Gene detail

Detailed information of HK74SY85_g25239 in Paraphelliactis xishaensis sp. nov.

Genomic Location: ctg395:547422...557851
NR annotation: XP_028515848.1, probable ATP-dependent RNA helicase DDX31 isoform X2 [Exaiptasia diaphana]
Species abbreviation PXISH · all data for this species · gene families

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CDS

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HK74SY85_g25239

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Protein

UniProt (Swiss-Prot top hit)

UniProt accession	Description
Q6NZQ2	ATP-dependent DNA helicase DDX31 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ddx31 PE=2 SV=2
Q9H8H2	ATP-dependent DNA helicase DDX31 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX31 PE=1 SV=2
Q86B47	Probable ATP-dependent RNA helicase CG8611 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=CG8611 PE=1 SV=1

Gene family

Family type	Membership / link
Orthogroup (gene family)	OG0005647 (this species only)

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00270 all species →	DEAD	DEAD/DEAH box helicase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR014001 all species →	Domain	Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain	Interproscan
IPR011545 all species →	Domain	DEAD/DEAH box helicase domain	Interproscan
IPR027417 all species →	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR000629 all species →	Conserved_site	ATP-dependent RNA helicase DEAD-box, conserved site	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24031 all species →	RNA HELICASE	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0003676 all species →	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0005524 all species →	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0005634 all species →	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0042254 all species →	Biological Process	ribosome biogenesis	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	Pathway	Map ID	Source
K14806	DDX31, DBP7; ATP-dependent RNA helicase DDX31/DBP7	EC:5.6.2.7	Ribosome biogenesis	ko03009	deepkoala

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.