Gene detail

Detailed information of ENSDJXP00000023914.1 in Hydractinia echinata

Genomic Location: :...
NR annotation: XP_039262603.1, slit homolog 2 protein-like isoform X4 [Styela clava]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

Transcript

ENSDJXT00000027093

AAGGGATTTGAGTCTACTGATTCTTATATAGGCGATTCTTATAGAGGTGATTCTTTTTATTTATGTGCGAATTCGAAAGAAGAATCAAAAGCGCTTTTCACgagtaattttttattcacttatttatatttttgtagtAGCATTGTCAAACTTTTTGTTTCcgaaagaaaaatattggaAGTTACAAGTGTTGTCATATGATATCATGTGATGGATTAATGTTCTCCCTATAAATCCTTATCTCGAATCTCGTAACAATCAGGGGTTACGTCATCCACAAACATGTTtaaaagGTAAACATGAACATGCAACACAACATCTATGCTTTATTCTTGGTGCTGATTGTAGCTGTTGCACCAATCTGGACCACCTGTCCTGCACAGTGCCAATGTAAAAAAGGCAGTGTTAACTGCCACCGACAAAACCTGACATCAGAAGATTTAAAAGTTCTGGCAGCTAAGTTACCCTTGGACACATATGAGCTAACTTTGTCTGAAAACTTGTTGGAATATTTTCCTGTTGAAAATTTCACGCATTTGACAAAATTGAGTGGGCTCACATTGAGTCAAAACCTTATAAGTGAGTATCCGAAGAATCTGTCTGTATACATGCCATCTCTCGTAAGTATTCtgataaatcaaaataaattgGTTACACTTGAAGCTGATGATCTAATTGGTTATGAAAACATTGAGACACTCGATTTGTACGGAAACAAAATAACGAAGTTACCAGCAGGTTGTTTTAAACGTGCACCAAAACTAAAAGAGCTCTTCTTAGAAAAAAATCAGATCAGTAGTATTTCTAAAGATGCGTTTACCGCGTTGACAGAGTTGGAAACGCTTAGTTTGGAGAACAACGCTCTGAAAGATGTGGAAGTTGGCACCTTCgataaccaaaaaaatatgCGGAAAATTTGGTTGAGTGGAAACGACTTAACAAGAATTCATCCTAACTTGTTTACTTCTTTTTCCTCTATgctttttaaaatgcatttaaataataatagttTGACTACACTGGAGCCTGGTACTTTTAAAAACTTGAAGATAGTCGCACTTGACTTGTCATATAATGGAATAAGCTTGATAAAGAAATCTGTCTTTGAAAAAACAGACGTGTTTAGAACATTAAACCTTGAAAATAACCCAATATCATGTGACTGCCATCTCTAtgaagtttttaaaaacttaaaagctCTCCGCCccagtgtttccgttacgggacaGTGTTTCGCTCCTGAATCTGTGAGAAAGGATTTAATTATGAATGTGGTTGGACCAAACAAGCTGAACTGCTCAGTATGCACTTATAGCCCATGTTTAAATGGTGCCACATGTGTTGTTGTAACCGAAGACTCCTACAACTGTAGCTGTCCATTTGGATTTCGAGGAAAACATTGTGAGGAGAAGATTATGTGCGCAATTAACCTATGCCACAATAATGGAACCTGCAATGTTGTTAACTCTACCACTTATAACTGTAGTTGCCCGCTCGGTTATAATGGTAAAAATTGCGAAAATGAGGTGATGTGTGCTATAAACCCTTGTCTAAACAATAGTACGTGTGTCGTTTTAAATCCGAAGGAGTATAAATGCAGATGCGTTGGTGATTTTGAAGGAAATCATTGTGAGGTTAAAGTAGAAAAGAAGAAGGAGAGTGGCCTTAAAGCTGGTATGATCGCTGCTATTGTATTAATTGTTTTGGCGCTCCTTGCAGTTATCATTGTGGTTGTGGCGTATAGACACAAGCACGCGACTGGTACGGCGGCCGAAAAGAAACCGTTAGCTTCAGCTGTTCGTACCTAACTTGTAAATGCAGCATGAATTGAATGAAAAGcgattttgtgaaaaaaaggaCAGCTGAATATGTCGTGggaaatttgtcaaatttttagAGTGAATTTACTATAAAATGTGTTACTtgaaattttgataaattttacACGTTCGTtaaatttttatgataaaaagATAGCATTAATTTGtagaaaattattaattattttgatgGCTGTATAGggtaaatattttctttttctttatgaACTTGTTTCGTTTGACTATTACAGGAGTTTTATTGACCGCGTCTTTTGCGATAAGCAACATATTGGACGCGATCCTGTGTCGAaatgcaatataaaaaacagaTCAGCATTTTTATCTGACAAAGGAAACAGCATTTATATTTTGCAGTTTTTCAGATAAATTATACTTCACTAGGCGGAAGATTTCGTGCGTTGCAAAATACTCAAAAATTCTGATTGGCTTTCCGAAATTTCCCGCGTTTAAACGTAGAAATTGAttctacttttaaaaaaattggttaGACACCTCGAGTCAACTGTTCGAGTTGTATCGTTTATTGATGGCGtattaaaaattgtatatttttaattattctcTTAGCAGCTGTATTTACGAGCTGTGtgagttatattttttttaattgtaaaataattattgacGTTCGTAAAATGACTTATATTCCATAAATCTTCATTCTTTATACTTCACTGTCTTACTCCATGATTTGTGTCTTTATGGTACACATACAAATAGCGATTTTTATTTAGGCCTGATACGAAATGCAGGTATTGAACGTGTTACCTAGAAAATTTCATCGCTAAGAAAACATGACGATAATATCGCTAGTCAAATTAAAATACATCCTGCTGCGGATATTATTATATTTCGTGGATTGCGTGCAAAAATAACAcgtatataaataaatttttatgaatGACGAAaac

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00008	EGF	EGF-like domain	Domain	Interproscan
PF13855	LRR_8	Leucine rich repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000742	Domain	EGF-like domain	Interproscan
IPR001611	Repeat	Leucine-rich repeat	Interproscan
IPR003591	Repeat	Leucine-rich repeat, typical subtype	Interproscan
IPR032675	Homologous_superfamily	Leucine-rich repeat domain superfamily	Interproscan
IPR050467	Family	Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45842	SYNAPTIC ADHESION-LIKE MOLECULE SALM	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan