Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

InterProPfamKEGG pathwayGene OntologyPANTHER
Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 18 gene–annotation pairs matching PF00055 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 87 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 18
SpeciesGene IDPfam termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0104.g86.t2PF00055Laminin N-terminal (Domain VI)InterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0101.g17.t1PF00055Laminin N-terminal (Domain VI)InterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0104.g80.t1PF00055Laminin N-terminal (Domain VI)InterproscanJBrowse
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AGEMMagem_s0055.g66.t4PF00055Laminin N-terminal (Domain VI)InterproscanJBrowse
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AGEMMagem_s0014.g66.t1PF00055Laminin N-terminal (Domain VI)InterproscanJBrowse

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