Gene detail

Detailed information of EGACTEQ4350020811-PA in Actinia equina

Genomic Location: WHPX01000224.1:746664...754415
NR annotation: XP_031551469.1, monocarboxylate transporter 9-like [Actinia tenebrosa]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

EGACTEQ4350020811-PA

ATGACTGGCAGGACATGTCAACAAGTCGATGGTACCCAGCCACGGTATCTAGTtgtggttcatgctacggtacttggttcatgccacggtaccatggttcatgatacggtacttggttcatgccacggtaccttggttcatgctacggtaccatggttcatgctacggtacttggttcatgccacggtacttggttcacgctatggtacttggttcatgccacggtaccctGGTTTatgccacggtacttggttcatgccacggtaccatggttcatgcgaCGGTACTTccgtacttggttcatgccacggtacttggttcatgccacggtaccatggttcatgccagggtaccttggttcatgctacggtacttggttcacgctatggtacttggttcatgccacggtaccatggttcatgcgacggtaccttggttcatgctacggtacttggttcatgccacggtacttggttcacgctatggtgccatggttcatgccacggtacttggttcatgccacggtaccatggttcatgcgacggtaccttggttcatgctacggtacttggttcatgccacggtacttggttcacgctacggtacttggttcatgccacggtaccttggttcatgccacggtaccatggttcatgccacggtaccatggttcatgccacggtaccttggttcatgccacggtaccttggttcatgctacggtacttggttcataccacggtacttggttcacgcTATGGTACCATGGTTCGgaggttcatgccacggtaccttggttcatgccacggtaccatggttcatgccacggtaccttggttcatgccacggtaccatggttcatgccacggtaccatggttcatgcgacggtaccttggttcatgccacggtacctggttcatgccacggtacttggttcacgctatggtacttggttcatgccacggtacttggttcatgcgacggtaccttggttcatgctacggtacttggttcatgccacggtacttggttcacgctatggtaccatggttcatgccacggtacttggttcatgctacggtacttggttcatgctacggtaccttggttcatgctacggtacttggttcatgctacggtacttggttcatgctacggtaccttggttcatgctacggtacttggttcatgccacggtacttggttcatgccacggtaccatggttcatgccacggtaccttggttcatgctacggtacctggttcatgccacggtacttggttcacgcTATGGGttttggttcatgccacgTGCTATGCAGTTGTTATGCCTGTGTTTATGGACCACTTCAAGGAAAGCAGAGAGAAAACTGTGCAGTACTTGGAATTCTAATGTGCATAACAAGTCTTGTTTCCACTTCATTCACTACAAACATCATCCAGGTGTTCTTCTCCTACAGTATTCTCTACGGACTGGGATTGTCGTTACTTTTTAATTCTTGCATAATCgcaacaacaaaatattttcacaagaGACAAGCTATCGCCATTGGCATCGTTTGTAGCGGAGCATACATAGGAGTCTTGTCACTTGGACCTATTGTCCAATTGCTGATAGACTCATATGGCTTCAGGAAAATGTACAGGATCATGGCTGGATCGTTTGTACTACCATTACTTGCTGTTTGCAGCTTTGATCCCAATGTTAAGGACCCATACACCGAAGTCTTGCAAACACAAAAAGGGAACGATGAAAACAAACCTCTCGAGAAAGGATGTGTGATTGTGGTGAAGCTATTGAAAAGACCGGTGTACGTGGTTGCAGCTATTGCTCTCGCTTTACAAGCAATGACTGCATTTGTGTCGTTTGTGCACTTGgttagTTACTGTCTTGAGGTGGGCATTTCAGCACAGAAAGCCTCCAAACTCTTCATAGTGATTGGTGTTTGTTCGGTGGTCAGTGGTATCGTAGCGGGGAGGTTGATGGACAACAAAAGAGTCAATCCCTTCCATGTTAACCAGGCTGGATCTCTAAGCATGGGACTCGCTACAATTCTACTTCAGCTGTCTTCAAGTTATATTctcttcatatttttttctatttttcttggttttggCGTCGGTGTCTTTAATACCACGATCGTCGTACTGCTACTTCGAACCGTCGAACCAAGACTAAGACTGTATTCGTTTCCAATTGGAGAGATGCTGGCAGCTATTGGTAATATCACGGGACCACCCCTCATAGGTTTTATCGCCGACACAACTGGTTCGTACAAACCAGCCTTTTACACCGCTGGAGCCATTTTACTGCtatcattcttccttccttttttacaACATTACTTTAAACCATGGAGGACACCGGAAATGGAAGAACGAGAAGCACAAAACGTAGATTGTGATCGTCAAGATATGCTTGATGTTCAACACAACAATCAAAGTGTTGGTAAGGAAGAAACTGTAGCATTAGAAATGATGCAAtga

Transcript

EGACTEQ4350020811-PA

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07690	MFS_1	Major Facilitator Superfamily	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR036259	Homologous_superfamily	MFS transporter superfamily	Interproscan
IPR050327	Family	Proton-linked Monocarboxylate Transporter	Interproscan
IPR020846	Domain	Major facilitator superfamily domain	Interproscan
IPR011701	Family	Major facilitator superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11360	MONOCARBOXYLATE TRANSPORTER	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0008028	Molecular Function	monocarboxylic acid transmembrane transporter activity	Interproscan
GO:0016021	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0022857	Molecular Function	transmembrane transporter activity	Interproscan
GO:0055085	Biological Process	transmembrane transport	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K14386	SLC5A6, SMVT; solute carrier family 5 (sodium-dependent multivitamin transporter), member 6	-	Transporters	ko02000	deepkoala