Gene detail

Detailed information of ENSOJPP00000021155.1 in Anthopleura xanthogrammica

Genomic Location: :...
NR annotation: XP_031555569.1, ankyrin-1-like isoform X7 [Actinia tenebrosa]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

ENSOJPT00000024567

AGTATTGTGCGGGCGTTAATttatgctggtgctgatgtaaaCAAGACTGATGATATTGGagaaactgctttgtttagtACAGTCAGAAATGACAATGAAAGTATTGTGCGGGCGTTAATttatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATATATTTGGCCAAACAGCATTGTTTAGTGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATAATAAAGGCCAAACAGCATTGTTTAGTGCATTCAGAAATGACAATGAAAGTATTTTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATATATTTGGCCAAACAGCATTGTTTAGAGCAGtcgaagaaaacaatgaaaGTATTTTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTAATATATTTGGCCAAACAGCATTGTTTAGAGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCGTTAATtaatgctggtgctgatgtaaaCAAGACTGATGATAATGGAGAAACTGCTTTTTTTAGTACAGTCAGAAATGACAATGAAAGTATTGTGCGGGCGTTAATtaatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATATATTTGGCGAAACAGCATTGTTTAGTGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATAATAAAGGCCAAACAGCATTGTTTAGTGCATTCAGAAATGACAATGAAAGTATTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtaaacaagactgatgataatgaagaaactgctttgtttagAGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtaaacaagactgatgataatggagaaactgctttgtttagtACAGTCAGCAATGACAATGAAGGTATTTTGCGGGCGTTAATtaatgctggtgctgatgtaaaCAAGACTGATCATAATGGAGAAACAGCATTGTTTAGTGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATATATTTGGCCAAACAGCATTGTTTAGAGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCGTTAATtaatgctggtgctgatgtaaacaagactgatgataatgaagaaactgctttgtttagAGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCGTTAagtgatgctggtgctgatgtaaacaagactgatgataatgcagaaactgctttgtttagtGCAGTCAGAAAAGACAATGCAAGTATTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagactgatgataatggagaaactgctttgtttagtGCAGTCAAAAAGgacaatgaaaatattatgcgggcgttaattgatgctggtgccgATGTCAGCAAGACTAATGATAATGGCGAAactgcttttttttccatatcaGGCTGTTTTCCTGTAAGCAGCATTAGTTTATTGATTGATGcaggtgctgatgtcaacctACCTGACAACAAAGGTGAAACTCCATTGTTTTATTTGGTCAGATCTGAGTTTGAGTTTCATGTCAAAGCTTTGGTGGAGAAAGGTAAAGCCTTAATAAATGTGAGAAATCGCTATGGCAGAACGCCCCTATTTTATGCCCTGCAGCGTACACCAAAAGttgcttcttttcttctcgACAATGGTGGAAATCTCTCTTTGAAAGACAATTGCAgtttaagcattttatcattttttatcgAAGAGATGTTGAACAATGATGTTCGTGTCCTTACGAATCGTTTTGATCTGACTGAGCAATTGAATCTGCTTTTTAGAAAAGGTGCTACAGAACAAATTGTAGTAAAAGCACTAATAGATGTA

Transcript

ENSOJPT00000024567

AAAGTATTGTGCGGGCGTTAATttatgctggtgctgatgtaaaCAAGACTGATGATATTGGagaaactgctttgtttagtACAGTCAGAAATGACAATGAAAGTATTGTGCGGGCGTTAATttatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATATATTTGGCCAAACAGCATTGTTTAGTGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATAATAAAGGCCAAACAGCATTGTTTAGTGCATTCAGAAATGACAATGAAAGTATTTTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATATATTTGGCCAAACAGCATTGTTTAGAGCAGtcgaagaaaacaatgaaaGTATTTTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTAATATATTTGGCCAAACAGCATTGTTTAGAGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCGTTAATtaatgctggtgctgatgtaaaCAAGACTGATGATAATGGAGAAACTGCTTTTTTTAGTACAGTCAGAAATGACAATGAAAGTATTGTGCGGGCGTTAATtaatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATATATTTGGCGAAACAGCATTGTTTAGTGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATAATAAAGGCCAAACAGCATTGTTTAGTGCATTCAGAAATGACAATGAAAGTATTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtaaacaagactgatgataatgaagaaactgctttgtttagAGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtaaacaagactgatgataatggagaaactgctttgtttagtACAGTCAGCAATGACAATGAAGGTATTTTGCGGGCGTTAATtaatgctggtgctgatgtaaaCAAGACTGATCATAATGGAGAAACAGCATTGTTTAGTGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagacTGATATATTTGGCCAAACAGCATTGTTTAGAGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCGTTAATtaatgctggtgctgatgtaaacaagactgatgataatgaagaaactgctttgtttagAGCAGtcgaagaaaacaatgaaagtatTGTGCGGGCGTTAagtgatgctggtgctgatgtaaacaagactgatgataatgcagaaactgctttgtttagtGCAGTCAGAAAAGACAATGCAAGTATTGTGCGGGCgttaattgatgctggtgctgatgtcaacaagactgatgataatggagaaactgctttgtttagtGCAGTCAAAAAGgacaatgaaaatattatgcgggcgttaattgatgctggtgccgATGTCAGCAAGACTAATGATAATGGCGAAactgcttttttttccatatcaGGCTGTTTTCCTGTAAGCAGCATTAGTTTATTGATTGATGcaggtgctgatgtcaacctACCTGACAACAAAGGTGAAACTCCATTGTTTTATTTGGTCAGATCTGAGTTTGAGTTTCATGTCAAAGCTTTGGTGGAGAAAGGTAAAGCCTTAATAAATGTGAGAAATCGCTATGGCAGAACGCCCCTATTTTATGCCCTGCAGCGTACACCAAAAGttgcttcttttcttctcgACAATGGTGGAAATCTCTCTTTGAAAGACAATTGCAgtttaagcattttatcattttttatcgAAGAGATGTTGAACAATGATGTTCGTGTCCTTACGAATCGTTTTGATCTGACTGAGCAATTGAATCTGCTTTTTAGAAAAGGTGCTACAGAACAAATTGTAGTAAAAGCACTAATAGATGTACT

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12796	Ank_2	Ankyrin repeats (3 copies)	Repeat	Interproscan
PF13637	Ank_4	Ankyrin repeats (many copies)	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR036770	Homologous_superfamily	Ankyrin repeat-containing domain superfamily	Interproscan
IPR002110	Repeat	Ankyrin repeat	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24178	MOLTING PROTEIN MLT-4	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0030315	Cellular Component	T-tubule	Interproscan
GO:0036371	Biological Process	protein localization to T-tubule	Interproscan
GO:0055117	Biological Process	regulation of cardiac muscle contraction	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K06867	K06867; uncharacterized protein	-	Function unknown	-	deepkoala