Gene detail

Detailed information of ANN12206-RA in Leptoseris scabra

Genomic Location: Scaffold_8__1_contigs__length_51692913:44407777...44410715
NR annotation: XP_044166773.1, uncharacterized protein LOC122950838 [Acropora millepora]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

ANN12206-RA

ATGCCAGACCGGGCTTTTCTTTCCCCGCAATTGACTGATCTAATTACCCAACACAAGAATATTGGAGAGAGTTCAAGAAGCTTCGTCCGGAATCCCCGTTCCAATTTGGGTCTTGACAATCTGCGAGCCAGCGAGGCATGCGAGGCAGACGTGCGAGGCACTCAGTTCGTTGTAGTTGCATTAAGTAATGTGTATTGTATTAAAGCAACAACAAAAACGCCCCTTTTGATCCCATTTGTTATTGTAGATGCGTCACATCCTGCACATGTTATCAAAAAGAACCGCCAACTCTACGAAAGCGGCGAAGTTCCTTTGAGCGAAAGATCCCCTTTTTCCTATCTGAAAGACATTTTATCAAGGCTTAGGATTGGTGGCAAAGAAAAGACTCGAGGGATATTGACTGATGAATTTACAAACATAACAGGTATCTCAACACCTCATGAAGGTTGTCAGAAACCATCGCTGTCCCTGATTACGGGCAAACCTGGTATGGAAAAAACGTTCTGTCAGAAGCTGGCCGTTGACTGGGCAACTGAATCCTTACCGAGGAATAGGCCTCTAAATAAAGTTTCATTGTGCTTTCTTTCCGAGGATTTTCAGGGCGACCTTCCAGTGAACAAAACTCAATCATATATTGAAATTGTTCTTCGTGTTTTGCGAGGATATGAAGAAAAGAATGGATTGTCAAGTCGCAGTGAAGACCTTATAAGAGTTTACAAGAAAGAGCTGTTGCACTTGGGGCGTGCGGCGTTACAGTCTCTTTTAGAAGGAAGATCTTATCTCGAAGAACACGAGTTTGGTCTTAATACAGGCCTTTTATCTCTGTCAATCCAGGGTGGCGATAGTGAGTCGAAACCGTGCAACCGTTATGGATTTTTTGACCGTAGTATGCAAGAGTTCTTTTCCGCCTTATATCTTGCGTTTCAGATTCTCGACGGGGAAATTGATTGTGGCTCAGTAGTGTCTGATGAACGATATTTGAATCTAAATCAAGTGTTTTTGTTCATGACTGGAATTGTAGCCTCGCAATGTGAAGAAACTGCGGTGATTCTTGTTAATAGTTTGACCGCACAGATCAATTCTCTTGACAGCAAATCTTACACGAGAATAGGATCGTTTCTGCAGTTTGCTTTCGAATGTCTATCTGAATGTACAGCCTGTATTGCGAAACGTTCTCAACCTCGATTGGTACACACTTTTGGCAGGAACCTTAACATTGCAACTATACAGCTGGCTGGTTTCAAGCACATAGAGCTTCTCTTTGAAGCTCTCTCAGTGAACTCCTCCCTGACTAGTTTGAACATGCGAGGCAGCAGTGTTGGTGATTCAAGTGTTTTTCCCGTTTCCGTTTCCAACGCCCTTTTAGTAAACTCCTCCCTGACCAATTTGGATTTGACTTCGAACGGAATTGGTGATACCGGTGCCGAATCCCTTTCCCACGCCCTCACAGTAAACTCCTCCCTGACTAATTTGAATTTGAGTGGGAACCGTGTTGGTGATACCGGTGCTCGCTCCCTTTCCCAGGCCCTCACAGTAAACTCCTCCCTGACTAATTTGAATTTGAGTGGGAACAGCATTGGTGATACAAGTGCCGAATCCCTTTCCCGAGCCCTCACATGTAACTCCTACCTGACCAATTTGGATTTGAGTGGGAACAGTATTGGTAGTACCGGTGCCGAATCCCTTTCCCGGGCCCTCACATTTAACTCCTCCCTGACTAATTTGGATTTGAGTGGGAACAGTATTGGTAGTACCGGTGCCGAATCCCTTTCCCGGGCCCTCACATTTAACTCCTCCCTGACTAATTTGGATTTGAGTGGGAACGGTATTGGTAGTACCGGTGCCGAATCCCTTTCCCGGGCCCTCACATTTAACTCCTCCCTGACTAATTTGGATTTGAGTGGGAACAGTATTGGTCATACCGGTGCCGAATCCCTTTCCCGGGCCCTCACATTTAGCTCCTCCCTGACTAATTTGGATTTGAGTGGGAACAGTATTGGTGATACAAGTGCCGAATCCCTTTCCCGGGCCCTCACATGTAACTCCTCCCTGACCAATTTGGATTTGAGTGGGAACAGTATTGGTAGTACCGGTGCCGAATCCCTTTTCCAGGCCCTCACATTTAACTCCTCCCTGACTAATTTGGATTTGAGTGGGAACAGTATTGCTGATACCGGTGCTGAATCCCTTTCCCAGGCCCTCACAGTAAACTCCTCCCTGACAAACTTGAATTTGAATGGGAACGGCATTGGTTTAGTTGGCGTTGCTTGCCTTTCCCACGCCCTCATAGTAAACTCCTCCCTGACTTATTTGGAGTTGTGTGGGAACAGTATTGGTGATACCGGTGCTAGCTCCCTTTCCCAGGCCCTCACAGTAAACTCCTCCCTGACTGATTTGGATTTGAGTGGGAACAGTATTGGTGATACCGGTGCTTGCTCCCTTTCCTCGGCCCTCACAGTAAACCCCTCCCTGACTAATTTGGATTTGAGTAGAAACAGTATTGGTGATACCGGTGCTTGCTCCCTTTCCCAGGCCCTCACAGTAAACTCCTCCCTGACTAATTTAAATTTGAGTGGGAACAGTATTGGTGATACCGGTGCTTGCTTCCTTTCCCAGGCCCTCACAGTAAACTCCTCCCTGACTAATTTGGATTTGTTTGGGAACAGTATTGGTGATACCGGTGCTTACTCCCTTTCCTAG

Transcript

ANN12206-RA

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13516	LRR_6	Leucine Rich repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001611	Repeat	Leucine-rich repeat	Interproscan
IPR032675	Homologous_superfamily	Leucine-rich repeat domain superfamily	Interproscan
IPR052201	Family	Leucine-rich repeat-containing regulator of pluripotency	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24111	LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING PROTEIN 34	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan