Gene detail

Detailed information of XP_065672997.1 in Hydra vulgaris

Genomic Location: NC_088932.1:22423163...22448710
NR annotation: XP_012565924.2, endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175 [Hydra vulgaris]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

Transcript

rna-XM_065816925.1

GTTGACATACATTGTGTTTTGTAGATTAGTAGGCATAGTGACATATAATCTATGAACCCAATCTGCGACACTAATTGGAAGATAAAAAGTATTCAGAAATATTCATTgctaatttaaaatgaatattattaattacaaaaacttCGGAAAATTACACAGAAAAGCGTATTAACTATGCTGACATGAATGTTTCTATCAAAAAAGGCAGATTGtgacatatttaaaaagtgttaataaTTCGCGTGTAGTTTATgcagaactatttttttatatatacataacttaCAACAGAAATAGAATGAGTTTAGAAACAGCTGAAAATGTTAACGGCTCAAGCGAAAACATCAGAAAAAGAAGCTCGTGGAAAAATACAGAGGAAAATTATgaagaatatttaaacaaaaccatCCCAAAAGATCTTCATAGAGGAGATATTGCTTCAACAGCAAGATTGTTGAGTTATTCGGACACCGTAATGGCGACTTGTGCAACATTTCTTGTACTTCCAATacgaaatttgaaaaaaatttcaggaaACCAATCTCtttcagagttttttaattcaagctACCTCCAGTTTATAgaatttttgtttggttttttaattattttaacagtttGGGAAAATATGAATATTCGTGCAATAGTAATTAAACGGGTAGATGATCTAATTTTAGCTCTTATTATTTTCGAAATGTTGGTTACCTCCGCACTCCCCTTTACTGTAGAACTTCAAGGTCATTATCCCaatgaaaaaatttcagttttatcaACGtgcattgttttaataattcttcaaaTAATAGACATTACAATAGTTTTATATGGCACGTTTTCACCAAAACTTTTgcatttagatttaaaatgttGGTCAAAATCAGATCTACGTGAATTAGCTTCAATAATGCTGTTTAAGCCGTTAATTAGTTTGATTTTACTTGCGATTGCTGCGGCATTTTGTTTGGTTCATTATGGATTATCGTGGGCAATTATTGCATTGTTAATCCTAATGCCCACAATTCGAAAATTTTACTGGTTTGTTTGccgaaaatataaaaaaaacgacgcaacagaaaaagaattttttttagaaaacttttcAAAAGGGAACGTTTCAAAAGAACGTGTTGAAAATATGAGTGATAATGCAATTGCTATCATGGCATGTATTCTTGTTGCTGATATTACGGTTGACGAGTTTCCAAAAAAAATCCACGTTGAGAAGGACGGCCTTAACTACAACTTGAAACTTATGACACCTGAGTTTCTTACGTTTCTCGCGTCGTTCTGTTTAGTTTCGGCTTTATGGTACGTCAATCATTCTGTtctacatttaattaaaaatgtaaattccgttatgctttattttcaaaaagtatttcttATGTTTTGCTGTCTATGTCCGCTAGCTGGAAACACAGTATTGCATTATGCAACCAAAGGAAAAAAGGATTCAATTGTTGCTATTCGTTTTTCTGCAACAGTTGTATTTATTTCAAgtatagcaaatttttttatttttttgtgtggtGTGCTTACtggaacaaaatatttttatgattgggcttcattaaaatattttaagaaaaataaacagcaacatttttacgctgtggcaaAAGCAGTAAATTTACCATTTTGGtcattaatttgtattttaggaAGTTTGGGCTCCGCTTCTGCAGCGCCTTACGTTTTGTACGTATCATTCCTTGCTGCACCGTGctcattttttgtttcaaaattagttCTCATGAACCACTTTGGTAAAGCAGCAGCATATGTCAGGAACACTATACGACGTAAAGAGCCatttcctaaaaaaaagaaagaagaagaCTCTtctactacaaaaaaaatatcaaagtcaTTAGAAACAAGATATCCCGATAGTTACGTCATTAAAAACGAAAACTTGAACTAAAaccgccattttttttttattaacactaaATTGCTttcgttttatttaaaaacaaatttaaaaagttaaataaatataatcgaCTAACCTGACTTAGCTTATGAATTGGTTGGaagtattttagtttacatGTAAATAAGTGTTTGCttcaatttagaaaaaaaaatgacctctgatttattgaaaaaactgaATTGAATTTATATCAAAACATCAATATAAATTATGCTTTACGTATATATGGTTAGAGCGCTGGACATAATTCGCACcatcggtaaggaaggaggcgtaaactttctagtttttactatatactatttaagttatttttttgtttggaaGTATTGattgaaaaatacttttaaattctttatcaCATATCAACAGCAGCGAAGGGTTGAATTTTATAGCATATTAACCAGGGTAATTTTATGGCTTATTAAACAGCAATTGGGTTGATTCTTTTAgataatttgatttgaaaacGTTGTATAACAATcagcaatttattattttgttcaaaGCGAATTTTTTTCTTCGCttactttataactttatattatatattagtatggattcttattttttatcaattggattttttggttttta

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF06736	TMEM175	Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR010617	Family	Endosomal/lysosomal proton channel TMEM175-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR31462	ENDOSOMAL/LYSOSOMAL POTASSIUM CHANNEL TMEM175	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005267	Molecular Function	potassium channel activity	Interproscan
GO:0015252	Molecular Function	proton channel activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K24915	TMEM175; TMEM175 potassium channel family protein	-	Transporters	ko02000	deepkoala