Gene detail

Detailed information of HK74SY85_g16242 in Paraphelliactis xishaensis sp. nov.

Genomic Location: ctg151:87406...89532
NR annotation: XP_020909660.1, putative RNA-binding protein EEED8.10 [Exaiptasia diaphana]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

Transcript

HK74SY85_g16242

ATGTTTTGGAACCTATTTGTTGTTTACGCAGCTAAGCATTGTAAAGACCTCAAGAAAATTAATTTATCTGGCGTCAAAGTTTCTGTTTCATCTTTGAGGACATTAGCAAAGGCTTGCAATAAATTAGAAGTAAGTTACTGAGGTATGGTGTTACCATGGTGACCTCATGAACTGGTGACCTTTTTGGGGGGGGGGAGTGGGGGAAGGGGGTGTTCTTGGCTCCAGAGGTCTTCTGGATGGAATGTATGTGAGGTTTATTTCATGAACTTACATGAGGTTGCTCTTTTGTTCTTATTTTTAGTCCCTGATTCTACAAAAATGTTATAAGGCTGGTGAAAAGGGGTAAGCATAAACAGAGTCTTTGTACCTCATTTGTGATGTAATACTAAGTAGATTCTATTGTATCTATGTGTAGATTGTGGTGGATGTTTAAGGAGTGTACCAAATTAAAACATATCGACATATCTGACAACAAACGGCTAACAGGAAAGGTCAGTCAAATATACACTTGTTTAAAAAAGGTTGCTGGGGTGAACGGCAAATGGTTGCGATCattgaatgtaaaataataatatagactgtagaatggaatacaatacaatacaatgcaatacaatacaatgcagtggaatataatataatgaaataaaatggaatcgagaacaattaagagatacaataTTAATGAAATAATTCCAAATTTATTTCCTCTTGGAATTGCTAACAttgtgttgttgttgttgttgtggttgttCAGTGTTTCTTCATGCTGCCTCCAACTATTGAAAGTATAAACCTAACAGATTGTGCAAGGGTTAGTATTTTATACTCTAATCCTTTCTGTTCTTTTGTTTTTTGTATTAACAATGAAATGTAAATTTAGGTTAACGACTCAGTGATGTACACAATAGTTACCCAAAATCTTATATTTTTTCAGTAACCTAGCTCTACTTCCTCCCTATACTGCAACACCTGACACTCcagggccgtagcaaggccaaaaatattcttctgccatgccctgtttttaacagttaaatgggttcctgcatataaaacagcttttttcgagatggattcaaaggttatttatccaatactcttgccattactcttgatcccatggttactctcactacaacttttcaattcagtcaggatgtataggttatatatatataaacaaaaacagtcaaaattattggggggcccgggccctcctggcccCTCCCCCTGCTACGACCCTGCACTCAAGTAGAGGGTCACATCTACATGATTTTGTATACTGTCCCTCTTACTTTCTTCTTGCGCTATTTACTTGACATTAATAAGCTGTTGAATTATTCTTTAGTTAACAAGTGAGGGTGTTGCATTTATTGGAAACCTGTGCCGAAACCTAAAGTCAATTGATCTCTCTGGCTGTGCTTCACTTACAGATGCGGCAATTATAGATTTACTTCTGGTAAACTACTATTGTTGATTTTGTATTACATGTAATAGTGTACATACATAATCTTAATAACTTCTTTACTTATATATTTCTCTGTTTCTCTATTTACAGAACTGTGCACAAATAGAGAAATTTTATTTTCGAAAATGTCCACAGACAGGTGAGTTTATAGTTGACTAGTTCAGGGTTGTAGCTAAGAAAATAGTCTGCTGGTTAAGAATGTCATGGAGTTGACTGACTTTAACTTTCGCTGGCAGCTGGAACTAATTGACAATCCTGCAAGTTATTAACATATGCTTTAATAATTTGTATGCTCTAATAATTATACAAAGTCCAGAGTGTTAAAATATCATTTTTGAAATGCCTCTTTTAATTTAAACTTTCAGTTACCACCTCAGGACTGCACTTAGTGATATCAAGACTTAGTCAATTGGTACAGTTGAaccacttaattaccgacaccttaccaaccacttactgacaccttaccaaccacttactaacaccttaccaaccacttactgacaccttaccaaccacttacagacaccttaccaaccacttactgacactttTCTTTATGTGCTTCATTCAAGATGGTGTTAGATCTTTCTGAGTGTGGTGCTGTTGATGATGAGTTTCTACTTCATCTAGGATCCTCTTCCTCTAACTTAACGATGTTTTGGAACCTATTTGTTGTTTACGCAGCTAAGCATTGTAAAGACCTCAAGAAAATTAATTTATCTGGCGTCAAAGTTTCTGTTTCATCTTTGAGGACATTAGCAAAGGCTTGCAATAAATTAGAATCCCTGATTCTACAAAAATGTTATAAGGCTGGTGAAAAGGGATTGTGGTGGATGTTTAAGGAGTGTACCAAATTAAAACATATCGACATATCTGACAACAAACGGCTAACAGGAAAGTGTTTCTTCATGCTGCCTCCAACTATTGAAAGTATAAACCTAACAGATTGTGCAAGGTTAACAAGTGAGGGTGTTGCATTTATTGGAAACCTGTGCCGAAACCTAAAGTCAATTGATCTCTCTGGCTGTGCTTCACTTACAGATGCGGCAATTATAGATTTACTTCTGAACTGTGCACAAATAGAGAAATTTTATTTTCGAAAATGTCCACAGACAGTTACCACCTCAGGACTGCACTTAGTGATATCAAGACTTAGTCAATTGATGGTGTTAGATCTTTCTGAGTGTGGTGCTGTTGATGATGAGTTTCTACTTCATCTAGGATCCTCTTCCTCTAACTTAACG

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13516	LRR_6	Leucine Rich repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR032675	Homologous_superfamily	Leucine-rich repeat domain superfamily	Interproscan
IPR050648	Family	F-box/Leucine-rich repeat	Interproscan
IPR006553	Repeat	Leucine-rich repeat, cysteine-containing subtype	Interproscan
IPR001611	Repeat	Leucine-rich repeat	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13382	MITOCHONDRIAL ATP SYNTHASE COUPLING FACTOR B	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan