Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

InterProPfamKEGG pathwayGene OntologyPANTHER
Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 12 gene–annotation pairs matching PTHR12268 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 36 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 12
SpeciesGene IDPANTHER termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0140.g9.t3PTHR12268E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE KCMF1InterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0048.g24.t1PTHR12268E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE KCMF1InterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0048.g24.t3PTHR12268E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE KCMF1InterproscanJBrowse
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AGEMMagem_s0062.g65.t2PTHR12268E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE KCMF1InterproscanJBrowse
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AGEMMagem_s0032.g162.t2PTHR12268E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE KCMF1InterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0032.g162.t1PTHR12268E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE KCMF1InterproscanJBrowse

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