Gene detail

Detailed information of CAB4040110.1 in Paramuricea clavata

Genomic Location: pcla8_s030936:3398...5509
NR annotation: CAB4040110.1, Hypothetical predicted protein [Paramuricea clavata]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

Transcript

rna-PACLA_8A058064

TTTTCACTCCTCAATGAGTTATTTTCACGCCGATTTGGGGGTTACAGACTCCTTTATTTTTTTTGAGGagtcatataattataattaatgatTTATTCCAGGAAGCCAGATGTCCTCAAAACAAGATCCCTTTGCAGATTTAGAGTACTTTAACAAAACGGATGCAAAGGATATCACATGGGCTCACGCTGTAAATAGTAAAGCTAAACTTAATGAATTCTTAGAGACGGATATTTTAATGTTTGAAGGCGATGTACTTATGAGATACAACAGGAATGATACAGATCCTATTATGGCACATCCACCTGCAAATGACAGCGACTTAACTTTGCAGATATTTCTCAAGTCTCTCAAGCCAACAAGAAAAGGAATTAAACTGGATTTTAAGACTATAATGGCCGTAGCTCCAGCAATGCTGTTATTAAAGTCAGTTTACGATACAACAGACAAACCATTGTGGTTAAACGCAGACATCTTAAAAGGGCCTGGATCTAACTCAGGATCGAATCCCCCAGTGGATGCTAATGATTTCATCACAACATGTACAAATACGTATCCAGATGCAACTTTATCTCTCGGCTGGACTACTGGATGGTATGAAGGTATTTCAAATGCAGGTTATACTCAAGATATGGTCGATGAAATGGAAAGGATCTGTCGAAATACAACACAAATAATCACATTTCCTATACGTGCGATATATGTGCGACAATCCTGGGTACCGCTCAAATGGCTACTAGATACCAGTTCCCGCTACACACTCACAATTTGGTCTGCTGTTGATGACAATGTTAAAGTCGAGGACTTAGTCTGGTTAACAAAACAGATTGATAAACGACGTCTTTATTTGGATCTGCCACCAGAATTGGATGATGCTTTTCGTAAAGCATTGGCAAGCAAAGGAGTAGTTGTCAGCAGTTTAGGTTCTACAGCAAGTTTAATGTTCGCCTCCTTAGTTTCACTTATTGTCAAATACCAGTTTTaaatattacagtatatgtTGGGAAAATGTGTAGCAAGTCTGATTTGCAATTTGATTAAGGGTTCAAAATTGAAAACACTACAAAATGACCATAACGGATTTCATTGATGGTTGATATATTATTGggataataaatattatattaaatatcacatggttaaataattataaaacttaTCTACATATTAAATAAGCTGATCTACGAAACTGTATAGTTCAATTTAATATGCAGCTCCAGCGAGGGGAGAGCGATGGTTCAAAATACTTGTGGTGTGTTTGGATATTGGTATATGGGATGAATAGTGATTTACCTCTTAAAAGGGTAGGCAGCCCCGCAATATTTGGGAAATAAGCATGCCATAGATTGTGCGTATCGTTATCACTACAATCCATCGCTAAAATTCCTCTGTTTTGACCAGCAAATCGTGCGGATTCTGCAAATACCGTTTTACAAACTTAATGATTTCTTTAGCGTTGATACTTCCTAACAATTTAGGGATATTTTTAGCACTATCCATACTCTCTACACTGGGTAAAAATGCAGCTTCATGATGATCGGTCATTCTGACGATACAGAGTCGTGGGTAATGATATAATGGAGGTATATATTCCAAGTCTGATGAGCCTAAAAAGAGAGATATATACCATATTTTAGTTGCATTTCCTTCAGGTTCTTCCTAGTTTAGAGCTACCTTTCTCTCCATTAAAGTACCCTGACTCTCACATTCAGCACAATCCTTCTGGATACTGAAAGCTTCCCAATTAGCCTCTCGTACTTGTCTAATGTAGCCTCTCTGGTATCACTACATGCTGTCATGATCTATATTTCGAGCTTATTTCTTTGCTCCTTTACCATAAACTGAAGTTGCCGACATTACTTACTGAGTCTTCATACCCTAGTGCCAGTCTCTCTCTTTGCCGTTGATAATTGCTATATGGGTTATACCTAagcatatacatacatacatacatacatacaaaactttatttaacagtgccttttttaactatatatctgggggggggggcaattgccccccagggaaagaatttccccccccccccagtaaagccatttctgcccccgaagtgcgaagcagaattgctcatgattgctgtcagaattgcag

Protein

Uniprot

Uniprot term	Description
Q6UXP7	Protein FAM151B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FAM151B PE=1 SV=2
D3YUE4	Protein FAM151B OS=Mus musculus OX=10090 GN=Fam151b PE=1 SV=1
Q642A7	Protein FAM151A OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Fam151a PE=2 SV=1

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF10223	Menorin	Menorin	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR019356	Family	Menorin	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR21184	MENORIN (DENDRITIC BRANCHING PROTEIN)	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005615	Cellular Component	extracellular space	Interproscan