Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 19 gene–annotation pairs matching PF00227 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 38 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 19
SpeciesGene IDPfam termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0040.g14.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0019.g196.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0075.g74.t2PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0005.g63.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0037.g30.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0026.g39.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0143.g8.t2PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0143.g7.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0375.g6.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0284.g12.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0014.g151.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0075.g74.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0009.g106.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0143.g8.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0132.g35.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0047.g111.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0027.g57.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0260.g4.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0165.g18.t1PF00227Proteasome subunitInterproscanJBrowse

TOP