Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 16 gene–annotation pairs matching IPR050621 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 375 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 16
SpeciesGene IDInterPro termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0110.g37.t2IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0063.g13.t2IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0139.g41.t1IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0051.g49.t1IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0051.g49.t2IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0139.g41.t2IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0139.g41.t3IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0063.g13.t1IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0043.g17.t1IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0073.g5.t1IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0014.g27.t1IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0014.g56.t1IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0024.g118.t1IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0024.g118.t2IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0073.g5.t2IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0110.g37.t1IPR050621Tudor domain-containingInterproscanJBrowse

TOP