Gene detail

Detailed information of ANN09598-RA in Leptoseris scabra

Genomic Location: Scaffold_6__1_contigs__length_62720928:55921648...55928810
NR annotation: XP_020611125.1, uncharacterized protein LOC110049659 [Orbicella faveolata]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

ANN09598-RA

ATGGAGAAAGACGGCACATGGGACAATCATCGGGTTCTACCTGCTGCAGCCAACTACCATCAAACTTTCATCCGTGTTATCTACAGTAGTCTTGGGCGCGACATATTTATCACTCCATATGACCCCGGAGTTGTCCGCAGCAACCCACTCGTGTTGGGACACATTCACATGAAACACTATGCTAGTCTTCGGCTCAGACGAGTTGCTTCATTGCCCAAAACTAGCCAGAGTACAGTAAAAAGGAGAAGGAATGGGGACCGGCAAGAGAGCGCGTCTGGTGCTAGGACAAAGGCCAGGAAAACTGGGGACAGTTTCAGCTCATCAACATTTTATCCTGCAGAGCATATTACCGCTACAGGTCTCGACCCAGAACTTACCTACCAAAGGAAAAGAACAAATTATGCTCGTTTATGCCAACTCCTGGTCAACGTGGGTTCACAATGGAGTAAACTGTATCCCGCCAAACCCTCTTCAGTGTCATCCACAGGCTTCAGCCCCGCCCTCCTGATGGTCCTCCTGAGGACAATCTGCAACCTGAGTCCTCCACCCGCTGGTTGGGATGTTCCTCCCCATTTCGAGGACACCAGCCGCGAGGCTGACATTGCCCGTGTAAATATTAATTATTTTATGGATGCTGTGTTTGACCAGGCGAGGGGGGCCTCTTTGAGTGATGCTTTGTTCAGTGAATACTGGCAGAAGATCCGGTACACGCTGGTGCGATTAGGAGGAGCTCGATATGAAGATGTTATTGATGAAATGAAGAATCAGGAAATGAACTCTCTGGATGAGGAACATTTCATAGAGCTTTTAAAGCAGTGGAAAGAAGTTGAGGACAACATTAAGGTCAATCTGTGTGAACTAGAGAGTGTGATGTTGGGTTCTGGAGAGGAAGATGTGTCTAATCCTGCCCAGATCAAAGAACTGTTCCGTGTAGCTGAAGTACTTAAGGTCAACACATGTTTGACTAGTTTGGATTTCTATGGGAACGAGACTGGTGCTTCTGGCGCTGCTGCTATTTCTGAAGGACTTAAAGTCAACACATGTTTCATTCATTTGGACTTCGGTTTGATCAAGATTGATGATTCTGGTGCTGCTGCTATTTCTGAGGCTCTTAAAGTCAACACATGTTTGACTTATTTGAATTTGTTCAACAACGGAATTGGTAAATCTGGCGCTGCTGCTATTTCTGAGGCTCTTAAAGTAAACACATGTTTGACTCATTTGAATTTGGATGGGAACAAGATTGGTGATTCTGGTGCTGCTGCTATTTCTGAGGCTCCTAAAGTCAACACATGTTTAAATTATTTGAATTTGTTCAACAACGGAATTGGTAAATCTGGCGCTGCTGCTATTTCTGAGGCTATCAAAGTCAACACGTGCTTAACTGACTTGAATTTAAAATGGAACAAGATTGGTGATTCTGGTGCTGTTGCTCTTTCTAAGGCTCTTAAACTCAACACATGTTTAACTCATTTGAATTTGTTGAAGAACCGAATTGGTGATTCTGGCGCCGCTGCTATTTTTAAGGCTCTTAAAATCAACACATGCTTAAGAGAATTAAACTTAAAATTAAACAAGAACGGTGATGCTGGAGCTGTTGCCCTTTCTAAGGCTCTTAAAGTCAACACATGTTTGACTCATTTGAATTTGTTGCTGAGCGGGATTGGTGCTTCTGGTGCTACTGCTATTTCTGAGGCTATCAAAGTCAACACATGCTTAACTGACTTGAATTTAAAATGGAACAAGATTGGTGATTCTGGTGCTGTTGCCCTTTCTAAGGCTCTTATAGTCAACACATGTTTGACTCATTTGAATTTGTTGAAGAACGGAATTGGTGATTCTGGCGCTGCTGCTATTTCTGAGGCTCTCAAAGTCAACACATGCTTAACTGACTTGAATTTAAAATGGAACAAGATTGGTGATTCTGGTGTTGTTGCTCTTTCTGAGGCTCTTAAAAGCAACACATGTTTGACTCATTTGAATTTGTTGAAGAACGGAATTGGTGATTCTGGCGCTACTGCTATTTCTGAGGCTCTCAAAGTCAATACATGCTTAACTGACTTGAATTTAAAATCGAACAAGCTTAGTGATTCTGGTGCTGTTGCTCTTTCTGAAGCTGTTAAAGTCAACACATGTTTGACTTTTTTGAATTTGTTGAATAACGGAATTGGTGCTTCTGGCAAGGCTGCTCTTTCTGAGGCTGTTAAAGTCAAGAGACGTTCGACTAATTTGGATTTTGTTTGA

Transcript

ANN09598-RA

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13516	LRR_6	Leucine Rich repeat	Repeat	Interproscan
PF18738	HEPN_DZIP3	DZIP3/ hRUL138-like HEPN	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001611	Repeat	Leucine-rich repeat	Interproscan
IPR041249	Domain	DZIP3-like HEPN domain	Interproscan
IPR032675	Homologous_superfamily	Leucine-rich repeat domain superfamily	Interproscan
IPR027038	Family	Ran GTPase-activating protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24113	RAN GTPASE-ACTIVATING PROTEIN 1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005096	Molecular Function	GTPase activator activity	Interproscan