Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 23 gene–annotation pairs matching IPR003307 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 358 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 23
SpeciesGene IDInterPro termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0095.g40.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0095.g40.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0095.g40.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0146.g23.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0146.g23.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0146.g23.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0032.g42.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0032.g42.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0032.g42.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0156.g30.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0156.g30.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0156.g30.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s1322.g1.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s1322.g1.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s1322.g1.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0507.g4.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0507.g4.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0086.g23.t2IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0086.g23.t2IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0086.g23.t2IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0086.g23.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0086.g23.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0086.g23.t1IPR003307W2 domainInterproscanJBrowse

TOP