Gene detail

Detailed information of ANN20443-RA in Leptoseris scabra

Genomic Location: Scaffold_4__1_contigs__length_45231618:9435631...9444162
NR annotation: CAH3190496.1, unnamed protein product [Porites evermanni]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

ANN20443-RA

ATGTCAGAGGCTGCAAAGAACGTAGGTAACACTTTGGAGGATGACGTTGACGTGTTCAGTGACGCAAATGTCGAGAGTAAGCGGAAATTTAACGCGATCAGTGACGGCCCGCCTCAGCTTTTAAAGAATCCTCCACCCATTAGTGATATGCAAACAATAATAAAGCATCCAAATGATGTACATCTGCCTGTCGACATCTTGTTACTGACTGTTAAGGATCACGAGTTCTCATCTTGTTACATGTATATGGACAGTACATATAAATGTTGGTTTGATGGTCTCGGGTACGTTTATTTTGGGTGCATTGGTGACAATCAGGAGAAAGTGCAAGTCGCGTTGATCAAATGTTATGAAGGTTCAAGTGGTCCTGGTGGTTCACTGATAACTGCCAAAAATGCTGGCCCGTTGCTACGCCCAAAGGCAATCATCTCAGTCGGAACGTGCAGAGGGCTCGACCGTGGGAAAACAAAACTAGGAGATGTTGTTGTTTCGGCGAAATTAACGACATATGCTTCTAAAATAGTGACGGATAACCAGGAACAATCAACCGGTATGAGAAGCTATGTTAGTAAACGTTTTTTGGACGTCATCAGAGATTTATCCCATGGATGGAAAGCCCCGCTAGAAAACCCGGAAGAACGAGAAGTCGAACTGTATTGTAATGGCGAGTTTTTGAGTGGCCCTGAGGAGGTCAGTGCTGAATGGCGCTGCAAACAGCTGTTTGAAGCTCATCCGCTGGCTACAGCCATTGAAACAGAAGGTGAAGTTACAGATTCTACCAATGGCAAAACTCGAGGAGGAGCTGCGTTTGACGATCAAGTTGAATGGCTCATTGTAAAAGGAATATCAAACTTTGCAGATGGTAATGAGTCCACCACCGATGATTGGAATCCGTTTGCCAGTGTTATGGCCGCTTCAGTTGTTGCAAAACTCTTGAATGATTCTGCTGTTTTTAAGCGATGGCCAAGACCTCATTATCAAGATAGCAAACCAAGGATTGAAAAGTCTGCCGTTCCTCCAATGGTTCCTAACTTCACTGGCCGCAAGGGAGAATGTGATGAGATTGTTAGTTACCTGACATCCCAATCCACCCGAATGGTGTTGATCTGGGGCTCACCGGGATTCGGAAAGACGTCGGTTGCAAACGCAGTGGGGCATGAGCTCTATTCGCAAGGCTTACCAGTTTGTTGGCTCACTCTGCGAGGGCTAAAATCAAAAACTGATCTGGCATCAAAGCTTCTTAGCTTTGTTAGAAGACCTCCCACAAACAATCTACCATCTGATAAGCATCTCTCACTTGACGACGAGCTTTGTCAACTTTTCAGCGATATATCAGATCCGTGTGTCTTCATTCTCGATAATGCCGATGACTTATTAGAAAGTGGTGGGCCGCAAGTGAAGGAAGAGGTCATCGGACTTTTAAAAGAAATTCTTAGCCGAAGTGCACAGGTGAAATTCCTTATAACTACGAGGGGTTCTTTCGAATTTATGAATCTGGATTTTCAAGGCCACATGGAGGTAAGAATAAGACCACTGGATGAAGCCTCTTCTCAATACTTTGTTCGTGAATTACTTCCAAATGCAAGCAGCCTTGAAGTGAGGCGAATCGCTAAAATCTGTGGACATGTCCCTTTAGCCATCAAACTTTTGTGTTCTTCAATCTCTCAAGATGATGGTGTGGAAATTACTCAGTTTCTGCATGATTTTATGGAATCCTCTACAGAAAGTATCGCTGAGATGTTGGACAACCAAGATTATCCAACTCATCTCCGAATGCAGTTCCTTTTCAACTTGTCTTTCCAGAGACTCTCTGCACTGGAAAAGAAAGCGCTTGTCTCCTTTTCTATCCTGCCAGAGAGTTTTGATATCGATATTTCTACAGCTGTTTTGGACGAAAACAGATTTCGCACTAACAAGGTTTTACAATCCCTTCGAAGAAAATCTCTTCTCGATTCAAATTTAAAACACGGATCATTCACAATGCATTACCTCATTCAGTCATTTGCAAGAGAAAAGGGAGAAGTAGAAATGAAAGAAGATCTATTGAAATCAAAAGCCCGGTTCTACACATTTTTCGTTTCACGCTTTGAAACGCTGAATGAGCAGTTCCTTAAAGGTAATTCTATGTCGGCATTTCTTGCATTCTTTGAAGATAAAGAGAGCTTTATCCAAAGTCTACTTGAAAGTTGTTCAGATACAAGGACAGCTAATCGTACATTTGATGTGTTAATAAAAGCAGAGCTCTTTCTAGATTCGGTTTTTTGGTATTCGAATGAAGCAGCAAACTTCGATAAGGTATACGATTCAGCATTAAAGGCAGCCAGTCTTCAAGGAAAAGACATGTACCACAGACGCTTACTTGTTTCCAAAGCTTTTGGCGAGCTAACATGGGGCGCGAGAGGACAGTCAATACAGCTTCTCTCAGAAGTTGACAAAATCTTTTCTACATCTTCCTCTATTTCGTCTGACGAGAAGGCAAAATACTCGTGCTACTTAGGCCTCTACCAGCTTGTTAAAGGAGAAACGGAGAATGGAGTTGAATGTTTAAAAGAGGCCCTTTCTTTAATGAATAACAGTCCCGAGCAGACAGTTCTTACGGTTATTGCTTCCCAAATCCTTGAAATTTATTACAAATTCAAGAACAATGCGTCCAACTACTCTCCGTTTTACACCGAAGCACTTCCAGCCAGCAAGAAGGCAGGAGATACACAGTTAACAGTGAATTCTGCAACAGGAACAGGAAGTACAACGATGCAGATCGATGAAAAACAAACAATGTCCAATCATCCTCTTCAATTGCAAGTAATGTATCATGTAAAGAAAGCATCACATGTTTTCCTTGATATAGAAACGGAAATGTCCATGAAGAAGTCTCTACAGAAAGTACTAAAGGAAGTTGAAACAGCACTCCCCAACAGTCAACCTGGTTTATTCAATTTCTATCGAGTTACTTATACAATGCTAAGCCATTTTATGCAAGGTGACAACCTATGCACTTTTGAGGAAGAACAAGTCAGAAGTTGGCAAACTGCTCTCGAGCAATGCAAGAGGCGATTTGGAGAGCAGCACGCTAGCACAGCAGACAGCTACTATTACCTTGGAGAAATACAAGTCAAGTCGGGCGACAGTAATTCTGCTCTGCGGTCCCTTCAAAGCGCGCTGGATATCCGATACGTTCTGTTTGGAGAGGAACACCAAAGCACAGCAGACAGCCACCATTTACTCGGGTTCACACAACATAAGCTCGGTGACTTCAATTCTGCTCTACAGTCTACACAGCGCGCACTGGATATCCGGCGTAATCTGTTTGGAGAAGAAAATCAAAGCACAGCAGAAAGCTACCATTTACTCGGGGTCACACAGAATAAGCTCGGTGACTTGAATTCTGCTCTACATTCTCTACAGCGTGCATTGGATATCCGACGTTCTTTGTTTGGAGAGGAACACCTTAGCACAGAAGAAAGCTACGTTTCAATCGGGGTCACACAACATAAGCTGGGCGACTTCAATTCTGCTCTGCAGTCTACACAGCGTGCACTAGATATCCGGTGCAATCTGTTTGGAGAAGTAAACCAAAGCACAGCAGACAGCTACCATTTACTCGGGGTCACACAGCATCAGCACGGTGACTTCAATTCTGCTCTACAGTCTATACAGCGTGCATTGAATATCCGACGTTCTCTGCATGGAGAAGAAAACCAAAGCACAGCAGACAGCTACCATTCACTCGGGCTCACACAACATAAGCTAGGTGACTTCAGTTCTGCTCTACAGTCTAAACAGCGCGCACTGGATATCCGACGTTCTCTAATTGGAGAAGAAAACCAAAGCACCGCAGACAGCTACCATTCACTCGGAGTCACCCAACATGAGCTGGGTGACTTCAACTCTGCTCTGCAGTCTATACAGCGTGCACTTGATATCCGGCGCAATCTGTTTGGAGAGGAACACCATAGCACAGCAGACAGCTATGATTCACTCTGGTTTACGCAACATGACCAAGGTGACTTCAATTCTGCCCTTCAGTCTACACAGCGTGCACTGGATATCAAGCGCAATCTGTTTGGAGAGGAACACCATAGCACAGCAGTCAGCCAGCTTTTACTAGGGGTCACACAACATTATCTGGGTGACTTCAATTCTGCTGTACAGTCTATACAGCGTGCAGTGGATATCCAGCATTCTCTGTTTGGAGAAGAAACCCAAAGCACAGCAGACAGCTATAATATACTTGGGGTAACACAACATGAGCTGGGTGACTTCACTTCTTCCCTTCAGTCTAAACAGCGTGCTCTGGATATCCGCCGCACTCTGTTTGGAGAGGTAAACCAAAGCACAGCAGACAGCTACGATTCACTCCGGGTCACACAACATGAGATGGGTGACTTCAGATCTGCTCTAGAGTCTACACAACGTGCACTGGATATTCGGCGCACTCTGTTTGGAGAGGAACACCAAAGTACAGCAGACAGCTACCATTCACTCGGGGAAACACAACATGAGCTGGGTGACTTCAATTTTGCTCTGCAGTCTACACAGCGTGCACTGGATATCCGGCGCACTTTGTTTGGAGAGGAACACCAAAGTACAGCAGACAGCTACCATTCACTCGGGGAAACACAACATGAGCTGGGTGACTTCAATTCTGCTCTGCAGTCTAGACAGCGTGCACTGGATATCCGACGCACCCTGTTTGGAGAGGAAAACCATAGCACAGCATACAGCTACGATTTACTTGGATTTACACAACATAAGCTGGGTGACTTCAGTTCTGCTCTACAGTCTAAACAGCGTGCACTGGATATCCGGCTCACTCTGTTTGGAGAGGACCACCAAAGTACAGCAAACAGCTACGATTTACTGTGGCTCACACAACATGAGCTGGGTGACTTCAGTTCAGCTCTGCAGTCTGCTCAACGTGCACTGGATATCCGGCGCACTCTGTTTGGAGAGGAACACCAAAGCACAGCATCCAACTACGATTCACTCGGGGTCACACA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Transcript

ANN20443-RA

Protein

ANN20443-RA

MSEAAKNVGNTLEDDVDVFSDANVESKRKFNAISDGPPQLLKNPPPISDMQTIIKHPNDVHLPVDILLLTVKDHEFSSCYMYMDSTYKCWFDGLGYVYFGCIGDNQEKVQVALIKCYEGSSGPGGSLITAKNAGPLLRPKAIISVGTCRGLDRGKTKLGDVVVSAKLTTYASKIVTDNQEQSTGMRSYVSKRFLDVIRDLSHGWKAPLENPEEREVELYCNGEFLSGPEEVSAEWRCKQLFEAHPLATAIETEGEVTDSTNGKTRGGAAFDDQVEWLIVKGISNFADGNESTTDDWNPFASVMAASVVAKLLNDSAVFKRWPRPHYQDSKPRIEKSAVPPMVPNFTGRKGECDEIVSYLTSQSTRMVLIWGSPGFGKTSVANAVGHELYSQGLPVCWLTLRGLKSKTDLASKLLSFVRRPPTNNLPSDKHLSLDDELCQLFSDISDPCVFILDNADDLLESGGPQVKEEVIGLLKEILSRSAQVKFLITTRGSFEFMNLDFQGHMEVRIRPLDEASSQYFVRELLPNASSLEVRRIAKICGHVPLAIKLLCSSISQDDGVEITQFLHDFMESSTESIAEMLDNQDYPTHLRMQFLFNLSFQRLSALEKKALVSFSILPESFDIDISTAVLDENRFRTNKVLQSLRRKSLLDSNLKHGSFTMHYLIQSFAREKGEVEMKEDLLKSKARFYTFFVSRFETLNEQFLKGNSMSAFLAFFEDKESFIQSLLESCSDTRTANRTFDVLIKAELFLDSVFWYSNEAANFDKVYDSALKAASLQGKDMYHRRLLVSKAFGELTWGARGQSIQLLSEVDKIFSTSSSISSDEKAKYSCYLGLYQLVKGETENGVECLKEALSLMNNSPEQTVLTVIASQILEIYYKFKNNASNYSPFYTEALPASKKAGDTQLTVNSATGTGSTTMQIDEKQTMSNHPLQLQVMYHVKKASHVFLDIETEMSMKKSLQKVLKEVETALPNSQPGLFNFYRVTYTMLSHFMQGDNLCTFEEEQVRSWQTALEQCKRRFGEQHASTADSYYYLGEIQVKSGDSNSALRSLQSALDIRYVLFGEEHQSTADSHHLLGFTQHKLGDFNSALQSTQRALDIRRNLFGEENQSTAESYHLLGVTQNKLGDLNSALHSLQRALDIRRSLFGEEHLSTEESYVSIGVTQHKLGDFNSALQSTQRALDIRCNLFGEVNQSTADSYHLLGVTQHQHGDFNSALQSIQRALNIRRSLHGEENQSTADSYHSLGLTQHKLGDFSSALQSKQRALDIRRSLIGEENQSTADSYHSLGVTQHELGDFNSALQSIQRALDIRRNLFGEEHHSTADSYDSLWFTQHDQGDFNSALQSTQRALDIKRNLFGEEHHSTAVSQLLLGVTQHYLGDFNSAVQSIQRAVDIQHSLFGEETQSTADSYNILGVTQHELGDFTSSLQSKQRALDIRRTLFGEVNQSTADSYDSLRVTQHEMGDFRSALESTQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYHSLGETQHELGDFNFALQSTQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYHSLGETQHELGDFNSALQSRQRALDIRRTLFGEENHSTAYSYDLLGFTQHKLGDFSSALQSKQRALDIRLTLFGEDHQSTANSYDLLWLTQHELGDFSSALQSAQRALDIRRTLFGEEHQSTASNYDSLGVTQHKLGDFNSALQSRQRALDIRRTLFGEENQSTLKSYHLLGVTQHKLADFNSALQSIQRALDIQRTLFGEEHHWTAVSYDLLGFTQHELGDFSSALQSKQRALDIRRTLFGEQHHSTADSYDLLKVTQHELGDFNSALQSTQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYDSLGVKQHELGDFNSALESRQRALDIRRTLFGEEHHSTADSYDLLGFTQHELGDFSSALQSKQRALDIRRTLFGEEHQSTVDSYDSLGVTQHELGDFNSALESKQRALDIRHTLFGEEHQSTADSYDSLGETQHELGDFNSALQSTQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYDSLGVKQHELGDFNSALESRQRALDIRHTLFGEEHHSTADSYDLLGFTQHELGDFSSALQSKQRALDIRRTLFGEEHQSTVDSYDSLGVTQHELGDFNSALQSKQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYDSLGVTQHELGDFNSALQSTQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYDSLGVTQHELGDFNSALQSKQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYDSLGVTQHELGDFNSALQSKQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYDSLGFTQHELGDFNSALQSTQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYDSLGVKQHELGDFNSALESRQRALDIRRTLFGEEHQSTADSYDSLGVTQHELGDFNSALQSTQRALDIRRTLFGE

Uniprot

Uniprot term	Description
A0A1X7TVA9	Death domain-containing ATP nucleosidase OS=Amphimedon queenslandica OX=400682 GN=109585858 PE=1 SV=1

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13374	TPR_10	Tetratricopeptide repeat	Repeat	Interproscan
PF13424	TPR_12	Tetratricopeptide repeat	Repeat	Interproscan
PF13401	AAA_22	AAA domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR019734	Repeat	Tetratricopeptide repeat	Interproscan
IPR011990	Homologous_superfamily	Tetratricopeptide-like helical domain superfamily	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR051787	Family	Effector and Ciliary Development-Associated Protein	Interproscan
IPR035994	Homologous_superfamily	Nucleoside phosphorylase superfamily	Interproscan
IPR003593	Domain	AAA+ ATPase domain	Interproscan
IPR049945	Domain	ORC1/DEAH AAA+ ATPase domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45641	TETRATRICOPEPTIDE REPEAT PROTEIN (AFU_ORTHOLOGUE AFUA_6G03870)	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0003824	Molecular Function	catalytic activity	Interproscan
GO:0009116	Biological Process	nucleoside metabolic process	Interproscan
GO:0016887	Molecular Function	ATP hydrolysis activity	Interproscan