Gene detail

Detailed information of ENSYDOP00000022475.1 in Millepora dichotoma

Genomic Location: :...
NR annotation: CAH3179268.1, unnamed protein product, partial [Porites lobata]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

ENSYDOT00000023220

ATGTATTCAGTACATGGGTCTGTAGTCTTCCAAGCTGGTGTTCCGTATCCTCAAAATCACAGCATGTTGAACTATTTCTACTGTCAGAACGTGACGCTTCCGCATGGTTACTGGCCCTCACCTTCTCTTATGGTACAAGCAACGGAACCAAGTTTAGCAGTTTGTGAAACTCCGCTAGCTGCATGGGTATCATACTTGAAAGGCAACATGACGACTGTATGTTATGCTGACCAGCGTGGTATAATGGGGGTACGAAAAACCGATGTGGTGATAGACTATATTGTATACGGCGCTCGTGACCAATGCGAGAACGAGAAATGTCCTGAAAACAAAGAATGTATTCACCCAACTTATGATAGTATAGCTTGCGGATGTTCACGAGAATGCGCAGACAATGTAGAATATGCATGTGGAACAAATATGATGACGTATAAGAATAAATGTTATTTGGAGAAAGAAGCATGTGAAAGTGATAATTCCTTTTCGTACGCTCATCCAGGAAAATGTGAAATCATGACCTTCGATCATGGTCGCGTACAGCTAGAATCGGTGGACGGTTGTAGTGGTGTTTACTGCAAAGTGGTTTCTACTAACAACCATGTATGGTACCCACATGCTAAAATTCACGTCCAAATATCTGTCAACTGGATGAATACCATTGAAATGATGGGAAATATTCATGATGCAACATCATCATGGGTCCAAGACGTTACACCTAATTCTTTTAAAGCATGTGTGATGGAGGCTGGAAGAAAAGACCTTGTGCATGCTCCATATATAAACTGGTTCGCCTACCAAGGTCGTATGGAAAAGgtaATGTCTCATCGTATAGAGGTAGGTGAATGGCGATCTGGAACACATTGTGTCCCGTTACACGAACGGATGATGATGGAACGTAGAACAGGCTGGCACCCAAATGTGTGTCCAATGGTTGAGCTGGCAGACAGCGATAAAACAGATGTGAGCAGATGGCAATATGATGCACATTTAATGACTCAGATATATGGACAGCATCATCAAGAATGGTTCAAGAGGATGTTAATGGGATATGGGGTCCAGAGAATGAACTTGACAAGTGGGATGTCTTTGAACAACGTGACATTGATGTTGACAGTCGAACATACAAACCCGTCAAACATGTCACAGACTTACAAAGATGCCGTTAATGTATGGTTGGAGTACGATAATACGACGCAGGAATCGTATGTTTGTTTGCGTGAGATGCAGAACTTCGGAGGTAACCACAAAGGAATTCACGTGCATTGGTCATTATTCAACAGCTCGATCATTCCAAACCTTGGCTTTACTCACTCTGTTTATTTCAAACCACATCGATTTGCGCCCATGTACAATAATTACGCTTTCTGTCAGACCAAAACCTATCTGccttctgattttaatctggtcAATGGTGCTACTGTATTGCTGTCGTTGTACCACAAGATACCATCTCATGCAATGTGGGAATCCATGAGAAAGTATAAACAACGCATGGATGAAGTTAACATGGGTATGAATATGGGAAATATGGAAATGATGAAGGGCGGTTCAGGTGATAGCAAGGTTGTTCAAAGTTGGATGATGCCACACATGTGGAGGGCAAATTTGACAGGATGGAGACCGCATATGAGAATTGCAAAACACACTGACTACAGTGCTTGGATAGAGGGTATGAATAACACACACATTCGTGTTTGCCAAAAATCCCTATTTACTGGATACCACTTTGAGGGTGTGACCGTTTCTATGGTTGTTATACCAGATCGATGCAAACAAGGATATACCTTCACTGAAGACAGATTTTGCACACGTTATGTTAATAAATGTGAAAACCATGAGAATGCATCGAAGGTTTGCAAAGCTGATGGTGCAATGATAGGAGCTCCTACTGATTTAAGAGCGATGTACATCGACGCGTACGCAGTTAGTCAACAACCTATACAAATAGCAGTTAGCGATATGAAGCAAGAAGGGGTTTGGAAACGAGATGCAGgtgaTATGTCCATGCCTGTTTTCCTACGCTGGGCTGCGGGAAATCCAACCACTAATACCGTGAAAAATTGCGTACTCCAAAGAGGACGTCCCATGGATTATACGCACATGGAGGTTTCATGTAACGATTGCATGAATTTCCTCTGTGATAAATATGCACCCCAGTTAAGTTGTGATTTTCCAAGTCACTACTGTAATGGTTGTGGTAAGTGCACACAAATTGTCGCAATGAATTACACGTGCGAATGTATTCCACCGTATACCGGAGATCGTTGCCAGATTAAAGGCTGA

Transcript

ENSYDOT00000023220

catggtttgCCGTGGTTCTCAGAGAGATACTTGGGATTGTTttatatatgccaaactgattgtagtattcactccaaacttaGAATTTTCCCCTTATTCagaagtcatacatggaagtacaacattcaagctaacagaaggataaaaaagcATTGGTACGCCTTAGTATCTGACCCGTTAGAAGATATGTATTCAGTACATGGGTCTGTAGTCTTCCAAGCTGGTGTTCCGTATCCTCAAAATCACAGCATGTTGAACTATTTCTACTGTCAGAACGTGACGCTTCCGCATGGTTACTGGCCCTCACCTTCTCTTATGGTACAAGCAACGGAACCAAGTTTAGCAGTTTGTGAAACTCCGCTAGCTGCATGGGTATCATACTTGAAAGGCAACATGACGACTGTATGTTATGCTGACCAGCGTGGTATAATGGGGGTACGAAAAACCGATGTGGTGATAGACTATATTGTATACGGCGCTCGTGACCAATGCGAGAACGAGAAATGTCCTGAAAACAAAGAATGTATTCACCCAACTTATGATAGTATAGCTTGCGGATGTTCACGAGAATGCGCAGACAATGTAGAATATGCATGTGGAACAAATATGATGACGTATAAGAATAAATGTTATTTGGAGAAAGAAGCATGTGAAAGTGATAATTCCTTTTCGTACGCTCATCCAGGAAAATGTGAAATCATGACCTTCGATCATGGTCGCGTACAGCTAGAATCGGTGGACGGTTGTAGTGGTGTTTACTGCAAAGTGGTTTCTACTAACAACCATGTATGGTACCCACATGCTAAAATTCACGTCCAAATATCTGTCAACTGGATGAATACCATTGAAATGATGGGAAATATTCATGATGCAACATCATCATGGGTCCAAGACGTTACACCTAATTCTTTTAAAGCATGTGTGATGGAGGCTGGAAGAAAAGACCTTGTGCATGCTCCATATATAAACTGGTTCGCCTACCAAGGTCGTATGGAAAAGgtaATGTCTCATCGTATAGAGGTAGGTGAATGGCGATCTGGAACACATTGTGTCCCGTTACACGAACGGATGATGATGGAACGTAGAACAGGCTGGCACCCAAATGTGTGTCCAATGGTTGAGCTGGCAGACAGCGATAAAACAGATGTGAGCAGATGGCAATATGATGCACATTTAATGACTCAGATATATGGACAGCATCATCAAGAATGGTTCAAGAGGATGTTAATGGGATATGGGGTCCAGAGAATGAACTTGACAAGTGGGATGTCTTTGAACAACGTGACATTGATGTTGACAGTCGAACATACAAACCCGTCAAACATGTCACAGACTTACAAAGATGCCGTTAATGTATGGTTGGAGTACGATAATACGACGCAGGAATCGTATGTTTGTTTGCGTGAGATGCAGAACTTCGGAGGTAACCACAAAGGAATTCACGTGCATTGGTCATTATTCAACAGCTCGATCATTCCAAACCTTGGCTTTACTCACTCTGTTTATTTCAAACCACATCGATTTGCGCCCATGTACAATAATTACGCTTTCTGTCAGACCAAAACCTATCTGccttctgattttaatctggtcAATGGTGCTACTGTATTGCTGTCGTTGTACCACAAGATACCATCTCATGCAATGTGGGAATCCATGAGAAAGTATAAACAACGCATGGATGAAGTTAACATGGGTATGAATATGGGAAATATGGAAATGATGAAGGGCGGTTCAGGTGATAGCAAGGTTGTTCAAAGTTGGATGATGCCACACATGTGGAGGGCAAATTTGACAGGATGGAGACCGCATATGAGAATTGCAAAACACACTGACTACAGTGCTTGGATAGAGGGTATGAATAACACACACATTCGTGTTTGCCAAAAATCCCTATTTACTGGATACCACTTTGAGGGTGTGACCGTTTCTATGGTTGTTATACCAGATCGATGCAAACAAGGATATACCTTCACTGAAGACAGATTTTGCACACGTTATGTTAATAAATGTGAAAACCATGAGAATGCATCGAAGGTTTGCAAAGCTGATGGTGCAATGATAGGAGCTCCTACTGATTTAAGAGCGATGTACATCGACGCGTACGCAGTTAGTCAACAACCTATACAAATAGCAGTTAGCGATATGAAGCAAGAAGGGGTTTGGAAACGAGATGCAGgtgaTATGTCCATGCCTGTTTTCCTACGCTGGGCTGCGGGAAATCCAACCACTAATACCGTGAAAAATTGCGTACTCCAAAGAGGACGTCCCATGGATTATACGCACATGGAGGTTTCATGTAACGATTGCATGAATTTCCTCTGTGATAAATATGCACCCCAGTTAAGTTGTGATTTTCCAAGTCACTACTGTAATGGTTGTGGTAAGTGCACACAAATTGTCGCAATGAATTACACGTGCGAATGTATTCCACCGTATACCGGAGATCGTTGCCAGATTAAAGGCTGAAGCAAG

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
--	--	--	--	--

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002350	Domain	Kazal domain	Interproscan
IPR000742	Domain	EGF-like domain	Interproscan
IPR036058	Homologous_superfamily	Kazal domain superfamily	Interproscan
IPR016186	Homologous_superfamily	C-type lectin-like/link domain superfamily	Interproscan
IPR016187	Homologous_superfamily	C-type lectin fold	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13866	SPARC OSTEONECTIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005509	Molecular Function	calcium ion binding	Interproscan
GO:0005518	Molecular Function	collagen binding	Interproscan
GO:0005615	Cellular Component	extracellular space	Interproscan
GO:0048856	Biological Process	anatomical structure development	Interproscan
GO:0050840	Molecular Function	extracellular matrix binding	Interproscan