Gene detail

Detailed information of ENSNOVP00005040912.1 in Eunicella verrucosa

Genomic Location: :...
NR annotation: CAB4017174.1, E3 ubiquitin- ligase DZIP3 [Paramuricea clavata]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

ENSNOVT00005046396

GTAAACCGCCAGGGTTGACGCTTTATGCTTGTATGCCCAACGTCTAAATGTCTACTCCTCCCTTTTTCTCTCTCTGACTTCTATCAAAAATCGCTTGGCTGTTGACGGACTATATTTCCTGACTAATAACACTGTTCTCCATTTTGTAAATAACATTACCACTTTCCTCATTTATATTTTCAGCTAGACTGCTAACACTCGTTGTATCCTGCACTCTCTGCACTCTCATTATTCTTGAAGCATATAACTGGTCTGTTTCTACGGTCTGAGATGTGTTGCTTCGACTTTTTACGCTTTAAATATCACTTTCTGCAGCTATGTCTACCTTCAGAAAGCAATTCTCACGTTCTTCCAACCATGACTTTTCTTTTCAAATTCACCATCATCCGCTGGTAAATTATTTGTCTCGTTCACAACTAGGCTATCAAAAGCATCGCTAAATTTCAGTAGCGCATCGCTTTACTTGTTCGTAGGTCATTATCTACTTGCTCGTAGGACGAAATAACATGCTGCAAAATTTTCCAGGACGAAGGAGACCTGCGCTTGTTgatttttgcaattttaatgTTTTCGGCCACCTCGGGCTTGATGGccgataaactttatttattctgatTCACGAGCCAACAGTCTGGCAAGAAATCAGATAATATATATGGTTGGCGAAGTCGGCAAACCAAAGACGACACTCATGATTGTAATCGTATTTAtatttaccaagaaagtaaGAAACATAGTacaaataacaacaacaattcGATCTAAAATtgaatacagaaaaaaggagtcgtcacgtatctatgcacgtacaaagctgcactgatgaggcgtaaacgccgaaacatgcatgtatgcagatggtatataatatatatatatatatatgtatcaatgtttttttgacaaTAACATAAGAGCGCTCGATATAGTAGCgacagaaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagaaatgaTCAACAAATAACATCTGTTTTGACAAACATAGAATCGAAGGTCTTATCATCTGTAAGATCACAGCATCAAACGGCTACTGAAACAAAAGGCTGGCGCCATTTTAGACCGATTTAGACGACGAACCTTTAATGCACGACGAACTTTTCATTTTTATATCTAATAAAgaactcctacgcgtgcttgaatatgagcttgtaatcacgtCGTCTTCGTTGACTAACTGTTAAACAGCCATTAATTTCGTGACACGACCAGATCAGCTGTGCTGTGATATTGCTTTAGTCAATTAGTACTATAAATTCTTTATGATTAAGATTAGTACGTTTTGTCTGTTTATCCGGCATGCACCTATCTGGCACCCGCGTTTTCAAGCTCGTAGTACGTCATAACACAGGTCACACATAATATGGCCATACTTATGTAATATAAAACGCAGACACTGCAGACAGACGACAACAAATACGAGACGCTGCTAAAATGGTAAAATCTTCATTTTATTCCTGTTTAAACAAAAGGATATCGATACTTCaggtaatatttatatttctatTGTTTTATTGGTTTGATATTCGACTGATAGACAACTGACCACTGGTCTTTATTGCTGTTTAAAAGACTATACTAATATCAGGTGactctaagtttgatcttgaatTGCGTTAAGTCTTtcttatttctaaattcaaatctatccttaataataatatttcttcTACGCCTCAGTATCTATCTTAATCACTAATCCTTCATGAAACTTCATTCTTACTTTTGCCATAATGTTTTCTTAACTCGCTTCTTATTagtttctttttaaatttgaattttttaccGTTTGTAATATAAACCTCAGataatcatgtatatatagatacacctactatttcatcattatatagggtcatatagctctgatgatgttgcgatgtagcaaggAAACGTTAGCAATAAATTTTACagaaacttgaattgtttgagaATGtgtgcatttaaaatcgcttgctgtgcattaatatgtaatatttacaacatgagcggccgtgttgtatcagatatctgatacaacacggccgcgaaTGTTGTacatgacttgtgaaactctctagtataatggatcttctggcgaagtaattttgaaaatacatcttatataacacgagaaaatcaaagttatagtttatgcaaatcaaccaaaatctgtatcgcatatacggacgccttcacgctgatgatttgaAAATTCCACAAGATTTATTACATGACCTTAAACAtactttcaaatgagacaaactaGATTTTTATTTCCAATGTCCCCTAACAACCGAATGAATGAAGTTGTCATCGCACATTCGCACATCGCCGTAAATCACTTGAAATTCATGATATGCAATTTTCTGGTGAACGAGGGTAATCCTATAGTCGCTTCCAGCCCAGCGACTAATTCGCGAGTTGTTAAAGCTATTGAATTTCGAAGATGATTATTAATAATCCCTTATGCAGATTCGAAGATTTTAAGATCATAAAAATAGAGAAAGTTCAGTGCTTCAACCAACCATGCAGTGCTTCagattttttatgaaaaatattagCCGTCCTGTGTGCACGGCCTTGAATCTCAATGAAAAAACCTCCCACTAGGTTATTATCCTGTATATAAACATCCTCATCCCCATGCCCACATCCGTGTCGCTATACATTTTTCCCGAGGATACAACCCAATGGATATGGTTTACAAAAATGCCAACAAAGTCATCTAAGAAGAGCAACCTCGGTTGGACGTTGGTACAAAACAGGCTTTGGGACCCCGGAAATATTTTAAAGTAGTCTTTTTCGTAGTTTAAAAGGTGAAGCTTACTTTGGCACGTTCAAACATGTGCCACTTTTAGGAATACAAAACCGCTACCCTTCGAATTTTTGCTGCAACAAAGTTTACAACAGTAACAACTATCCAAAAAACCAGGATTGGTTAAAGTGAAAAAGGGGTTTTCTTGTTCATCTTTGCTCGAAGAGAACTTTTGAATGAACACGCCCCAGTCTCTCTAAAATTTCATTTCCCCGCGCAGTTCCCGTGCTAATCTTCAAATTGGCTTCAGCCATTCATTGACCGTGATCATTGAAGTTAGCATTCCAGTCTTTTTTAGTTCACTAGTGTAGGTAGAAACAATCACAGACAGCAGCGGTGTGAAggtattacaactacctgaaaaggtattacaaacacctgagtacataacaacaacaaataaaatacctgaaaaggtattacaactacctgaagaGGTGTTACAACTATCTGAAAAggtattacaactacctgaaaaggtatgacaactacctgaaaattaAGGTATTactacaactacctgaaaaggtatGACAACTATACCTGAAAAGGTATTACAACCATACAGTATATCCGAAAAGGTATtacaactatctgaaaaagtattacaactacctgaaaaggtattacaactacctgaaaagatattacaactacctgaaaagacattacaactacctgaaaaggtattacaactacctgaaaagatattACAGCTACCTGAAAAGGTATTACAAcacctgtccactcattacattcttcgactgtggtacaactattaccaaggatggatcagttatatgcacctaattatattttcggtactttgatatatttttaaaatatctgaagtgaccgtCGTTCTGCTATGCATGTGCAATCAAGAAATAGACTGAtattatgttagagttaaaacccgagaaccgaggcttttagctaaaagccaaggttcgagggttttattgttttaactaacttattatatgaatgacaaggttttctcaagagaaaagtgtgaaatacaattttcatgtgtagaaatgtttggtttttttctaaattgtccttcatgatgggccaggatgcgaagacaatatacagcaaattatatagcggcatcttaagttagaatttcatcggatccagacaaagaaaacctttcttgcattgaaaattaaatatcgtcattaatcagatgtatgcaaatcatgtagtgatcattgcgaaattctCGTAGAAATTTacgagtcgaagagtgcagacttgtaggggaaagcttgtagttttgatattaaaagacattcgagatcgtctttagagttggtttgagcttggcttttgagtgacAGATCGTTAAAGACAAATCTAGCAGCTCTGCGTTGAACCATCTCGATCTTTTTTGATGTTCCTCTTGGTGTAAGGGTTCCAGGCTGTAGAGGCATACTCAAGTTGGGGACGGACAAGACTAGTATACGCTTTTGACTTAACAGCAGCATTACATTCACCAAGGATTCTTCTAAGTAAGCCAAGAGTGCTATTTGCCTTACCACATATGATGTCACAATGTTTGTTCCAGTTCAAGTTGTGGGTTATGGTAATGCCCAGGTATTTGGTAGAAGATACTCTGTTAATGATTTGGTTATTCATCATATAACTATATGTTTCGGGGTCACGTTTATTTGTAATTCCTAGGTGGtagcattttgaaaaattgaaatttagttGCCACTTGTTAGCCCAGTTATTTAGATTGTTCTAATCCTCTTGTAAAGTGACGTGGTCCTGATCGTTATTAATTTCTCTATAAACGTTTCCATCGTCAGCAAACAAGCGAATTtgggatttaatattctcagaGATATCGTTTATATAGAGAAGAAATAATACAGGTGCGAGAATTGTTCCTTGAGGTACTCCGGATATGACAGGTTGAGGGCGGGAGTGAGATCCATTAATCGAGACAACTTGAGAGCGGTTGGAAAGAAAAGCTTTGATCCAGTTAGTAGAAAGTCCTCTAATACCATAATGGTCTAATTTGGACATCAGACGAAGATGAGGGACAGAATCAAAGGCTTTATTGAAGTCTAAGAGAATTGCATCGGTTTGTTTTTTCTGGTTGATACTTTTTGCCCA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Transcript

ENSNOVT00005046396

Protein

ENSNOVP00005040912.1

MQSLVSANPCRGMASVDIQEKANFTRLSRLLVDKGTEALRNTFDGIHSPSNLPVVLTANRLSLLKLKPRVINDSQWDLLYPPSGNPPDSKTFDVTLLTVLFRNICVLPKPKTGWDAMPLDTDRSLQANIVRMRLFRNEVYAHVTSTQVDNATFESLWKKIDQALVELNIPQDDVDELKTCPLAPEEEIYLATLNDWKLQEESLTSHVQSMDRNVTRLTQITEDGIKQQLCQPSLEQVSNDTCPEKGRSKENAEDLLLLLKLSIHTCTQLMKPHCFMGSIDLKDAYFSIPIHRDHQKYLKFCWKNTLYKFTCLPQGLACAPRLFTKLMKPVFATLRERGHISSGYLDDSLLVGYSYGECQSNIVDTTTLLKNLGLYPHEDKSVTTPTQIIQHLGFALNSIDMTVSLTREKIATLTRLAQQVLRQSAMPIRLIAKLIGHMVSCLPGVEFGELFYRQLEIEKSAALKLAKGNFDASMTLSDRAKSDIQWWISDAHLSKKAINHGSIDFTINTDASLQGWGASLEHKTAGGRWSNVEKEHHINYLELKAVFTVAVKSYSAMASVDIQEKANFTRLSRLLVDKGTEALRNTFDGIHPPSNLPAVLTANRISLLKLKPRVINDSQWDLLYPPSGNPPDSKTFDVTLLTVLFRNICGLPKTGWGATPLDTDRSLQANIVRMKLFRNAVYAHVTSTQVDNATFESLWKKITQALIELNIPQNDVDELKTCPLAPEEETYLATLKDWKLQEENLTNYVQSINRKIRSKAKLFLLGTRKWLLKKVDGWFFENECESKILLLTAGPGFGKSVFAAKVCEDFKKKGKLAACHFCDFNDSNLRNPMMMLQSLASQMCENVVGFKEKLLDQLKRPHECLLSILCGGVPINSCFFSSTGLFIVACWKRGNSIIEDWESDSSSLIEKWESDANVSNVDSWDTDSTDSNRRRILSMEEREGFSLKLRFPSIIARKYRWLSLNASEARFPPPVTTVDSFSFSIASEDRSLSLVASEDRFSFPIASEDRSLSLVASDDRFSFPISSEDRFSSSIAWEDRFSFPIASEDRSSSDLPSEGRFSSYIRRRKRFSSSIALLDRSLSLIASEDRFSVPIPSVDSLSSSNASDDPLSSPIASDDRLSSPIVSEDRPSSHPISENLELSAENSFCLWNAITLQRSDDRALPKLNVRQGKVLKSKLCKRCFRPGLEKLSSLKSLEIETQKANFTRLSRLLVDKGTEALRNTFDGIHSPANLPVVLATNRISLLKLKPRVISDYQWDLLYPPSGNPPDSKTFDVTLLTVLFRNICGLPKTGWGAMPLDADRSMQANIVRMRLFRNEVYAHVASTQVDNEETYLATLKDWKLKEENLTNYVQSIDRNVTRLTQITEDGMKQLYQLSLEQVSKDTNPEICRSKVTDEDLLRKLAKHSFKSKIKNKLKFFLPGTREWLLKKVDDWFIGNECDIILLLTAGPGFGKSVFAAKVCADFKKEGKLAACHFCDFNDSNLRDPMMMLQSLASQMCENIVGFKEKLIDQLKRPHEVRNLKDAFGIYLQNPLDGLKVRERYLVVIDGLDESATEDKDEIVNLIADYFPDLPDCIKVLVTSRPEISVAKLKFVERVNIESNDADNNLDLALFLISCLQILPLYVIKMLVEKCEGSFLYAFYTQYELQKRGNLHKMTLNDINEFVPKGLDSIYYAYFKRLEHELKAIMRGNFDVLRVLEMLATSKAPLPLTFVTRALGLAPDCRETKNIIDKVNVTVSCLLYVSADVVTVFHKSVIDWLLANGYQDHEYIVNVRNGYKSLWQVCEQVFEEIKLTVCSRHDLNLTEDVKYALDNGFQHLIACRMTERFFWLIDLAIVHVTLFVYPNDYSLFELWNEALSSAVVMSEELRARISWNVFEGHSAIGQSQMDPSSIYLQSVLTHSPKGYFGDNEKKLAKSLLSNVPRFVEFNYSQPEVIPLEHYRPSCSGTVITAVSVSKDMVMAAVAQYGGIIYVVSLTMLVELWQYSTEYIDISCCTFAPDDSFVLFGKLETALNIAEKREVPFFHRNKQIFTSCAFSSNGKRLVTSNGSTIIMLWDVAGQCLLSLLFAQVPINWCSFSSTGLFIIGNDQSKTRGPISGPWGSDRDDSWVDVAESFCVWNAITWQRCDKRNVHYHKLNAKNGRAFQNELCKRCSLSTLELACKPLVSSEIPYRTWSTGIYNGIECIFGFDEQSLSVVESTHFTTLAIYRHYIHYLFNFSSSSVVKEIGAIKNDLWLYGDAEGLITFRTLAPQTCPTKFLWSSFSPDGSRLATCTSDGYINIWNVNTREVEQRLKSNQSESPYACWWSNEDFLFVLFGFCDRISSLSKYMVDVNLKILISNNEQVSLGSLLDELVSLSEVLDFSEGFLIITCGETKPVKVINVNGVGGPGLVTLPGIEPKMSITVSPGGSFLFGGGIDKYYVWKRNTEEAGVYEAFSNRPGTCYYNHVSCFSDDSKVVVTCESKAAGIFKCGQIEVIQLDTGNHKIVTSCEYDKLFCINTRRLVIAASQQFVDIIDMDSGAPLEHSFQRYLSRRFLMQIKLSPNGTTLALPQINGDMEFLRLTIPSRSLLTSIKENSKKKFEWQAFLSLIKLHESHP

Uniprot

Gene family

Uniprot term	Description
O92815	Gag-Pol polyprotein OS=Walleye dermal sarcoma virus OX=39720 GN=gag-pol PE=1 SV=2

Gene family	Subfamily
Ubiquitin Family	UBD\|Other\|Beta-prp
Ubiquitin Family	E3\|E3 adaptor Cullin RING\|DWD

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00078	RVT_1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)	Domain	Interproscan
PF18738	HEPN_DZIP3	DZIP3/ hRUL138-like HEPN	Domain	Interproscan
PF00400	WD40	WD domain, G-beta repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR019775	Conserved_site	WD40 repeat, conserved site	Interproscan
IPR001680	Repeat	WD40 repeat	Interproscan
IPR000477	Domain	Reverse transcriptase domain	Interproscan
IPR036322	Homologous_superfamily	WD40-repeat-containing domain superfamily	Interproscan
IPR043128	Homologous_superfamily	Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain	Interproscan
IPR043502	Homologous_superfamily	DNA/RNA polymerase superfamily	Interproscan
IPR007111	Domain	NACHT nucleoside triphosphatase	Interproscan
IPR041249	Domain	DZIP3-like HEPN domain	Interproscan
IPR015943	Homologous_superfamily	WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46844	SLR5058 PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan