Gene detail

Detailed information of XP_065660698.1 in Hydra vulgaris

Genomic Location: NC_088928.1:7420408...7468611
NR annotation: XP_047132066.1, Fanconi anemia group M protein isoform X1 [Hydra vulgaris]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

LOC105847408

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Transcript

rna-XM_065804626.1

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Protein

Uniprot

Uniprot term	Description
Q8IYD8	Fanconi anemia group M protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FANCM PE=1 SV=2
Q8BGE5	Fanconi anemia group M protein homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Fancm PE=1 SV=3
A0A1D5PRR9	Fanconi anemia group M protein OS=Gallus gallus OX=9031 GN=FANCM PE=1 SV=1

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00271	Helicase_C	Helicase conserved C-terminal domain	Domain	Interproscan
PF00270	DEAD	DEAD/DEAH box helicase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR014001	Domain	Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain	Interproscan
IPR001650	Domain	Helicase, C-terminal domain-like	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR011545	Domain	DEAD/DEAH box helicase domain	Interproscan
IPR044749	Domain	FANCM, DEAH-box helicase domain	Interproscan
IPR039686	Domain	FANCM/Mph1-like, insert domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR14025	FANCONI ANEMIA GROUP M FANCM FAMILY MEMBER	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0000400	Molecular Function	four-way junction DNA binding	Interproscan
GO:0009378	Molecular Function	four-way junction helicase activity	Interproscan
GO:0036297	Biological Process	interstrand cross-link repair	Interproscan
GO:0043138	Molecular Function	3'-5' DNA helicase activity	Interproscan
GO:0045003	Biological Process	double-strand break repair via synthesis-dependent strand annealing	Interproscan
GO:0006281	Biological Process	DNA repair	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K10896	FANCM; fanconi anemia group M protein	-	DNA repair and recombination proteins	ko03400	deepkoala