Gene detail

Detailed information of HOLI00487.G30459 in Hydra oligactis

Genomic Location: HOLI00487:414035...473048
NR annotation: XP_047128697.1, uncharacterized protein LOC101237560 [Hydra vulgaris]

Gene Structure

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Sequence

CDS

HOLI00487.g30459.t2

ATGTTAAATACAAAAGATAAGTCTATCGTGTTGGATCATTTTGTGAAAGTTCGGCCGATCATAAGGAAAAATTGTTTATTAAAGAATGCAAGAAATCATGTTAAAAATTCAAATGGCGTATGTTCAAATCATAAAAAAAAAATTCAAACAGAGTATGATTACATAAACAATTCAAATGATTTTAAAATTGCAATCAAACATAGAAAAAGTTCATGCAAGTTGAAGTCATCAGATACAACTGAAAAGATATATACAATTGAAAATGTTATTGGTCAAAAAGTAAATCTAATAAAAGAATCAAGAATTTCTATGTCTGGCCAATTAAGATCTTCACAAAAAGTAAGAAATATCCCAAATTCAAAATGTGAAAATAAACTAGTTATAGATGATGACAAATTGTTTTATACAATAAATACTAATACTGCTAGAGGGGGTGATGACAAGTTTACTTTATCAACTAATAGTAATGCAACTGCAGTTGATAATCTAGTACTGAATAAGCACAGAAAGTTGATATTCAGAAATCGTAGATGTAACTCATTTCCACTTTGCAATAAAGACACCTGCAATGAAAAATATGTTCTTATGACATCAAAATTTGAATCGATTTTGGATATACGAAGAAAGTATAAAAAATGTGAAGCATTTAAAAAGAAATCAAAAAAATGTTATCAAAATAGAAGATTCTGCTCTCAACCGAACTTGACACTAGTAAAGAGTTCGACCATTTTGAGCTTCGATTCAATTATGACTGAGGTTGTTGAGAAAATAAAAGAAAGAAAAATTATCAAAAGAAATCTCAAAAAGTTTATACATACATACAATAAAAAAGTAAAAAGTATTGAAAATTATTCAAGATCAAAATCATTACAAGATTGTTGTATGAAAAATTATACAAATATGAACAAGATGAAATATGGAAAAAATAAACAATATCTGGAAATAACTTCAGATAATTCAAATGAAAAAGTGAGTTCGCATGGATCAAAAAGTTCTTATGGATCAAAAGGTTCTTATGGATCAAAAAGGTCGTCAGGAGAAAACTCTGTTGGTTCATCCTCATCACAAGAAAGTTTTTCTTTTGGACGTCTTAAGAAATGTTATAGTGAATCATCAGAGAAGGTTCATAAAAATATTGAAGCTCTTTCATTGAAGATCAACACACTTGATGATTCCAATGGGTTGACTGGTTTTTTACTTTGTCGTCGTGGAGCTCTTTACAGAAAAGTTGGATATTTGAGTGATTCTTATGCAGATTTAAATAGGGCTGAGAAACTTGAACCTATGCTGGTAGATATTTATTGGCAAAGACATTTATTATATCTCATTCAAGGTGAAACAGAGAAAGCACTAAATGATCTTCACCAAGTTATATCTTGCAATAAAAATCATACATATGCTCACTGGTCAAGAGCTATAATTTACAAAGAGCAAGGCAAAATATTTCATGCTATTTCCAGTTTAAATCAAGCAGTTTTAAGTAATCAATCTATTGCAAGTTTATACAGTATAAGAGCAGAGCTTCATGAACAGAGCCATGATTTGGTTATGGCATTGGATGATTATAAGAAAGCACATAACTTGCTACCCAATGATTTTTCTACAATTTTAAAAGTAGCAATATGTTACTTTAATTTAAGACTATGGGTAACTGCTTTAAATTACTTCACAGAGCTTCTCCATCTTAACCCAAAATATTACCAGGCTTACTTTTACAGAGCTAGAGCCAATATAAAATTGAAACATTTTGAAAATGCAGTGACTGATTTATCAATATGCTTGCATCTATCTCCAGATCACTATGCAGCATTCTACTATAGGGGTTTTATTCTTCAAAGAAGTTCAAAAAAACAAGCTATCAAGGACCTAAGTGTTTCTTTGTTGATTAATTCAGGTCAAGAAAATATATATGCATTTATACAGAGAGGAATAATTTACACAAGATCAAAAAAATTTCAACAAGCTATAATTGATTTAAAATGTGCTCTGGAATTGAACAGGGAACATCCACTTGTTCATCTGAACCTTGGCTTAATTGATATTAATTATAGCAATAACCTATCTTTGGCTTTGAAGAGATTCAGTTTTGCATTATTAAAAGATCCAACTTTCATACAAGCATTGATTTGTCGTGCAGAAACATTCATTCTTTTGAAAAATATTGATGCTGCCATCTTAGATTACACACGAGCTATTCATTTAAATCCTTTAAATAAAAACTTTAAAATTGCAAGGGGTTATCTTTTGCTTAGAAAACGACAGTACGATCAAGCTGTTTTCCATATAAAGCAATGTGTGACGATAAATTTAGTTGATAAATCAATCTATGAACAATCCGTTATGGAGATATTTTTTAAAAATTTTGTTGTGGCAAATAATTGTTTGGAAACGGCTCTTGCTAATGAATATGATTTCAATTTGCTTGTTTTGTTGGGTAAAAGTAAATTGAGAGAGAAAGAATCAATACAAGCACTGGAAGTTTTTAAGAGCATTTTATTGAAGATCACAGATTCTAACTGTTTTAAGGAGTCTTTAATACATCTCTACTCAGCTCTCTGCCACATCCAACTGAAAGACTATAATAATGCATTAATTTATTTGAACAATGCTTTAAAAATTGATAACAATCTTTTTGAGGTTCACTACTTGATAGGTATAGTTAAAATGCAGCTGTGTTCAGGTTCACCTATTATTGATTTCAACCACTGTCTTTCTCAATGCTTGTCATTTTACCAGGCCTATTTAGGTTGTGCTTTGCATTACGGTTCAAATAGACAATACGCTAAAGCCATCACAAGTTGTAATAAGGCTTTGCAATTAGAGGTTCAGAGTATTGCAGTTCTTATTTACAGAGGATGCTTAAAATTCCATATTAAAGCATACAATTTAGCAATAAAAGATTTTACACAAGCTATAAAACTAAATCCCTTGTGTTATTTAGCTTTTTACAATAGAGCAGTGTGTTTCCATGCTAAAAAGTTTTATTTTACGACATTGAAAGACTACAGTATTGTTATTTTATCAAATTGTGAACACAGACTAATGGCATTGCTTAATCGTGGGGTTGTTTATTTTGAAATTGAAGATTTTCAAAATGCTCTTCTTGATTTTGAAGCATTTTTAAAACACAAACCAAGAGATGCAACAGTTGTCTACAGCATTGGTTTATGCTATCATAGACTGGGCGATCATAATAAATCAAAGAAATTTTATAACAGAGCACTGGAAATAGACTCTTTATATTGGCTATCATTGATTGGGCGTGCAAATGTTTTAATGGAATGCAATAATGCAGAAGCTTATAAATTAGCACAAAATGATTACAGTCGTGCACTATTTATCAACCCAAACAGTTTACAAGCAAGGTTAAACTTAGCAAGATATCTTCAGGTTAAATGTCAACATATGAAGGCTTGGTATCTATTTACAAGAACTTTGGAAATTGATCCAAATTGCATTTGTGCATTGGAAGGGCGCGCATTAGTGAGTTTACAAATGAATAACAGATTTGAAGCTCTTTGTGATTTTAATAATGCTATTAAGCTGAAGAAAAGTCCTGAATTGCTAACAAATCGTGGGGTTGTAAACATGGCATCAGGAGATAGTATTAATGCAATGCATGATTTTAAAATGGCAATACAGATGAATCAATCATTTGGAACAGCTTACTTCAATGCTGCAAACATATGTTTTCTAAATAATCAGTTCTCTCAGGCTTTGTTATATTATGATAATGTCATTGAATGTAATCCTGGGGATGAAGTAGCATTTATAAGTCGAGGAATTTGCAAGATTGCTCTTGGTGAAATGGAAGAAGGATTGAAAAATATTAATCAAGCAACTTTGGAACTTCATCCTGATGATGCTTTGACTTACAAGAGACGTAGCTTTGTTCGAGGGAAGCTCGGTGATAATGTATTGTCAGTTAAAGATTTTTATGAAGCAATTGTTCTACAAACGACAAATAAATAA

Transcript

HOLI00487.g30459.t2

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13181	TPR_8	Tetratricopeptide repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR019734	Repeat	Tetratricopeptide repeat	Interproscan
IPR011990	Homologous_superfamily	Tetratricopeptide-like helical domain superfamily	Interproscan
IPR050498	Family	Photosystem I assembly protein Ycf3	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR44858	TETRATRICOPEPTIDE REPEAT PROTEIN 6	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K24929	TTC6; tetratricopeptide repeat protein 6	-	Domain-containing proteins not elsewhere classified	ko04990	deepkoala