Gene detail

Detailed information of XP_065666259.1 in Hydra vulgaris

Genomic Location: NC_088930.1:14081559...14154004
NR annotation: XP_047136231.1, protein DD3-3 isoform X1 [Hydra vulgaris]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

LOC105848472

ATGTTGTTTAAATTGTTGCTGGTAGTGATGTGCACACTGGTACAATCAGATGTTTATTTACACAACCCAAGAGGGAGCAACAATAGACTTGATGACCTAGGAAGAGAACGTAATAATGCAAATCGGATGTTCAATTCTCAAAATAACAACCGTGGTGGATACAATGTTGGAAACATGATATATTATGAAGGATCACAACTTACAATTGAGTGGACAAACCAACATTCTTGTGGTGGACCAAATGCTAATTGTGATATCATTGTTCAATATATGTGCAGTAATAATCTGCGCGATGGCACTACAACAAGCACAATTCCTGATTGGTTTCCAAATGATTGTGCAAACAATGATTGTACCACTGATAACTCAAAGTATGGCATGAATGAAGATTATGACTACTACTTAAGATGCATAAAAACAATGAGAAACAAAGGGTTGTTAACAGCTGATCAGAAATTGAATGGAGACACTGCACAGTATACTCGTCAAAATAGCGGAGGTACTCGTTATGGATATGAATGTCAAGAAGAAAGAGACTACTATCCCTATTGGAGGCCTACACCTTGGAAGGATATTGTTGTGATGACAAATGATAAGAGCCGTTGTGAATTTTATAAGAGTGAAAGTGAGAATGTGAAATCAAGGTTCATTTGCCAGCCGCCAGATGGTTATATGGATGCCCTGAAAAATTGGAAAGCATGGACATACTTACCAATTACAAAAGAAAATTGCGAGAAATTAGAATGGCCACAGGGCTCTGGAAAATTTTCAAAATGGATAGAAATAAAAAGTAAGAATATAGACCCACCAGATTGCATTCAATCACCTATGTCTCGAGATAATCATAATGGAAATGGACCTGGAGGATTTGCTAACACATACAACTGGACAATACCAAAAGATATTAGTGAGAATTGTGCACTTCGTCTGCGCTATAATATTTCAACTGGTGATTTGTCAAACTACATTACCAGTGAAGTACAAGTTGCCAGTGTATGTGAATGGAGCACTCTTACACTTAGTACTAATGGTCTTGGAACACTAAAAATATTAGAGGCAAACTATGGTCGAACCTCATCAACTCTATGTGGCAGCAACCCCAGTTATAACACAAAATGTAACAATCAACAAAAGTCACTCCAAATTGTTAAAAGTCTCTGTGAATCTCAAACTTCTTGTTCTGTTACTGCTTCAAATAATGTATTTGGTGACCCATGTGTAGGAACATACAAATATCTTGAAGTGAAATATACTACTACAATAGTAACAATCGGACCTTTAGTTGGACTATCAGACACTGAAGCTAATGATAGAGGATATGTTTTTAAAAATAACCCTGTGGTCCAACCATTGAAAACAGGTAATCCTTCTTTGGATGCAAATCTACAGTTACGACTAGCAATTAACACTGCTCAATATGGTAGAACATTTCAAGATAGGAGTCATCGATTTATAATCAGACCACGTCCATCTGGATTTGAAAATGTTAATATTTACAATTTAAATGTTCGTGGTAAGCGAGGAAATATTGTCCAAGTATATCCAGCAGTTGAATATGACTTTGTTCCAAATCGTCTAATTGTATCAGCTTCAGATGCCGTGCATATACAGTGGACAGGATCTAATACAAATCCAACTGATAATGCTGGACAAGGCACAGCTGGAACTGATCGCTCGAACATTATTTTATTAAAAGATCAAAATTACCCAGAAGGCAATCTTGGGCAAGCAGTTCTACCTGCTTATAAGAATGGTCATTATGGAAATAACTATCCCATGTTTTTAAACACATCAAAAAGTTTCTTAGGACTTGGTTCAAATGACGCCAATCTGCTAGCTTTTTTAAATACTGATTTAATCAGTCCAAATCCTTTGCTAAACGATGCTCCACGATACTTCAATATGGGTCTTCGTCGTTTGTCAAATAATGCAGTTGGAACTTACTATTATATGTGCACTAGAAATAATAACTTTTCAAATCGCAGTCAAAAAGGTAAAATAGTCGTTTTACCAGAAAGAAACACTCCTGTTTTGCCACAGATAACTGGCGGTAACGCTTTACCGCAAACGAACCGTGACTGGTCCAATCATGATACCAAGACAAGCCATACGAAGAAGCAGTATCACCTGAATAAATCAGTTTTAACTCAAAAGCGCAATAAACCAATTTCCGTATAG

Transcript

rna-XM_065810187.1

acttaACAAAcgagtaatttatttaaatatttaaataaacaatggcattttttagcattttcatACTTTGAATTAaactttctatatatatataatccttTAAACTTgcatataagtttaaaaaagtaatatgttTAGTTAATATTAAGACAGCAAAGTAGTAGTCAAACAAGTAAAAAGAATTTGCAAAGATTTTAAACAAGAACAACACAATGTTGTTTAAATTGTTGCTGGTAGTGATGTGCACACTGGTACAATCAGATGTTTATTTACACAACCCAagaggGAGCAACAATAGACTTGATGACCTAGGAAGAGAACGTAATAATGCAAATCGgatGTTCAATTCTCAAAATAACAACCGTGGTGGATACAATGTTGGAAACATGATATATTATGAAGGATCACAACTTACAATTGAGTGGACAAACCAACATTCTTGTGGTGGACCAAATGCTAATTGTGATATCATTGTTCAATATATGTGCAGTAATAATCTGCGCGATGGCACTACAACAAgcacaaTTCCTGATTGGTTTCCAAATGATTGTGCAAACAATGATTGTACCACTGATAACTCAAAGTATGGCATGAATGAAGATTATGACTACTACTTAAGATGCATAAAAACAATGAGAAACAAAGGGTTGTTAACAGCTGATCAGaaattgaATGGAGACACTGCACAGTATACTCGTCAAAATAGCGGAGGTACTCGTTATGGATATGAATGTCAAGAAGAAAGAGACTACTATCCCTATTGGAGGCCTACACCTTGGAAGGATATTGTTGTGATGACAAATGATAAGAGCCGTTGTGAATTTTATAAGAGTGAAAGTGAGAATGTGAAATCAAGGTTCATTTGCCAGCCGCCAGATGGTTATATGGATGCCCTGAAAAATTGGAAAGCATGGACATACTTAccaattacaaaagaaaattgcGAGAAATTAGAATGGCCACAGGGCTctggaaaattttcaaaatggatagaaataaaaagtaagaaTATAGACCCACCAGATTGCATTCAATCACCTATGTCTCGAGATAATCATAATGGAAATGGACCTGGAGGATTTGCTAACACATACAACTGGACAATACCAAAAGATATTAGTGAGAATTGTGCACTTCGTCTGCGCTATAATATTTCAACTGGTGATTTGTCAAACTACATTACCAgtGAAGTACAAGTTGCCAGTGTATGTGAATGGAGCACTCTTACACTTAGTACTAATGGTCTTGGAACACTAAAAATATTAGAGGCAAACTATGGTCGAACCTCATCAACTCTATGTGGCAGCAACCCCAGTTATAACACAAAATGTAACAATCAACAAAAGTCACTCCAAATTGTTAAAAGTCTCTGTGAATCTCAAACTTCTTGTTCTGTTACTGCTTCAAATAATGTATTTGGTGACCCATGTGTAGGAACATACAAATATCTTGAAGTGAAATATACTActacaATAGTAACAATCGGACCTTTAGTTGGACTATCAGACACTGAAGCTAATGATAGAggatatgtttttaaaaataaccctGTGGTCCAACCATTGAAAACAGGTAATCCTTCTTTGGATGCAAATCTACAGTTACGACTAGCAATTAACACTGCTCAATATGGTAGAACATTTCAAGATaggaGTCATCGATTTATAATCAGACCACGTCCATCTGGAtttgaaaatgttaatatttacaatttaaatgttcGTGGTAAGCGAGGAAATATTGTCCAAGTATATCCAGCAGTTGAATATGACTTTGTTCCAAATCGTCTAATTGTATCAGCTTCAGATGCCGTGCATATACAgtggaCAGGATCTAATACAAATCCAACTGATAATGCTGGACAAGGCACAGCTGGAACTGATCGCTcgaacattattttattaaaagatcaaaattaCCCAGAAGGCAATCTTGGGCAAGCAGTTCTACCTGCTTATAAGAATGGTCATTATGGAAATAACTATCCCATGTTTTTAAACACATCAAAAAGTTTCTTAGGACTTGGTTCAAATGACGCCAATCtgctagcttttttaaatactgatTTAATCAGTCCAAATCCTTTGCTAAACGATGCTCCACGATACTTCAATATGGGTCTTCGTCGTTTGTCAAATAATGCAGTTGGAACTTACTATTATATGTGCActagaaataataacttttcaaaTCGCAGTCAAAAAGGTAAAATAGTCGTTTTACCAGAAAGAAACACTCCTGTTTTGCCACAGATAACTGGCGGTAACGCTTTACCGCAAACGAACCGTGACTGGTCCAATCATGATAccaaGACAAGCCATACGAAGAAGCAGTATCACCTGAATAAATCAGTTTTAACTCAAAAGCGCAATAAACCAATTTCCGTATAGTGGTTgctttatgtaaaatttaaattgaataatgtCAGGCACATTTACTATCagttgatttaagttttttaagcaaATCTTACGAAGTCCTACGAAAAGTTATAACTGGTGTAATagcttttaatacttttatatctgcaaataaatttttctacaaacaataatgtttgtttggtttttcttaatttacttaattattatttttattatgtatttatgcACAGTACTtgtatttatgaatttttttaagaactaatactttattaaattgtcaa

Protein

Uniprot

Uniprot term	Description
Q58A42	Protein DD3-3 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DD3-3 PE=2 SV=1
C0HK24	L-rhamnose-binding lectin ELEL-1 OS=Echinometra lucunter OX=105361 PE=1 SV=1
P86177	L-rhamnose-binding lectin CSL1 OS=Oncorhynchus keta OX=8018 PE=1 SV=1

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02140	Gal_Lectin	Galactose binding lectin domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR043159	Homologous_superfamily	D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin domain superfamily	Interproscan
IPR000922	Domain	D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin domain	Interproscan
IPR053320	Family	Protein DD3-3 O-glycosylation	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR35170	PROTEIN DD3-3	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0030246	Molecular Function	carbohydrate binding	Interproscan