Gene detail

Detailed information of HOLI00901.G31731 in Hydra oligactis

Genomic Location: HOLI00901:18461...82384
NR annotation: XP_047132983.1, echinoderm microtubule-associated protein-like 6 [Hydra vulgaris]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

HOLI00901.g31731.t1

ATGGTTGATAAAACTCCACCTCCATCAAAACTTCGTTTAGAATATGTTTATGGTTATCGTGGACATCAATGTCGCAATAATTTATACTATACCAACAGTGGTGAAATTGTTTACTTTGTGGCAGGAATTGGAATTGTTTTTGATCCGAAATTGAGAAAGCAGAAGTTTTTTTTAGGACACAATGACGACATTGTAAGCTTAGCATTACATCCTGATGGAAAGTCTGTAGCAACAGGGCAGGTTGGTAAAGAGCCTTATATATGTGTATGGGATGTTTTCAGCTGTTGCACAATATCCATATTAAAAGATAACCATCAGAATGGCGTTGCATGTTTAGCTTTCAACACAATGGGAACTCAATTAGCCTCTGTTGGTCTTGAAGAGTACTCTCAATTAACTATTTTTGATGTCTGCTTTAACCCATATGAAGATAAAAAATTAGTCACGTGTGGTGTGAAACATTTAAATTTTTGGACATTAAGCGGAAATTCTGTTGTACCTGTTAAAGGTGTGTTTGGTGAAAAAGGTGAATTGCAAAGTATACTATGTATTTGTTTTGGAACTGGTGGTCTTATGTACAGTGGAACATTGAACGGAGATATTTATAGATGGAAAGATAATGTTCTTATAGAAAATATTGCTTCTGCACATTTGGCAGCAGTTTTAACATTGTATACTTCTGCAGACGGATTTGCAAGTGGTTCTAAAGATGGTACTATTGGATTGTGGGACATGGAGTTCAAACCAATTACTCGAATTGATTTGAATCAACATACTCTTGGTTATAAAGGGATTTCAGTTCGTAGTGTTTGTTGGATAGGTGAAAAAATATTAGTGGGGACAAACAATGGGGAAGTTTTGGAAGTTTCAGCTGCAGACAAAAACAAACCAATGACTATTACTGCGGGGCATGCAGAAGGTGAATTGTGGGGTTTAGCTGTGCATCCCAAAAAACTTGTTTTCGCTACAGGAAGTGATGATATGACAGTCAGGTTATGGGATATGTCTAATAAAGAATTGATTGCAAAAGCTGTTTTTGAAGTCACAATACGAAGTCTGGCTTTTTCTCCAGATGGTAGTCATTTATCCATAGGTCACGGAGACGGCTCATTTCGAGTCCTTAAAGGAAGAGAACTTTCTGAAGTATTACATATTCATGATCGTAAAGATGTCCTGCATGAACTGCGTTATTCACCAGATGGTGCTTTTTTAGCTGTTGGATGCAATGATAGCTATGTAGATTTATATTCTGTACGAGATCGGTACAAAAGAATTGGCCAATGCAAAGGAAGCACAAGTAACATAACACATATTGACTGGTCAGAAGATAGTAACTACTTACAGACTAACTCAGCTAGTTCAGAGCGCTTATTTTTTAAAGTACCTGGAATTAGAAATTCAATTATGACAATTATATTATATCTTAAGCAAAGCCCATCACGTTCAATACTATGTACTGCACTATTCATTTCAGTTCACCCTATTCCATCAGACTATCGCCTTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATAACATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGAATATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACTATCACCCTATACCATCAGACAATTGTAATAATGTTAACCCTGACACTACCTGTCTGCAAAAAGGTTCTGTAGTAAAAAAATATTTGTATAAAGGTAAGATAGTTACTAATACGCAAGAAATTGAGGCAATACATTGGAAATCATGGACTTCTGTACTTGGTCCTGAGGTTAATGGTATATGGGAGAAATACTGTGAAACAACAGATGTTAATGCTACAGACACTAACTTTCAACAAGGGATTATTGCCACAGGCGATGATTTTGGTTTAGTGAAGCTATTTAGATTCCCATGCATTAATAAAGGAGCAAAATTTCGAAAGTATGTTGGCCACTCAGCTCATGTGACAAATGTTAGATTTTCATATGATGGTTTGTATCTTGTTACAACTGGTGGTGCAGATCATGCAATATTTCAATGGCATGTAGTTTCTGAGGGGTATAAAGAAGATAATTTAAATTTTGAAATGGTTTCAGACGGGCTTTATTATGACTCAAATGACGAGGCAAGTGATTCTGATCTATCTGATATCAACCCTATAGACAGTGATATAGAGCAGGAAATAAGTATTGATTATGATCGGCAAATTTATAAAGAAGATCTTCCTAAAATACAGAGAGAATTAAAATCCTCTACGGAGTCTAAACAACCACGCCCTCCTCCTCCATCTAAAGGCATAAGACTTATTCATGTTTTTGGATACCGTGGCTATGACTGCCGAAATAATTTATTTTACACACAATCAAACGAAGTTGTTTATCATATAGCTGCTGTTGGTATTGTTATTAATCCTATTACAAACAACCAGCGTTTCTATCTAGGCCATGATGATGACATTTTATGTTTAACATTGCATCCTATCAAAGACTATGTTGCAACTGGCCAGATAGGTAGAGATGCAACTATTCATATCTGGGATATTGAAACAATGAGCGTTTTATCTATTCTTACAAGACATCACTCGTGGGCTGATGGTAAAAAGTTGGCTAGTATTGGTTTGGATGAAGATCACAGCATAGTGATATGGGATTGGAGGAGAGGTGAAAAACTTTCAAGCGCAAGTGTCCACAAAGATAAAATATTTGAAGTACGATGGGACTCAAACAATGTTGACAAGCTCGTAACCGTTGGTATTCGTCATATAAAATTTTGGACTCAGACTGGAGGTGGTTTGATTAATAAACGTGGAATATATGGAAAATTAGCTAAAGCAGACACTCAACTTTGTGTGACTTATTCTAAATCTCCTGGGATCATTGTTTCAGGTGGTTTAAGAGGACTAATCTATGTTTGGAATGAGGAGTTGTTAATGTCTACAGTGCAAGCTCATCAAGGACCAGTGTTTGCAATTCAAGCTCTTGAAAAAGGTTTTGTCTCAGGAGGAAAAGATGGATTAGTTTGTTTGTGGGATGATGCAATGAGTAGATGTTTAAAAAGTTATAAAGTCAACAAAGCCAATCTGGCATCTGGCCAGTCTAAAGATCTTTTGGCCTATGACAACCCTCCGATACGTGCTGTTACACTTGGACAAGGGAAAATTCTTATTGGTACAAAAAATGGAGAAATTCTTGAGATTGATAAGGCCGGTCCACTTACTTCTTTAGTTCAGGGTCATTGTGAAGGTGAGGTATGGGGACTAGCGCAACATCCAAGTGAAAATATTTGTGCAACGATTAGTGATGACAAATGCTTGCGTGTTTGGGATATATCTAAGTATCAGCTTTTTAAATTAAAAATATTTGAAAAATCTGGTCGGTGTGTTAATTACTCTCCAGACGGTCGTACGTTAGCTGTGGGTTTTGTTGATGGTAGTTTTACTGTATTGAACAGCAGTACATTAGCTGATATTTGTAACTATCATCATAGAAAAGAAGAAATTTCTGATATAAAGTTTTCCCCAGATGAAGGCAAGTATTTAGCAGTTGCTTCTCACGATGGCTTTGTTGATATATACAATGTTTTATTAACCAAGAGAGTGGGAATATGCAAAGGCTCCTCAAGCTACATTACTCACATAGACTGGGATACTCGAGGAAAGTTAATTCAGGTCAATAATGGGGCCAAGGAAGTGCTTTATTTTGAAGCTCCTCGAGGTGTGAGGCAAGCTATTCCTTCTATACAACTAGACAAGTTAAAATGGTTTTCATGGACATGTGTTTTGGGTACAGAATGTCAAGGAATATGGGCTCCACATTTTGATGTTTCTGATATTAATGCATCGCACTTATCTTCTGATGGAACAATGCTGGCAGTTGGAGATGACTATGGATTTTTAAAGTTATATGATTTTCCTTGTACAGTTAAAAATGCAAGGTGTAAGAAATTCAACGGCCATTCTGCAGATGTTTGTAATGTACGTTGGACTCATGACAGTTCTTTTCTTTTGTCTGTTGGCGGGGCTGATACTTCCTTAATGGTATGGAAGAGTTTAGATGCTATTGAGGCGTGCACCCAGAATGCCTTAGAATCTGATTCAGATTCTGAGATTGAATCAGGGTATGATAGTGATGTAGAGCGTGAAAAAAATATAGACTACATGAGTAAAATTTATGCAAATCCTTTGAGAGAATCTTCTGGCAATAAACCACAGTTACAAGATATTTCAAGCGAGGAGAAAAAAAAGGTGAATCGTGGTGAGTCAGAGAAAGCAGTTGTACCAAAGAAAGACAAAAATGAAGCCCCTATCAATGATCTTACACTTGAGTTTATTTATGGCTATCGAGGATTTGACTCACGAAATAACCTACATTATTTATCTGATGGAAGTATTATATATCCTGCTGCCGGTACTTGTGTGGTTTTTAATTTGAATGAAACTAAACAAAAGTTTTATGCAGAGCATACAGATGATGTAATTTGCCTGACAGTTAATCGAAATCCAAAGTTTAAGGATTTAATTGCATCAGGTCAGATTGGTGTTAATCCTTCAGTTCACGTTTGGGAGGCAGGCACTCAAAAAACACTTTCGGTTTTACAAGGTTATCATACAAAAGGTATTTGTGGAGTAAATTTTAGTTCTAGTGGACGATATCTGCTAACTATTGGTCTTGATAATGACCATTCTATTGCTGTATGGAAGTGGATTGATGGAACCAAGGTGGCTTGCGGTCCTGGATCTAACCATCGTATATTTGTTGGAGAATTCCGACCAGATTCAGATACAACATTTGTTACATGTGGAATTAAACATGTCACATGGTGGAATGTTACAGGGGGTTCTTTTGTTGCAAAGAA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Transcript

HOLI00901.g31731.t1

Protein

HOLI00901.G31731

MVDKTPPPSKLRLEYVYGYRGHQCRNNLYYTNSGEIVYFVAGIGIVFDPKLRKQKFFLGHNDDIVSLALHPDGKSVATGQVGKEPYICVWDVFSCCTISILKDNHQNGVACLAFNTMGTQLASVGLEEYSQLTIFDVCFNPYEDKKLVTCGVKHLNFWTLSGNSVVPVKGVFGEKGELQSILCICFGTGGLMYSGTLNGDIYRWKDNVLIENIASAHLAAVLTLYTSADGFASGSKDGTIGLWDMEFKPITRIDLNQHTLGYKGISVRSVCWIGEKILVGTNNGEVLEVSAADKNKPMTITAGHAEGELWGLAVHPKKLVFATGSDDMTVRLWDMSNKELIAKAVFEVTIRSLAFSPDGSHLSIGHGDGSFRVLKGRELSEVLHIHDRKDVLHELRYSPDGAFLAVGCNDSYVDLYSVRDRYKRIGQCKGSTSNITHIDWSEDSNYLQTNSASSERLFFKVPGIRNSIMTIILYLKQSPSRSILCTALFISVHPIPSDYRLIPSDYHPIPSDYHPITSDYHPIPSDYHPIPSDYHPIPSDYHPIPSDYHPIPSDYHPIPSDYHPIPSEYHPIPSDYHPIPSDYHPIPSDYHPIPSDNCNNVNPDTTCLQKGSVVKKYLYKGKIVTNTQEIEAIHWKSWTSVLGPEVNGIWEKYCETTDVNATDTNFQQGIIATGDDFGLVKLFRFPCINKGAKFRKYVGHSAHVTNVRFSYDGLYLVTTGGADHAIFQWHVVSEGYKEDNLNFEMVSDGLYYDSNDEASDSDLSDINPIDSDIEQEISIDYDRQIYKEDLPKIQRELKSSTESKQPRPPPPSKGIRLIHVFGYRGYDCRNNLFYTQSNEVVYHIAAVGIVINPITNNQRFYLGHDDDILCLTLHPIKDYVATGQIGRDATIHIWDIETMSVLSILTRHHSWADGKKLASIGLDEDHSIVIWDWRRGEKLSSASVHKDKIFEVRWDSNNVDKLVTVGIRHIKFWTQTGGGLINKRGIYGKLAKADTQLCVTYSKSPGIIVSGGLRGLIYVWNEELLMSTVQAHQGPVFAIQALEKGFVSGGKDGLVCLWDDAMSRCLKSYKVNKANLASGQSKDLLAYDNPPIRAVTLGQGKILIGTKNGEILEIDKAGPLTSLVQGHCEGEVWGLAQHPSENICATISDDKCLRVWDISKYQLFKLKIFEKSGRCVNYSPDGRTLAVGFVDGSFTVLNSSTLADICNYHHRKEEISDIKFSPDEGKYLAVASHDGFVDIYNVLLTKRVGICKGSSSYITHIDWDTRGKLIQVNNGAKEVLYFEAPRGVRQAIPSIQLDKLKWFSWTCVLGTECQGIWAPHFDVSDINASHLSSDGTMLAVGDDYGFLKLYDFPCTVKNARCKKFNGHSADVCNVRWTHDSSFLLSVGGADTSLMVWKSLDAIEACTQNALESDSDSEIESGYDSDVEREKNIDYMSKIYANPLRESSGNKPQLQDISSEEKKKVNRGESEKAVVPKKDKNEAPINDLTLEFIYGYRGFDSRNNLHYLSDGSIIYPAAGTCVVFNLNETKQKFYAEHTDDVICLTVNRNPKFKDLIASGQIGVNPSVHVWEAGTQKTLSVLQGYHTKGICGVNFSSSGRYLLTIGLDNDHSIAVWKWIDGTKVACGPGSNHRIFVGEFRPDSDTTFVTCGIKHVTWWNVTGGSFVAKKGNLSSYAGEATSQTMLSVAYGPNDATFTGAISGDVYIWSVNLLTRIVKNVHSGPVFCMFTTVTDGLIVTGGKDKADQNSSAVKLWDQEMKRCKPFKLYQVVRSVFRGTKKGTILVGTQDNSIIEINEKTGSLQTLMDGHRDGELWGLSCHPSKDVFVTSSDDKTVCTWDIKSKLLLNKVEISVAARCCCFSPDGNSFAVGTKNGEFYILDTNSLQILTKKRDRNKSITQIRYSQDGLMLAVGSEDNSLDFYSIKPTFTRIGYCKNLSSSVVQLDLSVDGKYAQVCTGSYEHFIFSIPDGTQITDEIEINRLIWINWTCILGCNVIGIWPKNSDNGDINCAHLSHSGKTLASGDDFGFVKLFDFPVLQKYTKGKEFFGHSAHVTNVCFTHDDRYLVSTGGDDSCIFVWRCQQC

Uniprot

Uniprot term	Description
Q6ZMW3	Echinoderm microtubule-associated protein-like 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EML6 PE=1 SV=2
Q5SQM0	Echinoderm microtubule-associated protein-like 6 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Eml6 PE=2 SV=1
Q05BV3	Echinoderm microtubule-associated protein-like 5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EML5 PE=1 SV=3

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03451	HELP	HELP motif	Repeat	Interproscan
PF00400	WD40	WD domain, G-beta repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001680	Repeat	WD40 repeat	Interproscan
IPR036322	Homologous_superfamily	WD40-repeat-containing domain superfamily	Interproscan
IPR050630	Family	WD repeat Echinoderm Microtubule-associated Protein-like	Interproscan
IPR005108	Conserved_site	HELP motif	Interproscan
IPR015943	Homologous_superfamily	WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13720	WD-40 REPEAT PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0008017	Molecular Function	microtubule binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K18598	EML6; echinoderm microtubule-associated protein-like 6	-	Cell motility	-	deepkoala