Gene detail

Detailed information of KAF0990520.1 in Henneguya salminicola

Genomic Location: SGJC01001300.1:2...7538
NR annotation: KAF0990520.1, hypothetical protein HZS_612, partial [Henneguya salminicola]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

KAF0990520.1

GACGATATCACTAGAATTATTGAGAAATCATTGGGAAATTACCCTATTTCAAATTTTGAAAAATCAATAAAAGAATTAAAGAAAATATTAAATAATTTTATTGATCATCCGCATCTTATGGATTCTTCTTTAGAAAAAATATTCGATACTTTATTTATAAATTCTACTAATGATTGTAATTCATTCGAGACTAGGCTATTGATGTTCGAATTTATTTATGAAATATTGAATATGAGAAAATTTAAAGGAGCACTAAAATTTATTAATCACGACGAGAAAAAACTATCATTTGTTTTAAATAACCTAAAATATTTCGCATCTCATTATAAAGCTAAATATTGTCTTCTTGGTTGGTTGATTAGTATTTTAAAAGCTCCATTTATTTTATTTCCTGATCAAAACAGTGATCTTTTATTCGACACTATCGATTTAATAAAAGTACATTTATGCCTTTTATATTTTTTGAAACTAGTGGATTCAGCTTCAAATTCATATGGTTCTGCTGTCGGAATTCTATCCTCTACTCTTCTAACTCGTACGGATATTTCTGAATCAACCATAAGCGAATTTATTCAGTTTTTGATTCCAAAGCTTCTTTCAACTGATGATATAAAATCAATAAACACTGCGATTATCGCTTTACGCATTTTTACTTATTTGTTCAAAAAAATGCCTCGAGTGCAACTTATTCTTTTAGCAAACGAAATAATGGAACAAATTAATATTGATACTTTATCTTCATCCAATAGTTTCGCTTTAAAAAAAAATTTCATTAAATTAATTCAACGAATAGCCATGATTTATTTGAAACCAAAACAAAATGCTTTTTTATTTTATTCGAAAAATCAACAAACTGATAACGCTGATTCTAATATTGAGTGCGTAAATACCAAGATGGTTAATAAAATAATTCGTATTATTATATTTACTGTAACGACAGAAAAACTTTTTCAAATGATGGGTGATCCTAGTTATGACAATCGATACTCATGTAGCAAAGGAATTGCACGAATTGGGGCTCGATTAGATTCGACTCAGCGCAATAATATAATTGATTCCGTTGTTTCATTGTTTAAGTATTGTATTATAATTATATTTTTAAAGAAAAACGAGTCAAGCATATTGGCAAACAGGTTATTATTACCTTTTATAATTCAATCGTTAACTTATGAAGAGCATTCTTCTAATATTGTAGCAGGTGCCTCCATAAGAGATGCAGCATGCTATGTATTATGGAGTTTTGCTCGTGCTTTTCCTCCATCTGCACTACATACATACATACCAAATATTGTTCTGTATAAAAATGGAGTGAACTTTAGAAATTTAGTGTTGATTGCATTGTATGATTCCCAACTCATATGCCGTCGAGCTGCTTCTGCTTCGCTACAAGAAATCATAGGCCGTCAAGGAATCTTTGAAGGAGGTACTGAATTGACAATTTTACTCAATTTTCAATCAGTAAGTAATCCTGAAAAATGTTATTTGGAGCTGAGTCCATCAATTGCTCGAGTGTTTAGTTATGTACCCGAAATGACCACCAATTTAATTAAATATCGTTTGTGCAGTATTTATAAAAAAACTCGAGAATTATCAGGTAAATGTTTGGGCAAAATCGCAGTCAAGAATTCGTCATATTTTTCCAGTCAAGTTCTACCTATTTTATTTGATAAAATTGTTGACGGACTAAATGAAAACTATATTAATGCCATCGTCGAAATTCTTCATGGTATTTATATGTCAGGATGTGAAATATGTGAATATTCGTTTTATTTTCTAAAAATGTGTGAGATTATACCAAATGTATTTTCTATTAACTTTTATAAGATTTCTACTTCAAAATTTTCTTCATATATACCTATAGAAGGGAGAGTTTCTTTACAACTTGCTACTATCAAACTGCTCGCTCATCACCCCATACTTGCTAACACATTCATCAGTAAGTATAATTATTGCAATGTAAAGGTGATTGGTTCGATTTCTGTGTTAAAAATATTTATCATCGAACTCTACATATTCGAGTTTGATATATTGCTATTAATAAAAAGAATGCTGCGATTCAATCGCTGTCAATATTTTGATTATTTTAATAAAAATGTGGATAAAATAAATGGTCCAAACATTCACAAGATTGGAATTTATTTATTTATTACGGCCATTTGGCCTTCATTGAAAGAGAACCATCTAGAACTTGATAAGCTTCTATTAATTGAATATGAGAAATTTGATCATTACGACAAATTGTTGACTGAAACACTTATTACTTGGTCCAAAATGATTGCTTCTATTATTCCTCAAACTATATTTCCCGACATAGGATTTCCTTCTGTTTTAAAAAGAATATTAAACATATTTTGTGTATTTATGCATGTGTTTAAATCTACAACTTATGGAGATTTTTCCAGAGATCTACGTCTTTCAATATTGGAAATTCTTGATAAAATCAACGAATATATTTTTAACAATTTTAATATCGTTGATGAGGATTGTTTTAATAATGTCTTGGATTCGGTTTTGAGTCTTGCGTTTGAGTGTGATGATTTAATACGGAAAATGGCCTTTAAATGCTTGCAAAATTTGTTGAATTTTTCAAGTAGTACCACTTTTATCTCCCAATTTGATCAACTTGGAAACATTATGTATTTAGTTGTTCAAAATACATACAGGAATTCTTTACCAATAGATGCAACATCTTTTGAAAATTGCACACTTAAATTTTTTAAATATTCAAATTTTTATCAACCACTTTTAAGTGGCTGGATTTCGTGTTATAATTCAAGCTTACGCCACAAAGCTAAAGAAATTTTGAAAAGATTTATTGAGGAACATATCTCTGACCAATCAAATGTTGATGCTTTGATAGAAACATTTATTAACATATATTGTATAGATATAGTATTGGATGAAAGATTAATTGATGGCCTCATATTTTCAACCTTAATTATTTTAAAATCAGATATTTTGACCATGGTTTCTTCTATCTGTCTTAATCGTTTTACTAAATCATGTTTTATTTTTCTTCATAAATGTACTGAATCGTGTAATATAATATCTCGAATTAAAAAGGCCACAAACTGTTTATTTCTGCTGCTGAAATACGATCATAATCTAAACGATAAAATAAGTGGGGCTTTTCAAATCTTATTAAACCACCCATATCCACAAGTTCGGCTAAATATCTTAGAGCTGATGGATCAACAATCTTAA

Transcript

Protein

Uniprot

Uniprot term	Description
Q5ZI87	Tubulin-specific chaperone D OS=Gallus gallus OX=9031 GN=TBCD PE=2 SV=1
Q8BYA0	Tubulin-specific chaperone D OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tbcd PE=1 SV=1
Q9BTW9	Tubulin-specific chaperone D OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBCD PE=1 SV=2

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12612	TFCD_C	Tubulin folding cofactor D C terminal	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011989	Homologous_superfamily	Armadillo-like helical	Interproscan
IPR022577	Domain	Tubulin-specific chaperone D, C-terminal	Interproscan
IPR033162	Family	Tubulin-folding cofactor D	Interproscan
IPR016024	Homologous_superfamily	Armadillo-type fold	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12658	BETA-TUBULIN COFACTOR D	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000226	Biological Process	microtubule cytoskeleton organization	Interproscan
GO:0005096	Molecular Function	GTPase activator activity	Interproscan
GO:0006457	Biological Process	protein folding	Interproscan
GO:0007021	Biological Process	tubulin complex assembly	Interproscan
GO:0007023	Biological Process	post-chaperonin tubulin folding pathway	Interproscan
GO:0048487	Molecular Function	beta-tubulin binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K21767	TBCD; tubulin-specific chaperone D	-	Cytoskeleton proteins	ko04812	deepkoala