Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 17 gene–annotation pairs matching IPR041966 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 137 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 17
SpeciesGene IDInterPro termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0069.g17.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0069.g17.t3IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0237.g17.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0237.g17.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0237.g17.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0237.g17.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0237.g17.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0237.g17.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0024.g118.t3IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0024.g118.t3IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0014.g56.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0014.g56.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0014.g56.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0069.g17.t2IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0069.g17.t4IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0024.g118.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0024.g118.t1IPR041966LOTUS-like domainInterproscanJBrowse

TOP