Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

InterProPfamKEGG pathwayGene OntologyPANTHER
Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 15 gene–annotation pairs matching IPR040847 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 141 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 15
SpeciesGene IDInterPro termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0002.g236.t2IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0002.g236.t2IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0002.g236.t2IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0380.g1.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0380.g1.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0380.g1.t2IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0380.g1.t2IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0074.g11.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0074.g9.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0074.g9.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0074.g9.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0002.g236.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0002.g236.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0074.g8.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0074.g8.t1IPR040847Mind bomb, SH3 repeat domainInterproscanJBrowse

TOP