Gene detail

Detailed information of ENSXQXP00000029178.1 in Sanderia malayensis

Genomic Location: not available for this species
NR annotation: no NCBI-NR hit recorded
Species Sanderia malayensis · all data for this species · gene families

Sequence

CDS

ENSXQXT00000032011

ATGGATTCCCAAGAAGGAAGTGAGGTTGATATTTGCAGAGTTTGCAGAGGCGAAGGAAACAATGAAAGGCCACTGTTTCATCCATGCATGTGTACTGGAAGCATCAAGTTTATTCATCAGGAATGTCTTGTGCAATGGCTGAATCACAGCAAGAAGGAGTTTTGTGAGTTGTGCAAGCACAAGTTTGTATTCAAGCCAATTTATTCACCAGACATGCCACGAACATTGCCAACCATGGATTTCCTCAAAGGCCTTGGAAAGAACCTTGCAAAAGCCTTGAAGTATTGGTTTCATTACACTCTCGTGGCTGTAGCTTGGTTGGGAGTGGTTCCTTTAACATCATATCGAGTTTACAGATGCTTCTTTGCTGGGTCAATAAGTTCCTTGCTGACACTTCCTCTGGATATTTTATCAACGAGCAATTTGCTGTCAGACTGCTTAAAaggttgttgtgttgttggcTGCTCAATTTGTGCTTTTATCGTCCTGGTTTGGCTCCGAGAGCAAATTGTTGTTCACGGCGGCCCTGATTGGCTGGAGGCGCCAGCAGAACCGCTCAGACCAATGAATCTTCAAGGAGTCGCCCGGGGATTATTCGGTGGTGTCATGGGAGGCGGGGAGGGGAATGCTCGCAACGGTAACCAAGCCAACGAACACGAggcacaacagcaacaacaacaaggtgCCGCGGGAGAAGAAGATCAGGGGAATGACGACGAGGAAGAAGTTGGCGCAGACGCAGAGCTTCGTGCTAATCAGAACGAGGTTTTCGAGGACGAGGCTGCTGAGAATGATGACGATATTTTTGAGAATGCCGTGGAGAATGATGTTGCAGAGCAAGAATTGCCAGCTCAAGCCGACGACTGGAATCCGGAATGGGACAGAGCGGCAGAAGAACTAACCTGGGAAAGAtttcttggTTTGGATGGCTCTTTGGTGTTCTTGGAGCATGTCTTTTGGATAATTTCTCTCAACACATCGTTCATTCTTGTTTTTGGCTTCTGTCCATTTCACATTGGGCAATTTGCACTTCACGTTTTCTCGATAGAATTTAAAAGTCCAAGGTCAGAGTTTGACAGTCTGTTAACATGCCTCGTTGGATACTTTGCACAGGCTGTCAGTCTTTTGGTCTTACATTCACTTGCTGGGTTATGTAGGTTCAAGAAGCTCAAACGAATCTTGGGTCTATGCTACGTTGTTATAAAGGTTGCACTAATAATGGTAGTTGAAGTTGGCATCTTTCCACTGATCTGCGGATGGTGGATTGATATTTGTTCATTGCCCTTGTTTGCAATGACGTTGAAAGACAGACACGTCAGCTTTCTCTACGCACCAGGAACTGCAACGTTCTTTCATTGGCTGGTTGGAATGCTGTACGTTTTCTACTTTGCATCGTTCGTCATTCTTCTTCGAGAGaTCTTGAGACCAGGTGTACTTTGGTTTCTTCGTAACCTCAATGATCCTGATTTTCACCCGATGCAAGAGATGATTCATTTACCAGTGTACAGGCATGTTCGCCGGTTCGCAGTCTCACTGGTCGTATTTGGAACCGCCATCATGATTAAGCTTTGGCTCCCTGTGCAGCTCATTCGATTCTTGTTCCCGAAATTCCTCCCTTTTAATTACGTATTAACAAGTGATATTCCTGTCAGTGAACTACCCTTGGAGTTGCTTCTTCTGCAAGTTGTCTTACCAGCATTGCTCGAGCAGGCACACACAAGACAGTGGATTAAGAATGTTGTTCGAGTCTGGGTCGTCACGATTGCTTATCTCCTAGACTTTCGCTCGTACCTCCTTGGCGACGTGCCACTGGATGACGTTGACCCAGAGAAAATACATCATCAGATTGGTATAAACGCGAATCATGATCAACAGAGAGGCGGCAATAACGCTGCCCCTGGCGGCCATATTCcagGAGAGGCTGCCCACATCGAACCTCAGCCGTACATTAGACCGAGTAGATTTGCTTTCCGTGTAACACTTCTGTTGGTACTGATGTCTGTATCACTTGTGGCTTCGAGCTTAATCGGTCTAACAGTACCAGtcGCCCTAGGCCGTTACCTGTTGTCGTATTTCCTTGGTGATGCTGATATTCACGAATTGTACACTGCCGCCGCCGGCGTGTACACTCTATGGCTCGTATGCCGAGTCGGTGCTGTGATTGGTTCATGGGCGTCAATGGGGTTTCCCGTGTTCCTGAAGAGGATTCTCAATTGGCTTGCTATTGCATTCAGACTGATATTCACATCCGTTGTTTTATTTGGTGTCATACCGCTTCTACTCGGAGTGATATTCGAATTGGTATTCATAATCCCACTCAGGGTACCACTGGATCAAACGCCACTGTTCTTCCTTTGGCAGGACTGGGCCCTTGGCGTTCTGCACACAAAAATAATCTGCGCTCTTGTCATGGTCGGTCCCAACTGGTGGCTCAAAACCGCCATGGAACAGGTCTACCAAGATGGCGTACAGAACATTCAAATATTTTACGTGCTTAACAAACTGGCCTATCCCGCAGTGGCATCATTGCTTTCAGTGATTGTTGTTCCATATATCCTTACGAACGGACTATTGCCTCTACTTGGTGCAGGTCCAGAGCGTCAGCTGCTCGTTTACCGGCGAATATATCCATTTATTCTGATTGTCTTCGTGATTACTACTACTGTCGTGTTTCAAGGTCGACAGCTTCATAACCTGTACGAGAGgatcaaaaatgaaaaATATTTAGTTGGTCAGCGACTCGTGAATTACTACTACCCATCTGCAAAGACTGTTAAATCTAATGACTCTAATAAAGACAATGTAGACCAGTTAATACAATAA

Transcript

ENSXQXT00000032011

ATCAATCCACTGTAAACTTTTGTTCCCCAATGGAACAGGGTGTTCAATAGTTCCAATGATTTTGTGCCTTCGTTTTCCGCAGTGCATCTGATTTTTCCTCCGCAGCTACCATGGAATGTGCGAATGCGAAAGAGAAAGCGAGAAACTTTTTATCTGATTCAGAACACTATGGCCTAAATCTATAACTTGATATACTTTGGTTTAATATACATTTATCTAGCATTTCTTCGACCAGTTTCACTAACAGAAGATTGCTTGAAGCTGTATTTACTAAAATGGATTCCCAAGAAGGAAGTGAGGTTGATATTTGCAGAGTTTGCAGAGGCGAAGGAAACAATGAAAGGCCACTGTTTCATCCATGCATGTGTACTGGAAGCATCAAGTTTATTCATCAGGAATGTCTTGTGCAATGGCTGAATCACAGCAAGAAGGAGTTTTGTGAGTTGTGCAAGCACAAGTTTGTATTCAAGCCAATTTATTCACCAGACATGCCACGAACATTGCCAACCATGGATTTCCTCAAAGGCCTTGGAAAGAACCTTGCAAAAGCCTTGAAGTATTGGTTTCATTACACTCTCGTGGCTGTAGCTTGGTTGGGAGTGGTTCCTTTAACATCATATCGAGTTTACAGATGCTTCTTTGCTGGGTCAATAAGTTCCTTGCTGACACTTCCTCTGGATATTTTATCAACGAGCAATTTGCTGTCAGACTGCTTAAAaggttgttgtgttgttggcTGCTCAATTTGTGCTTTTATCGTCCTGGTTTGGCTCCGAGAGCAAATTGTTGTTCACGGCGGCCCTGATTGGCTGGAGGCGCCAGCAGAACCGCTCAGACCAATGAATCTTCAAGGAGTCGCCCGGGGATTATTCGGTGGTGTCATGGGAGGCGGGGAGGGGAATGCTCGCAACGGTAACCAAGCCAACGAACACGAggcacaacagcaacaacaacaaggtgCCGCGGGAGAAGAAGATCAGGGGAATGACGACGAGGAAGAAGTTGGCGCAGACGCAGAGCTTCGTGCTAATCAGAACGAGGTTTTCGAGGACGAGGCTGCTGAGAATGATGACGATATTTTTGAGAATGCCGTGGAGAATGATGTTGCAGAGCAAGAATTGCCAGCTCAAGCCGACGACTGGAATCCGGAATGGGACAGAGCGGCAGAAGAACTAACCTGGGAAAGAtttcttggTTTGGATGGCTCTTTGGTGTTCTTGGAGCATGTCTTTTGGATAATTTCTCTCAACACATCGTTCATTCTTGTTTTTGGCTTCTGTCCATTTCACATTGGGCAATTTGCACTTCACGTTTTCTCGATAGAATTTAAAAGTCCAAGGTCAGAGTTTGACAGTCTGTTAACATGCCTCGTTGGATACTTTGCACAGGCTGTCAGTCTTTTGGTCTTACATTCACTTGCTGGGTTATGTAGGTTCAAGAAGCTCAAACGAATCTTGGGTCTATGCTACGTTGTTATAAAGGTTGCACTAATAATGGTAGTTGAAGTTGGCATCTTTCCACTGATCTGCGGATGGTGGATTGATATTTGTTCATTGCCCTTGTTTGCAATGACGTTGAAAGACAGACACGTCAGCTTTCTCTACGCACCAGGAACTGCAACGTTCTTTCATTGGCTGGTTGGAATGCTGTACGTTTTCTACTTTGCATCGTTCGTCATTCTTCTTCGAGAGaTCTTGAGACCAGGTGTACTTTGGTTTCTTCGTAACCTCAATGATCCTGATTTTCACCCGATGCAAGAGATGATTCATTTACCAGTGTACAGGCATGTTCGCCGGTTCGCAGTCTCACTGGTCGTATTTGGAACCGCCATCATGATTAAGCTTTGGCTCCCTGTGCAGCTCATTCGATTCTTGTTCCCGAAATTCCTCCCTTTTAATTACGTATTAACAAGTGATATTCCTGTCAGTGAACTACCCTTGGAGTTGCTTCTTCTGCAAGTTGTCTTACCAGCATTGCTCGAGCAGGCACACACAAGACAGTGGATTAAGAATGTTGTTCGAGTCTGGGTCGTCACGATTGCTTATCTCCTAGACTTTCGCTCGTACCTCCTTGGCGACGTGCCACTGGATGACGTTGACCCAGAGAAAATACATCATCAGATTGGTATAAACGCGAATCATGATCAACAGAGAGGCGGCAATAACGCTGCCCCTGGCGGCCATATTCcagGAGAGGCTGCCCACATCGAACCTCAGCCGTACATTAGACCGAGTAGATTTGCTTTCCGTGTAACACTTCTGTTGGTACTGATGTCTGTATCACTTGTGGCTTCGAGCTTAATCGGTCTAACAGTACCAGtcGCCCTAGGCCGTTACCTGTTGTCGTATTTCCTTGGTGATGCTGATATTCACGAATTGTACACTGCCGCCGCCGGCGTGTACACTCTATGGCTCGTATGCCGAGTCGGTGCTGTGATTGGTTCATGGGCGTCAATGGGGTTTCCCGTGTTCCTGAAGAGGATTCTCAATTGGCTTGCTATTGCATTCAGACTGATATTCACATCCGTTGTTTTATTTGGTGTCATACCGCTTCTACTCGGAGTGATATTCGAATTGGTATTCATAATCCCACTCAGGGTACCACTGGATCAAACGCCACTGTTCTTCCTTTGGCAGGACTGGGCCCTTGGCGTTCTGCACACAAAAATAATCTGCGCTCTTGTCATGGTCGGTCCCAACTGGTGGCTCAAAACCGCCATGGAACAGGTCTACCAAGATGGCGTACAGAACATTCAAATATTTTACGTGCTTAACAAACTGGCCTATCCCGCAGTGGCATCATTGCTTTCAGTGATTGTTGTTCCATATATCCTTACGAACGGACTATTGCCTCTACTTGGTGCAGGTCCAGAGCGTCAGCTGCTCGTTTACCGGCGAATATATCCATTTATTCTGATTGTCTTCGTGATTACTACTACTGTCGTGTTTCAAGGTCGACAGCTTCATAACCTGTACGAGAGgatcaaaaatgaaaaATATTTAGTTGGTCAGCGACTCGTGAATTACTACTACCCATCTGCAAAGACTGTTAAATCTAATGACTCTAATAAAGACAATGTAGACCAGTTAATACAATAATGTATTTATTACATAtattttgtttctatttgtACAAATATTATCGCAAAACTCTTGGAGAATAGATCATACCCACGAAATATCTGTTACTATTCCGAAGTTGGATTTTTAGTTAACGATATCCATGCACTAATATGTTACGAAATCACACATGTCTGTAACATGCAGCTAATGTGTGTTCAATAGTGGCCTTGTGGCGGGAAAAGGATATTGCACAAGACCAGGTGTGCTAATTCGATTGCAAGAGTGCGTGTTTCCTTGTCAAATTCTTAGATTCTGGATTCGTATCTTGTTCTGTGCGACTAGTTTCTGTAAAAACGCAATTTATTCCCGGAAAACAACAGAAATTTTTGCATCCACGTGTATGAACATGATTTACGCTTcctttttcttcattattcAAGAATAATTACAATTCAAACTTACAAATAGCTTTCTAAAATGCAATAACATGAAATTACCAAATCAATAAAAAATCCCTTGACACGGAAAAATTAGACAATTTCACGGCtgtcattgttgttatttacaagttcttttttaaattttctatttaaCAGTAAAATTACCAATATTATACAAAAGATTAAAATGCTAACTAAACATGCAATGTATACATTGAAAAGTGTAAAAGATTTAATAAGCAAATGGTGCAGTGCAGCAATAGAATTTTCTTTGCCACAGTCCTCGTGATTTTAGTCATCCTCAGTGAGAGACCCTAGGTCATGTTCTCAAGCGCTGGACGAAGTGAACTTTGTGACTGCTTTTGTTCCTTCGCTCAATGCGTGTTTTGCCAGCTCTCCGGgcaacaacaagcaaattgCAGTTTGAATCTCTCTGGACGAAATCGTCGAC

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12906 all species →	RINGv	RING-variant domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011016 all species →	Domain	Zinc finger, RING-CH-type	Interproscan
IPR013083 all species →	Homologous_superfamily	Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13145 all species →	SSM4 PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0030176 all species →	Cellular Component	obsolete integral component of endoplasmic reticulum membrane	Interproscan
GO:0030433 all species →	Biological Process	obsolete ubiquitin-dependent ERAD pathway	Interproscan
GO:0008270 all species →	Molecular Function	zinc ion binding	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	Pathway	Map ID	Source
K10661	MARCH6, DOA10; E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6	EC:2.3.2.27	Ubiquitin system	ko04121	deepkoala

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.