Gene detail

Detailed information of KAL9950835.1 in Oculina patagonica

Genomic Location: chr14:8553183...8560326
NR annotation: KAJ7383004.1, hypothetical protein OS493_031174 [Desmophyllum pertusum]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

ACROYT_G043400

ATGGAAAACTGGAGATATCTTGCTTTTCCTTGCCTTATTTTGCTATGCTGCCTAATAGAAGTGAACAGCGAGAAATCTGAAGATACAATCGACAAAACAAAATGGACTCCAAATCTGCGAGACCCAGTGAAGGTTGGTCACGAAGAGGAGGTGATGATATTTCCATTTCACAAGAGAAAAGTAAAGACCATCAGCATGAAACCGCCGATATTTGAGATTCCAAATTTTCTGACTGATGTGGAATGTGACCATTTGATCAGTTACGCCAAGCGCCTCGGTTTGGAGAAGAGTCCGTTACAGAAAGCTAACCAAACCATTGATGATGAAACATCGGAGAGGACTTTTAAAATCTGGGATAACAACAATGACGGATTTATAGAGCCTGTTGAGATTATGCATGTCCGTGGAAAGGAAGACCTATATTTCACTGAAGAAGATCTTCTTGAAATGTTCAAAGAACTTGAAATGGACAAAGACAATAACGGAAAGATCGATTTTGAAGAATTCAGCAAAGTAACTGTTCCAGTCATTAAAGATTACTTTGACAAAGTGCGCAGGACAAAACCTCGACTGCGCAGTCGCAACAGCCGACAGGTTTGGATGTTCCACAACGATCCCAAGTATCCAATCCTCTCGGATTTTCATGGCAGATTGTCGCGTTTAAGTCATCTTCCAGAAGAATTTATTAACAAAACAGAACCTTTACAGGTCGTCAAGTATGACGTTCATGGGCATTACCACTGTCATCACGACTCAGATGATCTTGAACAAGGCGTACCATGCTGCTCTTTCTCAGAAGATGAGGACTGTCGACTGTGCAGAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATGCGACTGA

Transcript

rna-ACROYT_G043400.t0

CAAACCTCGAACACAAATACCTCATTTATCACACGGTTACAAGCGAGAAGATCCTTGATTTTAAGCAAGCATGGAAAACTGGAGATATCTTGCTTTTCCTTGCCTTATTTTGCTATGCTGCCTAATAGAAGTGAACAGCGAGAAATCTGAAGATACAATCGACAAAACAAAATGGACTCCAAATCTGCGAGACCCAGTGAAGGTTGGTCACGAAGAGGAGGTGATGATATTTCCATTTCACAAGAGAAAAGTAAAGACCATCAGCATGAAACCGCCGATATTTGAGATTCCAAATTTTCTGACTGATGTGGAATGTGACCATTTGATCAGTTACGCCAAGCGCCTCGGTTTGGAGAAGAGTCCGTTACAGAAAGCTAACCAAACCATTGATGATGAAACATCGGAGAGGACTTTTAAAATCTGGGATAACAACAATGACGGATTTATAGAGCCTGTTGAGATTATGCATGTCCGTGGAAAGGAAGACCTATATTTCACTGAAGAAGATCTTCTTGAAATGTTCAAAGAACTTGAAATGGACAAAGACAATAACGGAAAGATCGATTTTGAAGAATTCAGCAAAGTAACTGTTCCAGTCATTAAAGATTACTTTGACAAAGTGCGCAGGACAAAACCTCGACTGCGCAGTCGCAACAGCCGACAGGTTTGGATGTTCCACAACGATCCCAAGTATCCAATCCTCTCGGATTTTCATGGCAGATTGTCGCGTTTAAGTCATCTTCCAGAAGAATTTATTAACAAAACAGAACCTTTACAGGTCGTCAAGTATGACGTTCATGGGCATTACCACTGTCATCACGACTCAGATGATCTTGAACAAGGCGTACCATGCTGCTCTTTCTCAGAAGATGAGGACTGTCGACTGTGCAGagaagaaggagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaatgcGACTGA

Protein

Uniprot

Uniprot term	Description
Q9NXG6	Transmembrane prolyl 4-hydroxylase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=P4HTM PE=1 SV=2
Q8BG58	Transmembrane prolyl 4-hydroxylase OS=Mus musculus OX=10090 GN=P4htm PE=1 SV=1

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13202	EF-hand_5	EF hand	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002048	Domain	EF-hand domain	Interproscan
IPR011992	Homologous_superfamily	EF-hand domain pair	Interproscan
IPR018247	Binding_site	EF-Hand 1, calcium-binding site	Interproscan
IPR045054	Family	Prolyl 4-hydroxylase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10869	PROLYL 4-HYDROXYLASE ALPHA SUBUNIT	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005509	Molecular Function	calcium ion binding	Interproscan
GO:0004656	Molecular Function	procollagen-proline 4-dioxygenase activity	Interproscan
GO:0005783	Cellular Component	endoplasmic reticulum	Interproscan
GO:0018401	Biological Process	peptidyl-proline hydroxylation to 4-hydroxy-L-proline	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K23445	CASQ2; calsequestrin 2	-	Cardiac muscle contraction	ko04260	deepkoala