Gene detail

Detailed information of XP_065066787.1 in Rhopilema esculentum

Genomic Location: ScUbCFx_5:7300416...7334265
NR annotation: no NCBI-NR hit recorded
Species Rhopilema esculentum · all data for this species · gene families

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Sequence

CDS

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rna-XM_065210715.1

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Protein

Gene family

Family type	Membership / link
Orthogroup (gene family)	OG0007726 (this species only) · gene tree & orthology

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00651 all species →	BTB	BTB/POZ domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011333 all species →	Homologous_superfamily	SKP1/BTB/POZ domain superfamily	Interproscan
IPR000210 all species →	Domain	BTB/POZ domain	Interproscan
IPR044515 all species →	Family	Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46231 all species →	ANKYRIN REPEAT AND BTB/POZ DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0005515 all species →	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0000151 all species →	Cellular Component	ubiquitin ligase complex	Interproscan
GO:0005737 all species →	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	Pathway	Map ID	Source
K10520	ABTB1, BPOZ; ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1	-	Ubiquitin system	ko04121	deepkoala

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.