Gene detail

Detailed information of XP_020601695.1 in Orbicella faveolata

Genomic Location: Sc7jCM8_1045:393592...400845
NR annotation: XP_020601695.1, proline-rich transmembrane protein 1-like [Orbicella faveolata]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

Transcript

rna-XM_020746036.1

CTTCAATCGTGTCAATCGTGCTGCGGTGATTTTAAAACCATCGTGGAAGAACTTTCTTCTTACGGCAAGTAGAGGAACATTACTCATTCCTGTTGTATGCTGATCTGATCTGGAGGCATTGCTGGTCAAGTGGACTTGGTCATTTAAGAAATGGCAGATAAAGCCAATGATTCTCAGCCTGCCACTAACAACAAAACAGATGATGGACCCCCACCAGCCTATAGCTATCCGGTAGATGCCCCACCCCCATACCCTCAGCAGTCTGGTTACCCTGGGCAACCTGTTCAACAAATCCAGCCTGGTTACCCAGAACCTCCTGGTTACCCTGGGCAACCTGGTTACCACGCACCACCTGGTTACCCTGGGCAACCTATGTATCTTGGTGCTCCTGTGGGTGGCTTCATGGTCTCAACAGCTCAACCTGGTCCAGCCTACATGGTGCAACCAGTGCCACAAGCTTCTCCCCCTGACTATCAGGGTTTGGCATGGTTTGCCTGCCTTTGTTGCTGCTGGCCTCTTGGTATTGTGGCAATACTAAAATCTAATGAGgTTCGGAACTCCGTGGCCCGAGGTGACTACAATGCTGCCACAATTGCTTCAAACTCAGCACGGAATTTTGCTTATATGGCTATTGGTCTTGGAATTACATTTTTTGTCATGTACGTCATTGCAATAGTTATGATTTTCACTTTTCTGAGTGTCCACTAATTTAAGTCAAGCCTCTCACTGAGTCAACAAGTACAAACTGTCATCAAAAGTGCAAATCTAATGATAACtagtatttaatattttttcattatctTAGCTAGCTACAATTTGTGGTTTTGGTTGAACTTCAAATGCTAATTATGTAGTTATTTCAATTTATGTGAGGTAGTTAAATGCATtgcaaaattttttcaaacctttGGCTGGCAGACATGTTATTTGCTACATGTCAGTTCTGGTGGTGAACAAAATTTCGGAATATGAAAAATAGAGTGAAGTAGTTTTAATTTGGAATCAAATTCacatattttttcattattttgttagtTAGATCAACTGAGGCAGTTTGTTCGAAAATATGGGCTAATCAagttatttaataatttatggTGTGTAAATTTTAACTTATATATTTAAGTAGGATGGTGTGATGTACCTGTAGTCTTATTTAGtggaaacatttatttcaagggaaaaagCATGACTgttatattttataattttttctccaattttttcatgatatttttattgtcaaaagCAACTCTGAAGATTGACAACAAAAAAGTCGAGACCTGACGTGATCTGTAAACCCTAATTTAGAAGGTGTTTTGCAAAACAGATACAATACTGGCTAGCTTTTCAGTTGTGGTTTatgttttgtcattgttttcttATGGAAACTTAATCTTTAGTACAATGTTGGACTTTTTTGTTGGTAAATGTAGAAGGTGGGCATGCAGGTTATTGTTAATCATTCAAACTTGAGCCCTCAGCCAATAATATTAACACATTTTGCATGTGTTTCTAGTCTTCatgatttaaaatattttagttttgtttatttgcatagCCTTATGCTCTACTCACAAGAGCAaggaggatgagtgagtgagtgagttttgtttgtgaatagacttaaaaaaatttcaaacttaattATTGCTACAGCTATAAATGTAGGTAGAATTTCTTCACCTTATTGTGCTTGTGGTTAATACCATTGGTTTTGTTGCAGTAGTGATAAATACTATCTCTAGCAAATGTTTCAGTCAGGGGAACGAGTACCAGTTGATTGATGAATTCCAGTCTTCAAGACTGGAACGAGGTCACAGCTTTACCATTAATTTGTTAAACAACTATATTCACACCATGATGGCATGACAATTGGGTGCTCGCGTTATTCGGTTCAGCAGAGGTtattttgtgaagaaaaaaaactggtttTTGTTCCCCTTTACCGGGTTGGGTCAGGTGTAAATTGTGCGTGTGATTACTCGTAAATTATAATGCTGAATTTTCCCCTGGGggtctcccatataaaaaagatgggttgctcatcataccttttagggattaaaagagtggtttggtacctcttaggtgttcagcctcaaaaggtccacagcaggaggtTTCGCAGGACCTTTTAGGATATGAGCAGAAAAGAATATGAGAGGAGATATTTGGCAATCAACTTTTATGAGTAGAAGGTGTTTAGAAACAATTGTCTTTATCACTGTTAAATTTACATCCTAGATAAATCTGTGGTACATCTtgagggtgaaaaaaaaaatttcaagccacacccacaaatcAGGATCTTGCTACctattttttcaacatttcagtTGAGGACCCCTGTCCTGTTTATATGGGAGTCACCGGGGAAGGGGGGAATTTTCATGGAAGTCAGATAAGGCgtataaaaatacatttataacaAGACA

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04505	CD225	Interferon-induced transmembrane protein	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR051423	Family	CD225/Dispanin domain-containing protein	Interproscan
IPR007593	Family	CD225/Dispanin family	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR14948	NG5	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K23896	PRRT1; proline-rich transmembrane protein 1	-	Transporters	ko02000	deepkoala