Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 14 gene–annotation pairs matching IPR008139 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 347 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 14
SpeciesGene IDInterPro termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0007.g125.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0007.g125.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g49.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g49.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g49.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g49.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g49.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g49.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0410.g5.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0410.g5.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g37.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g37.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g37.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0033.g37.t1IPR008139Saposin B type domainInterproscanJBrowse

TOP