Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 20 gene–annotation pairs matching IPR039477 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 303 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 20
SpeciesGene IDInterPro termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0008.g45.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0008.g44.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0266.g6.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0266.g6.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0023.g139.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0001.g42.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0001.g42.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0001.g42.t3IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0001.g42.t3IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0008.g47.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0001.g42.t2IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0001.g42.t2IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0324.g24.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0023.g142.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0001.g202.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0001.g202.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0016.g199.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0266.g6.t2IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0266.g6.t2IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0008.g50.t1IPR039477ILEI/PANDER domainInterproscanJBrowse

TOP