Gene detail

Detailed information of PFX29752.1 in Stylophora pistillata

Genomic Location: Spis.scaffold61:373108...390781
NR annotation: no NCBI-NR hit recorded
Species Stylophora pistillata · all data for this species · gene families

Gene Structure

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Sequence

CDS

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Transcript

rna-Spis5481_mrna

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Protein

PFX29752.1

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Gene family

Family type	Membership / link
Orthogroup (gene family)	OG0008627 (this species only) · gene tree & orthology

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12661 all species →	hEGF	Human growth factor-like EGF	Domain	Interproscan
PF00008 all species →	EGF	EGF-like domain	Domain	Interproscan
PF02210 all species →	Laminin_G_2	Laminin G domain	Domain	Interproscan
PF07645 all species →	EGF_CA	Calcium-binding EGF domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000152 all species →	PTM	EGF-type aspartate/asparagine hydroxylation site	Interproscan
IPR001791 all species →	Domain	Laminin G domain	Interproscan
IPR000742 all species →	Domain	EGF-like domain	Interproscan
IPR009030 all species →	Homologous_superfamily	Growth factor receptor cysteine-rich domain superfamily	Interproscan
IPR013032 all species →	Conserved_site	EGF-like, conserved site	Interproscan
IPR018097 all species →	Conserved_site	EGF-like calcium-binding, conserved site	Interproscan
IPR001881 all species →	Domain	EGF-like calcium-binding domain	Interproscan
IPR049883 all species →	Domain	NOTCH1 EGF-like calcium-binding domain	Interproscan
IPR051355 all species →	Family	Notch and Slit guidance protein	Interproscan
IPR013320 all species →	Homologous_superfamily	Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45836 all species →	SLIT HOMOLOG	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0005509 all species →	Molecular Function	calcium ion binding	Interproscan
GO:0007411 all species →	Biological Process	axon guidance	Interproscan
GO:0008201 all species →	Molecular Function	heparin binding	Interproscan
GO:0048495 all species →	Molecular Function	Roundabout binding	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	Pathway	Map ID	Source
K16681	CRB; protein crumbs	-	Hippo signaling pathway - fly	ko04391	deepkoala

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.