Gene detail

Detailed information of HK74SY85_g14241 in Paraphelliactis xishaensis sp. nov.

Genomic Location: ctg121:171373...174853
NR annotation: XP_020899109.1, ribosome biogenesis protein TSR3 homolog [Exaiptasia diaphana]

Gene Structure

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Sequence

CDS

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HK74SY85_g14241

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Protein

Uniprot

Uniprot term	Description
Q5HZH2	18S rRNA aminocarboxypropyltransferase OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tsr3 PE=1 SV=1
Q9UJK0	18S rRNA aminocarboxypropyltransferase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TSR3 PE=1 SV=1
O26654	16S rRNA aminocarboxypropyltransferase OS=Methanothermobacter thermautotrophicus (strain ATCC 29096 / DSM 1053 / JCM 10044 / NBRC 100330 / Delta H) OX=187420 GN=MTH_554 PE=3 SV=2

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04034	Ribo_biogen_C	Ribosome biogenesis protein, C-terminal	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR022968	Family	16S/18S rRNA aminocarboxypropyltransferase Tsr3	Interproscan
IPR007177	Domain	16S/18S rRNA aminocarboxypropyltransferase Tsr3, C-terminal	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR20426	RIBOSOME BIOGENESIS PROTEIN TSR3 HOMOLOG	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0006364	Biological Process	rRNA processing	Interproscan
GO:0016740	Molecular Function	transferase activity	Interproscan
GO:0030490	Biological Process	maturation of SSU-rRNA	Interproscan
GO:0106388	Molecular Function	18S rRNA aminocarboxypropyltransferase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K09140	TSR3; rRNA small subunit aminocarboxypropyltransferase	EC:2.5.1.157	Ribosome biogenesis	ko03009	deepkoala