Gene detail

Detailed information of Ahemp_010895-T1 in Acropora hemprichii

Genomic Location: scaffold_36:1892157...1898413
NR annotation: XP_015758872.1, PREDICTED: uncharacterized protein LOC107338152 [Acropora digitifera]

Gene Structure

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Sequence

CDS

Transcript

Ahemp_010895-T1

AAACATTACAGGCCATCTCTTTAGTTACATTTACTTAATTGATATCTACGATATGGAAAGGAAATTTTCCCGGAGCAATTAAAACGATTACTGCTCTTGAAAAACTTGAAAAGTGGTGAATACGAGGCTTAACAATAACGAAAGAACCGACAAAAGTGAAGTGGTTATAGTTTGAAAGACACAGCGCGCAACAGTCGCACACAGGTCACGGAAAAGAGGTTAGGCGGCACTTTTTGAGGTGGCGTCCTTCTGGACTATTCTTAGTTTTAAGATGAAAAGTCCTTGTTGTTCATTTTCACAAAAGGCCGGCATTTCTACAAAGGGTCGCTTCTTTATTTGGCTACCTGTTGGGTCTAATATGACTTCCATGGCTTTTTGACCTTTTCCTTGTCAAGTCTCACCCGTCCTAGCAAGAAATGTTTGGTCAATATATTTACTGTGTTGGTTTCCTTTTTATTTTGAGAGAACTTAACAATTACAAAAAGTGGTGTTTTTCTTAAATATCTTACTCCTACGAGAATTGACATATGCGGATACAGATCGTTTCTTTAAAAGACGAAAGGCTTTGGCGATGGGTTAGCGCTCAAAACACAAATATTTCACTCCTTTTTCCATTTGTGATAATTTGACTTCTAATAACGTAATGGGCAATATTACTGAATGCTGATTGGTCATTGAAGAGGGCAGTTTTTTTTCCTTAATTTGGCTTGCAAAGGGGGCAAAATTACTCGCTTACGATTGGTCCTCAGGTTGCCTAGCAATAGCTTATGACATGGAGAAGTTGTTGCTAAGAAATTTTCCGTAGCAATGGCCTCTTGTTTCGAGATAGTTGACGAGGAATATAGCGCAGAATTAGTCAAGAACGAAAATGGAAACATGAAGAGTAACAAGGAGTAAAGGGTAGAGCATTTTCAAAAAGTGCGCGAATGAAAGAAACTTCCAATCAAATTTAGAAGGATACTAGAGTGATGTCTGCGGTCAAACTTCAGAATTCAGTAATTTTGCCCTTTATGTTATTAACAAGTATTCGTAATGGATCCTTGTAACATTAAGGATTAATATCACTTGTCTTTTCAGAAGTTGCTGAAATTGCCCGAGTCGAGCAGCGCCGAAGGCAATTTCAGAAACCTCTGAAAGCACGCGTGATATCTGCAGTCCTTAATTTTATTCACCCCGATGGGTTTACCTTTACAAATCATCCCATTTGATAAAATCTTTTCTTCGTGTTTCACACCTCAAAAATACTGGCAGCACTACAGTTTCTAAGAAACCTCTTCATTCGTTGTTTTGGTTTTGATTCACAGCGTGGTTTCTTCTGTACTGATTTGTGCTTACGACTTTCATAAATTAAATACTCAGAAACTTACATATCCCTTTGGCTGTTAGCTAAATGCTTTTGAAATCCTTATATGAAAATCCTACACTTATTTTTGAAAACCAACTTTATTTTTTGCGGCACAGCTTGAACGACAAAGAACACTTAGTCTTTATTTTGGTTACTCTTTTTCCGTTAAATCTAGTTTTACAAAGTCAAAAATACTCGCATTCCGCATCTTTTCAACGAAAGCGAATTTTTCACTCTAAGAGTAAACAGTTTGAGAGTCATGATTGCTGGACCATGTGTCCGACTCTGATTCACTGCATTAACGGAGCGGGCCTAGTAACCAAATGCGAAACTAACCACAGTCTACGGGTTCCGAGAAAAATCAAGATGGCGACAACAACAGAAAGTGTTTTTCAGGGCAGTGAACAAAGATGAGGGTACGTACAACCCAGTGGCTAAAAAGTATGAGAAAAAGTTGTTTAGCATCGGCTTTTTCACGTTTGCCGCCGAGCTGTTGACGACAAAGATCAACGAAGTCTTCTGATTCAGAACATGTTTGACTGCTGTTTAACGGGTACCTGTTATTATGAATTATCGAACTTCTATCTCTAGGAAGTTGTATCCAAAGGAAGTTTCTTCGATTATTTAAATTGGTCGCCAACGCGTCTGTCCTCCCAGACCTATACTTTTGCACGGTAAGAGGGATTTTACTGAAGTTTAGTTTTTCGGGAAACGGCAAGTGAAACCAATTATAGATTCGATTAATCACGAAATGTCAGTAAACGAAGTTAATGTTGCTCAAAGTAATTTTATTTTTTTATCCTTGACAGAGCTTTCGGAAATTTTTTATTTATATCGTCAACTGGCCCAATGATTGCCTTATCTATTTAAAAGACTCTTTGGAACGACTTTAGCCTGGAATGTCCCGGGCTGATAAACTTGCGGCCTTCTATATCGCGCCACATGATTTCAGTGAGGAAGGAAATTGGAGTACCCAAAGAAAATCCTTGAGTCAGGTTGACTTCGATCAAAAATTTTAGAAAAACTATCTAAGTTCTCGCGCGCTCATTGGCTAATTTTTATCATCAATGAGAGTACAAGTAGATAAAATTTTAGACACTGCGTCTTTTGCCCTCATTTTAACGCAGCAATTAATCTTGGGGTTTTGTTGTTGCTTGTTTTCGCCCAGGGCTCGTAATTTCCACAACCACTTTGATACAGCTGATGTCAATTTGTCAATCAGCCCTCGTGCAATGATCACAGAGGCGCGATTGATGACACCAATGCTAACCTGACTAAGGCGTACAGAGCAGGCCCCAGTTGTTCAAACGATGGATAGCGCTGTCCAGCGGATAAATCACTATCCAGCGGATAAACACTAGCAAAACCAATTGAGTTATCCAGTGGATTGTGATTTATCCAGTGGATAGCGCTATCCAGCGTTTGAACGACTGGAGCCAGATTATTGCTTTAAACCTTATGCAGCGGGGCTTAACTTTATTACTAGACGTTCTGCTGGGTTCTACAGCCTTTTTCTCAAAATTCCCGAACCTGTTCGGGCCTATGTCGGGTGCCACAGTTCCGTTTATATCTTCACAACGCCAAGATTCTAAGTCATCAAACTTCGCAATCCTCTTGGTTTTTCTTACTTTAAAAACATGTGAAAAGATCTACTTTTCAATACACCGCAGAGGATTGCAGTTTGACAATTCGGAAATTTGCGTTACAAAATCGATTGGCTTAGCTTATAGTTGGAAGGCATGTAAAAAAAAAAATTAAGTGTTGCCATGCCGTTTTTGCTTTGTTTTTTTTTTATTTGAGGGCAATTTCCAATTGTAAAACCCCCAGGGGCTTATATTTGGAAAGGAGCGATTTAACGGATTGTTTTTTTGCGTTTCCAGATTGGGGAACTTATGTTTGGAGAGGTTTGTTTTCGGAATTTATCGGTACTTGACAAACTCAACGCTGCTCTCCTTTTAGATTCATTATCTTGAAAACACATGATCGAACCTTCAGAAAAGAAGTTAGTAAGAAGCAGGAGGCTACGCTGTGATGCAGAACTATTAACAGATGCGAATTCAGATTCGCCCACGTTATCCAGTCTCCAGCAGAGATTTCTACAAGATAAGTGGCGCTTTCTTTGTCGCTATTTATGTGTTCCTGTGGATTTCTAAACCAGAGTACGATAAGGTTTTGACTTGGTCGCGCTATGCAAAGGCAAACAGGCTTGAAAACATGCTGCTGGTAAATATTACCAGTAGATTTATATGGAACAAAACGGAAGGGGAACTGGAAAGAGATGAAATGAAGAGTAATAGAAACTCAGAGTTTGTGAGTAACTGGTGTCGCGAAAGACAGGCAAGACTTGATTGGAAGGCTATACTAGCTTCGTGCGCCGAAGACACAGCGTGGAGTTTGCCAAGAAACCGAGAGAATGCCACTGATCCCAACATGAGCTTCATCTCTTTATGGGACGTACAACCTGTGGGCGAATACAGTCGCTTTAGTATTCAGTCTCAGACAAAGGCTGGGAAGCTTAAAACACAGGGAGGAGATTCTTGGAGGGTGAGGATACGTGGACCATCTTCAATATCTGCGGTTGTCATTGATCACGGGAACGGAACATATGAAGTGTTGTTCCTTGTGATGGAAGCTGGGGTTTACACACTTCATATAACCTTGGATTTTACTTTGTGTGATGGATTCAGGGATCCTCCTTCCGATTGGTTTATTGTTGGAAATGCTCAAGGAAAGTTTCAGAGGCACCTTGAAGTTGACGGAAACAAGGACTACCTTCAAGCACCTCTGTGGGGTGGGAGTCCTGTACAGATAGCGATCCCACCAACAAAAGATGGAAGTGTCTCGCTGTCCAGTATTCCCGATGAACGCCTAAGATTAATCGCGCGCACAGATTGTGGCATCACTTGCAAATTCATTTGGGACGGACGAGGGCGCTGGGTACAGAACACGTGGAAGCCGCATGTTAAAGcaatctcgtacccgaagccctcgggatcggcgctcattcgccgaccgctgaccacgtga

Protein

Uniprot

Uniprot term	Description
P13466	Gelation factor OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=abpC PE=1 SV=1

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00630	Filamin	Filamin/ABP280 repeat	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR017868	Repeat	Filamin/ABP280 repeat-like	Interproscan
IPR014756	Homologous_superfamily	Immunoglobulin E-set	Interproscan
IPR013783	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like fold	Interproscan
IPR001298	Repeat	Filamin/ABP280 repeat	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR16165	NXPE FAMILY MEMBER	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan