobrevin-like	Interproscan	JBrowse