Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

InterProPfamKEGG pathwayGene OntologyPANTHER
Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 12 gene–annotation pairs matching PF07002 across 1 genomes (restricted to AGEMM) · 43 ms.

Species with hits:← all speciesAGEMM 12
SpeciesGene IDPfam termMatchSourceBrowser
AGEMMagem_s0139.g69.t2PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0313.g6.t5PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0227.g23.t1PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0313.g6.t1PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0002.g339.t1PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0001.g353.t1PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0313.g6.t3PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0313.g6.t2PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0313.g6.t4PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0227.g23.t2PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0227.g23.t2PF07002CopineInterproscanJBrowse
AGEMMagem_s0139.g69.t1PF07002CopineInterproscanJBrowse

TOP