Gene detail

Detailed information of ENSQNNP00000010154.1 in Candelabrum cocksii

Genomic Location: :...
NR annotation: XP_047129066.1, focadhesin isoform X1 [Hydra vulgaris]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

ENSQNNT00000010510

ATGCACAAAAAGGAATTAACAACAGAGAACGTCAGTTTGATGTCATCTGCTTTTCTATCATTGTTACCATTCTTCAAACATGTTTTTCAAGAAACTAATGATGGATTATCTTTGCTCAATGTGCTTCTTGATTTATGTGAAATAATTGGCCATTGTTCTAAGCAAAGAGCTACTAAGATTTTTATTCAAGTGGTGGTTTTGTGTAAAACAAGGAATGTTGTGGACAACTCCCaagcaaattttgttttgatttctaaTAAACTCACATCATGGTTTCTGAATCACAGTTATATTGACCGTGAAATGACTGAAGAGTTTATATGGTTGATAATGACAGGGTTATGGAATGAAGTTAAAAGTAACTCACAATCACACTTGCTTTCCAGTTTCATTATTCTCAAACAACTTCTCATTCATCATCGGAATAAAAATATTGGAAAGATATGTTCTGCATTTGCATTCCTTCTAATGAAAGCATTTGATCcattatttttaaaggaaGCACTAATGTCAGTGTATTTGCTGCTTTCTGATAGCCAACTTACTTCTTTGAGTGGTACGGTGTCTGTGTTGGCTTTGCCATTACTGCGGATACTGTATACTTTTCAAGATGATGATCTTCACTGTCTAGCTTCAAATATTTTGCTTAATATTGCACAAATAAACATTGAAGATCATaactgttttcaaaaaacagaAGTGCTTGAATACAGTGAACTATTCATGAtttgttcttcttcttgtGCAACACTAGCATCACTGCTTAGATCCAAAGGTTTCGCTAAAGCATGGCTTAAAGATTTCTCAATCATGATACCAAGCGCTAATTTAGTTGCTGTTCAAACCACTTCTCTGCTGCTCTCTTCATTGATGATTTCTTGCagagaaaataatatttttgaagcATCTTTAGATGTGGTTGAAGAAATTTGCTTAAAATTCCCAACCTTTGTATTGGATTTCCTACCTCTACTCTTTTACTGCTTAAGAAGATCGAAATTTCAAAGCAAATTGAAAATTCTCTACATTATCCCTCACCTTGCCACTGCAAAGgaGCTGACCGGGATCATCCTGAAAGCTATAATGCTGCTTTCAAATAACAACCAGATGCGGCCCTTAAGCATCAACCTTATGACGGTGTTGTGGCAAAAACAGccTCGGACTTTGCCGTATTTGttgaaattattaaacaagAGAATCTCTAAGTCTGAAATTCACATTCAACTTTGGTATGATATCCTACTCTCAAAATTGTTAGCTGTCCAAAAGATCACTATGCAGGGTTCATTGTATGGCAAAGACATGATGGTGTTCCTAAGTGGAGCTTTAGATGAATTAACATCTTTGAAACCGCCTCTTCTTCATCAACATACTGTTTCTCTCTCTTTCTTAATTGAAAGTTTTAAGAATCTATGCTTGAGTGAGATTGTTGCTATAGAAACTCTATGGAAGACTGTGTGTACGAGGTTGCAGGAACATTCACTCACAAGTTTGTGTTCGTTCCTCTCGTGTGCCTTCGAAGCTTCCCCCAACAACACAATTCTTCACAGTGAAGTGACAACATACTTGTGGCATATCGTTGCAGAAGAGAAAGATCCTTCTGTTTTGAATGCGGCTTACATCGCCCTATCGAAGTTCCCGATGGAGTTATTTAAAGTGAAGCATCTACCTGACGTGcttcGTTCCAATGTTATTGAGCAAATGTTCAGGGAAAAGAACAATGATTACGATCCAACAGATGAGCCATGTCCTCGCTTCGCAATCCTTCTGTTACGCAAATACATTCCAAAACAAACCTTGCCagGGTTTCGCACGTTTTTAACAGAAGCGTTGCAGCAAGAGATTTCTTCTCTACCACGTGGTGTCGGGCATTCGGAAAAGGTGGCATCTCAACGACATGTGACATCACAACTTTCTACCGTCTTGCATAGAGAATATGAACAGTCGAATCGCGCAGGTGTTTTGTCCGGTTTAGCAGCCGGCGTTCTATGTTGCTTTGAGAGTAGCGCAGAAAGTGAGCAGCGCGGACTGCAATCAGACGTATACAAAAAGACATTAGATAGCCTCCTGGTTGACTTTTCTCTGGACATCAAGGATTGGAGCCACATCACGATGGCACCAAACCATTGGTGTCGTTTCATGAAGAACATGTTTAATGCGATTTTTGAGGACCGAACTGCTCGTATAAAGgtgcaaaaagaaaagaacgAAATTGGCGATGAAACATTTGTAGTAGAAATGAATGCCAGGGAGTTTTGGGTGAGAGATCAAATCACAAATCAACTGCAAAAAGCTTCAAAGGGTAGTCCGCGTAGTCAAGGCAACTCAGTAATGGCTTTAGCTGGGTTAGTACATGCGGTAGTATCACGTGGGACTACTAACGAATCCGTTAAATGTCAACAATACGTGAGCATGCGCAGTTGGTCGTCAAAAGTTTGTGATACAGTCATGGTGGTGTTGGATGGTAGCTACAAACCGGCTTCGGAGACGTTCAAGTGGTGTCAACAGgTTTCAACTGACGGAACAACTTCTAGTTCTCTCTTAGCTCGATCATATGCTGCACTGTCAATGTGTCAACTTGTTTTGCCGCTGCTTTCTTTCAATGAAAATCGCATTTCTACCTTATTATGGATGGTGCAAAACAGGTGTCCTGGGCAACCAAAATCAGACTCTTCTGATTCTCTGCAGTTCTACTGCTCAGTTGGGCTCGGAATGTTACTATCTCAACTTTACCAAGCGCGATTTCCTGATTTTGTTGGCGAGTGTAAGGATATTCATAATGCGCTAAAAGTACTAGAGGATTTGGCCCTCAATCCCGAGCCATACGGTGGTGCGATGATTGGTCTTGCTAATGCTCTTTCATCTCTCTGGTTATCCGACTTCAACGTAGAGATGAAGTATTGGTCTATGACTCGACAGAAGCTGTTACTAAATTTAGATAATAACTTGCTGGTTGGTGAAACGTGCTTTGCTATTGCTTGTCTAACTGCTACCCAGTATGAGTTGGGAAATCTGAGCACAGGAGAAGTGCTTAGTTTGATTAAGAGGCTTATagaaaaatccaaaaatgtAAAATCGAATGATGTTAGCATTTCGTTAGGCATTTTATCTCACGTTATAAGTCTGACTGAACCAAGTGATGGAACCGTTGTTATCAGTCTGTTTGAAACCTGGCATGATCATCTGGCTAAAGGAGAGATCTCACAGCAATTTGAAGCTGCAAAAGGAATATTTGCTGCTTTTGGTATCCACGAATGGCTATATGTGGGAGATGTACGGAGTATAGTACATCCTTCTTTGAAGAGATGCATATCTACTTCCCACAAGTTGTTCACCAAGTGCAACGATATATTGTTATGCACTTATCTAGCTCGTATGTTTGGAATGGCTTGCTTTAGAGACTACCACAAAACAGTGGCTACTCCCCAAGATTACAATTACTTGAAAGGCGACTACCTTCTTTTTCATGTCTTTCAAGAATTAAAACGCGCTGTAAAATATAAAGATACGAATGAAACTGATGTTGATTGTCTTTTACACGCAATTTCAAATGTGGCGAATTGTTCTCTGCCGCAAGTAAACTGGACACTTGTTCTCAATCCTCTGATGAAAATCGGGTTTTCTAATGAATTCACGAAAACCTGTTTGGTGTTTGCTTTTGCTCATGCAAATTCATCTCCATCGTTGTTGCTGTGGATTTCATCGTTTTTGGAGACTGGAGTTTTTGCTAGACAAACCTCTAACATTCAGAAATACCTTCTTATTTCAACAGTGCAAATACTTCCTAGATTAGTCATAAAGCGTCAAAGGTCTATATTGGAAGAAATTCCAATATATTGTTTCAAAGTAAATGATGATAAATCTACTTTCCTGGCTTGGGTGTTGCAGCAATGGGTGTCCGTTGCAAAGATGACGTCACCGCCGCCAACTGTCTTTCCTTTGCTCCGGAATGTCCTTAAGAAAATGGTGCAGTTAAGTGAACTCACTAAGACCGTTGTAAGTGATGAAAGCCTGTTCGAATTTGCAGAACTTTTCTATTTGCTTTTCAAAGACACTTGGAGGATAGAGTTACTTGAGGTGTGTGAAGGTCAGTTGGTCCAGCGAATTTActtgcaaattttgcaaaGCTTTTCTTCGACCAAAGTCGAGGATGTTCAGTGCGTGTTGGATTTTGAACACCTCCATGaaacCAACATGTCAATTCTGCTTACCaagaacatttgttttgtGCCACCGCGTGAGATGTTTACGAATAATTTGCGAAATTTGCTGAAAactaaatattgtaaaaagAAACACTCTGATGTTTGGTTGGCGTTAATTAAATTGTGCGAAGGAGAATACAGTGATTGTCTAATATCACCTATCTATCAATTAGCGTATTCTTCCATGTTACCCACATCTGAAAACGTTTACTTGTCTACTTAA

Transcript

ENSQNNT00000010510

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AAAAGgtaatgatattttattttgtaaacattattttttatcaaagaacgatttgtt

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF11229	Focadhesin	Focadhesin	Repeat	Interproscan
PF12530	DUF3730	Focadhesin/RST1, DUF3730	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR021392	Domain	Focadhesin, C-terminal domain	Interproscan
IPR045163	Family	Focadhesin/RST1	Interproscan
IPR022542	Domain	Focadhesin/RST, DUF3730	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR16212	FOCADHESIN FAMILY MEMBER	Interproscan

Gene Ontology

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GO:0060147	Biological Process	regulation of post-transcriptional gene silencing	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K24169	THADA, ARMC13; thyroid adenoma-associated protein	-	Domain-containing proteins not elsewhere classified	ko04990	deepkoala