Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 15 gene–annotation pairs matching IPR006630 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 331 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 15
SpeciesGene IDInterPro termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0007.g173.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0007.g173.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0007.g173.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0096.g49.t2IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0096.g49.t2IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0096.g49.t2IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0096.g49.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0096.g49.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0096.g49.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0105.g36.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0105.g36.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0105.g36.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0015.g179.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0015.g179.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0015.g179.t1IPR006630La-type HTH domainInterproscanJBrowse

TOP