Gene detail

Detailed information of FUN_001190-T2 in Acropora pulchra

Genomic Location: ntLink_6:9607153...9632884
NR annotation: XP_029190700.2, protein transport protein Sec31A-like isoform X2 [Acropora millepora]
Species abbreviation APULC · all data for this species · gene families

Gene Structure

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Sequence

CDS

FUN_001190-T2

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Transcript

FUN_001190-T2

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Protein

UniProt (Swiss-Prot top hit)

UniProt accession	Description
Q5F3X8	Protein transport protein Sec31A OS=Gallus gallus OX=9031 GN=SEC31A PE=2 SV=1
O94979	Protein transport protein Sec31A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SEC31A PE=1 SV=3
Q9Z2Q1	Protein transport protein Sec31A OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Sec31a PE=1 SV=2

Gene family

Family type	Membership / link
Orthogroup (gene family)	OG0003500 (this species only)

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12931 all species →	Sec16_C	Sec23-binding domain of Sec16	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR040251 all species →	Family	Protein transport protein SEC31-like	Interproscan
IPR024298 all species →	Domain	Ancestral coatomer element 1, Sec16/Sec31	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13923 all species →	SEC31-RELATED PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0005198 all species →	Molecular Function	structural molecule activity	Interproscan
GO:0006886 all species →	Biological Process	intracellular protein transport	Interproscan
GO:0006888 all species →	Biological Process	endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport	Interproscan
GO:0007029 all species →	Biological Process	endoplasmic reticulum organization	Interproscan
GO:0030127 all species →	Cellular Component	COPII vesicle coat	Interproscan
GO:0070971 all species →	Cellular Component	endoplasmic reticulum exit site	Interproscan
GO:0090110 all species →	Biological Process	COPII-coated vesicle cargo loading	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

No KEGG orthology assignment for FUN_001190-T2.

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.