Gene detail

Detailed information of HK74SY85_g25082 in Paraphelliactis xishaensis sp. nov.

Genomic Location: ctg389:133593...135332
NR annotation: XP_031567337.1, AP-5 complex subunit beta-1-like [Actinia tenebrosa]

Gene Structure

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Sequence

CDS

Transcript

HK74SY85_g25082

ATGGTAACATTACTATATTATCTTTGTTTATTGATTATATGTTATAAATTCTGGTTACTGCTACATCTCTATTGCCTAATTATCATGTTTTGTTTTCTGTCTCAGATTTTGTTTGTCACAGTACTTCGTCATACCATTGAGAGTTTGGCATCAAAAGCATTTTATGGGTAACTCACTTAAAGACATTATAGTGCTGAACAGATGTGGAACTATTTTAAAATAAGATTTCTATATCTGTGAGTCAGATAAGATCAGAAAGAAAATTTTTTCAAGGAGATAACAAATGTACAATACATAGTTACATGTACCTCATAGGAGTAAGGGTGGTTTAATGCATGTAGCTGAGATACAAACGTAGGTTTGCTGTTAAACTCCCATTGTCCTGATTGTTTTGACTTCCCTCTGAGCTTAGTGTACATGTCAGCACTGATGGAGAAAAGGGGTTTAGACTAGAGTTCTGTCTCCTGGAAGATTCCCTTTCAGGTGTAGGGGATTGAAACAGACATTAAACATTATATCTTCcagggcttgaaatagcagcctgccaatggccaaaatgcaggccaaaaattagtaatggcaggcgaaagtaatgtgttgaagtgccaaatTTAATATTAGTAATTGCTTtgacagtaatctgtggcagttcaaaaataagtaaatggcaggctataatttttttCTATTTCGAGCCCTGTCTTCTTTTACCATTTACATGTGTATTTGTCGTTTTTTTTCTCAGATTGGAGAGTGACTGTTTAAACCAGCTTTTAACAGACTATTCAGAACCATTAAAGGTAATAAAAAGACAATAAAAGAAAAGAAAAGAACACAATAATTTATAATTGTCATTTTAAGATAAGAATAATAGATTGTATTGTTTTCTTTTCAACTGCAGCCTATGAGTTTTCCTTCTGAAGTTACCAGTGAAACATTCCCATTGGCTCTTCGTGTAAGTACTGTATTCTAATAATAATTTAATAATAATTTATTTCTTGACACAGATTCATAAATCTCAATCATCTCGCAACGGAATCATCTTCTTTTATTTTTCTCTAGTCACCTCCCTGTGGTGTTCCGATGGCATATCTCCCTGAGAGACTCAACTCTAAAGAACTAAAAAGAGCTGTGTCATTTATGATGGAAAACATTGGATTCTTGAATACAACGTCTTTGTTTTATGTCATGTTAGAGGTAAAGAATTGCTACACATTGCAACTATTGCTGGTGAATGGTGATTATCTGAGACTTTTGTAGACAGAGAGACCCTTGGTTTAATAATCATTCTAGTCCTTGCATTTCAATTCTGAGCCCAACACTAAGCTTAGTGAGAGTCTAGATCTAATTTTTGAGGACCATTCCCTTAGCTTGTAACTATATGTTGTCATACATAAGGTTTTACTGACATTCCATTATCAAAACTGCTCAAGGCATTCTGTCTGAGTTTTCATGTTTGTACATGTACCTCTTGTTATTTCAACCTTTTATTTTTATTTTTTCATTTCAGTTGATGCATTGCATTAAACTTTCAGAGCTTTCACCAATTGTAAGATATTATGATTGATTGATTGATTGATATTCATCTGTGTATATATACCAGTCCTTCATTTTTGTTAAGCTGTTTCATGTAAACTTTCAATTCATTTCCAGACTTTCAAGTCTCAATTCATCCAGTGGATCTCTTCATCAGATATTTCTATATTTCATATGTTACTCTTTATGAGGGTGAGTTCCATGATGGTAACATTACTATATTATCTTTGTTTATTGATTATATGTTATAAATTCTGGTTACTGCTACATCTCTATTGCCTAATTATCATGTTTTGTTTTCTGTCTCAGATTTTGTTTGTCACAGTACTTCGTCATACCATTGAGAGTTTGGCATCAAAAGCATTTTATGGATTGGAGAGTGACTGTTTAAACCAGCTTTTAACAGACTATTCAGAACCATTAAAGCCTATGAGTTTTCCTTCTGAAGTTACCAGTGAAACATTCCCATTGGCTCTTCGTTCACCTCCCTGTGGTGTTCCGATGGCATATCTCCCTGAGAGACTCAACTCTAAAGAACTAAAAAGAGCTGTGTCATTTATGATGGAAAACATTGGATTCTTGAATACAACGTCTTTGTTTTATGTCATGTTAGAGTTGATGCATTGCATTAAACTTTCAGAGCTTTCACCAATTACTTTCAAGTCTCAATTCATCCAGTGGATCTCTTCATCAGATATTTCTATATTTCATATGTTACTCTTTATGAGGGTGAGTTCCATG

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF21588	AP5B1_middle	AP5B1, middle domain	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR048979	Domain	AP5B1, middle domain	Interproscan
IPR038741	Family	AP-5 complex subunit beta-1	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR34033	AP-5 COMPLEX SUBUNIT BETA-1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005765	Cellular Component	lysosomal membrane	Interproscan
GO:0016197	Biological Process	endosomal transport	Interproscan
GO:0030119	Cellular Component	AP-type membrane coat adaptor complex	Interproscan