Gene detail

Detailed information of EVM0010285.1 in Myxobolus honghuensis

Genomic Location: Contig00664:778550...805569
NR annotation: KAF0992372.1, hypothetical protein HZS_762 [Henneguya salminicola]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

EVM0010285.1

ATGTGCGCTTGCGTTATTTGTCGCACTCAAAGTCGGGAATCCTTTTTGGATTCAAAAACTGAATTCGCAACTGGTGGATGCAATATTGGATCAAGCACAGTCTCCTGGAGTGAAACCGATATTGTAGCATACGGCAGCGGTCCTTATATTCTCATTCTCAAACTAAACCACAATGATGAATTAATTTACGATTCCTCTATCTACGACGGTTCAGAAATTAATTTTGTCAATTTCGTCAAAATCTGCAACACAGAAATCCTAATAACCTGTAATATCGAAAATGAGGTAAAATTCTACAAAAAAACAACAAAAATAGATTTATTTTACAGTTTGAAGATTTCTAATAAGTTTATTCCTAATATATGTATATACAAAGAATATGTCTTAATTTTTACCCAAAATGACTCTATTTTTATGTATATTGTCAAAAATATTCTCTCCTTGCCTGAGTTGAAAATATTTAATCTCTTCGAATTAGGAGACGAAGTTGTCCGATCTATTTGTATTTTCGACATCCTTGATAATCTACATATAGCATTTGGCGGTACCACTGGATTACTTAATATAATTCAAATTGACAATGAAAAACTCAAAAATTATTTATTTATACATTCTAAAAATGGAAATTCTGAAAATATTGAAATTTCAGAATGTTTAGCCTTGAAATTCCTCAAAATTAAAGCTCACAGTGATTGGATTAATTCTATATCCGCTTATAAAATCGGTCATGATCGTAAATGTTCGAATAACCTCATTCCTGGGAGTACTGTTACAGATTTGGTTTTTCTCGCTACAGCTAGTCAAGATCATAATATTTTTATCTGGAAAATCGAAGCCTCTGAATATCACCCCAAAAGTAAATTATTTCAATCCTTAAAAAAACATTTTTTGACGATAACTAATGGTTTGGATCAGCTGAAATTTTATATCACAAAAGATTCTGTCCTTTTAGCCCATAATTTTGCAGTAACTAATCTTAAATGGCTTACAAATGAAACTTTTGAAGATTTCCCGCGGTTAGCCTCTGTTGGGATGGACGATATTTTGATTATCTGGGAATTTGATAAAATTAATAATATTTGGAACGATCAAATATGTGTTGGAAGCTTAAATGAGATAAAATATGGCTATTTGGGGTTTCATTCGATTCCCGCTTCTTTCACAGAACGACATGTGGTTTCAGGAAATTCAGATTCAGTAACGGATATATTCGTTCATGAATTAAATTGCGATTTTTTTGGAATTTATGATCATGCGAAGAAAATTCTGATTATCGCGACCGCTAGTTTAGACATGTCTATATGGACTGAAATTGCGCGTCCTTTTCTTCATGGGCATCCGCTTACTTCTCTTTGTTTACTTAATAACGGATTAATGGTGTCGACAGCTACCGAAAAGCCCATTCGAATCCATCAAGCGACGAAAAATTATTTCAGAAGTTTAAAAAAGTTTGATTTAATAAATTCTTATAATGATGAATTTAAAAAACTTTCTGAATACGGTGTTATTCAGACCTTGAATTTAACGCAAATTTCATGTTTAGAAAAAACAGGATGCGAAGAAATGGATATTTTTAAGAACGAAGATTTATTTACAGAAACATTTTTAAAGAAATATTCTCTCTGGGTTGAAAAGAATTTATTGTACGGTCATGGAAATGATGCATGCGAAAAAACCGAAGATGCCTATATAGCTTTATGGGATCTTAAATCGTTCAAAATAGCGGATAAACTTTTCGGGCATCGTTTAAAGGTAGTCCAAATGCAATTCACGATAAATAATGTATATTTATGCTCGATTTCTCTCGATAGATCCTTTATTATCTTTAAAAACGAATCCTCAGATTCCCAAATATCGTTTGTGAAGCATTTCCATGGTGAAGGCTTCGTTCAACGAGTTTATAAATCCTTAACATTAACGGGTGATGATAATTTTATGGCGACAGCGTCTAGGGATAAGAAAATCATGATTTTTAATCTAAATAATATTGGCGCGAATTTTAAACCTCTTATTGCGCATTCTTGTGATTCTGAACCGATTTCTATTTGTTTTTGTTATAATTTTTCTTCTGAAAATATTACTGGTTATATTTTCTGTTTATCTTTCGTGAATTCTAGATATTTCGTATTCGTCCACGGAAGAAAATGTCTAGTAGATCAAAATCTTACTCTTGTTTGGCAAATAAGACAATCAGGATTTTGTTTCCGCCGAAGATTACATATTAAAAGTCACGGTTCATCACCAGAAACTGACCTTCGACCTTTTTCTAGAGAAGACCAAGATATAATAATTCAGAACATCAATCAGAGTGAATTAATTATGGTACATTGGAAAAAAGATGGTATTTATAATCAGGTCAACCAATTGATAACAATCCCATCTTCAGAAAACCAATCAAACGCAAATATTATCTATCAATCTATTTGTTCCAATTTGAGAATAATCGAATGTCAACCTTTTGAATATAGCCTTCATTACACGGATTTAGAGAAGAGTTGTTCTCTTTCTCCACTTCTCAAAGCTGAAAGAACCCCACTACTAGGAAGACTTTATACTTACATTAAAAATTTTAACCAAACTTCGGGATCAAACCTCACTGTAAGATATTCCTGGGTGGTTGAAGAATACTTTGTTTCCGATTTTCTCAGAAGTCCTTCTTTTTTCATATCCAACGTAATAGCAGAAGGGCCGGTTTCTATTCAATATGAGAATCAATTTGTTAAATTTTACATTGATGAATCTCCACAAGTCAATAATTTTCGATTTTCTAATAATAGCGTTTTTGAAGTGATATTTGAACCAAATGATACAGAATCAAAAAATGTAACTAATGAAACGATGGATATTGTATATTATGGAAACAATAATATTCCTTGTTGCGAAGAATTGGGTTATATGGAGGTTTTTCTTTCTTCTCATAACGGAACAAGAACCCTTTTTGCTTTGAAGCAGGAAGCTGTAGTTCTAGGTAATATCGCCCATCTTTGGACTGTAAATTTTGAATTCCCTGTTAACACCAAACAGACGATTTTATCCATTTATATTTCTGTTTTAGACAGTGCATCAAAACCCACTAAATTTAAGAGATTTTTAGCACTGAATAGTTTGATCTTAAAACTGAGATTGATAGAATTAAGTGGAAAATCAAACGGACATAATGTTCTCATACGAAAAACGCCGGAAGTTAAAAGTGAGTCTAATTTATCAATGGTTATATTTTATTATCAGCGAAATGTTAAAATAACTGCTTGCCAGCTTTCTTCTAAAATAAAATCATGTTATCACAAGGAATTTAAAATTGCATATCTTGGAGTAGCCTACATGAACACTACATTCATTAATGTTGTCATATTGTTTGAAGCCAAAATTCAAACACATTTTGAAAAAGATGAAATGATCTGTAAAAAGTATACGATTTTACAAAAATACACTGTTGTTAATTCTTTTGTTGGCTATCTCGAAGTCGACGAGGTAAAATTTGGCTATATTTCAGTAGATATTTCTCACGGTTCATCACCAGAGACTGACCTTCGACCTTTTTCTAGAAAAGGCCAAGATTTAATAATTCAGAACATCAATCAGAGTGAATTAATTATGGTACATTGGAGTAAAAGTGGTATTTACAGTCATGTCAACCGATTGATAACAATCCCATCTTCAAAATACCAATCAAACGTAGATATTATCTATCAATCTATTTGTGCCAAGTTAAGAATAATCGAATGTCAACCCTTTGAATCTAGTCTTAATTACACAGATTTTAACAAAAGTTGTTCTCTTTCTGCACTTCTTAAAGCTGAAAGAACCCCACTACTAGGAAGGCTTTATATTTACATTAAAAATTTTAACCAAACTTCGGAATCAAAGCTCACTGTAAGATATTCCTGGGTTGTTGAAGAATACTTAATTTCAGATTACTGGCCAAGTCCTTCTTTTTTCATATCCAATGTAATAACTGAGGGATATGACAATCTAACTTCTGAATTTTCACTGACTAAATCTCAATTAGTCAAAAATTTTCAACTTTTTTATAATAGCGATTTAGAAGTAATATTTGAACCAAATGATATAGAATCAAACAATGTATCTAACGAAAAGATGGATATCGTATATTTCGGTAGTAATATTATTCCTTGTTGCCAAGAATTGGGCTATATGGAGGTTTTTCTTTCTTCTCATAACGGAACAAGAATTCTGTTTACCTCGAAGCAGGAAGCTGTAGTTCTAGGTAATTTCGCGCATATATGGACTGTAAATTTTAAAATTCCTGTTAACACCAAACAGACAATTTTATCGATTTATATTACTGTTTTGGACAGTGTATCAAAACCCACTAAATTTAAGAGATTTTTAGCACTGAATACTTTGACTCTTAAATTGAAGTCGATAGAATTCCATGGAAAATTTAATGGACATAATGTTATCATAAGAAATGCGCGGGAAGTCAAAAGCGGTCATAATTTATCAATGCATGATGTTAACATCACGGCTTGCCATGTTTCTTCGAAAATAAAGTCTTGTTATCACAGTGAATTTAAAATTGTTTATCCTGGAATAGCCTATATGAATACAACATCCTCAAATAAATATTTATTAAATGCTGGAGACCAAAATTTCAAAAAAACTGACAAGCCATAG

Transcript

EVM0010285.1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
Ubiquitin Family	UBD\|Other\|Beta-prp
Ubiquitin Family	E3\|E3 adaptor Cullin RING\|DWD

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
--	--	--	--	--

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR015943	Homologous_superfamily	WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily	Interproscan
IPR037289	Family	Elongator complex protein 2	Interproscan
IPR001680	Repeat	WD40 repeat	Interproscan
IPR036322	Homologous_superfamily	WD40-repeat-containing domain superfamily	Interproscan
IPR011047	Homologous_superfamily	Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR44111	ELONGATOR COMPLEX PROTEIN 2	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0002098	Biological Process	tRNA wobble uridine modification	Interproscan
GO:0033588	Cellular Component	elongator holoenzyme complex	Interproscan