Gene detail

Detailed information of anas_s0327.g4.t1 in Acropora nasuta

Genomic Location: sc0000327_pilon:119276...126451
NR annotation: XP_028398335.1, kelch-like protein 12 [Dendronephthya gigantea]

Gene Structure

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Sequence

CDS

Transcript

anas_s0327.g4.t1

NNNACAAGAATTAAGTGATAGCAAAACAAAAGTGAAGATTAAAATAATGTTGCTTTTTAGCCAATGAAGAGAAAGCGGAGATATGTTTGTGCAGTGGCTCTTAACAACAGATTGTATGCAATTGGAGGCTATGATGCTTCCAGTCGTCTTAATACTGTGGAATGTTTCGATCCCTTGTCATCTCAGTGGACAGTCATGACTCCTATGTTGCAAAGGCGTGGGTTGGCTGGAGCAACCACGTTAGCAGGAAAAATTTACGTAGCTGGTGGATTTGATGGTACAACAAGGCACACAAGTGTGGAATGTTATGACCCAACTATAGACAGATGGACAATTGTTGGTGAAATGCAAGCTCCAAGAGAAGGTGCAGGGCTTACTAACCTTGATGGTGTGCTATATTGTGTGGGTGGGTATGATGGCAACCATGTACTGAGCAGCATAGAGAGGTATGATCCAAGGACAGGTCAATGGACTGGCTTGGCTCCTATGACAGCCAGAAGATCAGGGGCTGGAATAATTGTCCTTGAAAACCAAGTGTTTGCCATTGGAGGCTATGATGGCAGTCAGCACTTGTCATCTGTGGAATGCTACAGTGCATGCAGCAATCAGTGGATGAGTATTGCATCAATGCAGTCCAACCGTTGCTATGTGGGTACAGCAGTAATGAGTGGCAAGTTATTTGCCACTGGTGGCTACGATGGTTTGTCACTATTAGACTCTGCTGAGAGATACGATCCATTGTTACAGGAGTGGACTTCAATCAGCTCTATGGCAACCAGTCGTTGTGACATGGGAGTTGCTGTACTTTTATCAGAGTGAAATATCATTAATATTTTGGAAGATTTTATTGTGCATCATAATTGTTTAGAGGGTATTTTATTATTTAATATTGTCGTTTTAAACTCAGAGAATAGAAAACATCCCGTTCTTTGGTGGAATTAACATTACTAAAGCCCTTCACCCAATTATAATGAAAAAGGTTACTTCTTTGTACAACTGCGACTAAATAGTCAAATAGTTTTAAAGTGCCATCGTCCTTCATTATTGTGTATTTGTTTTTCTAATTTTTTTGATTTCCAGACTAAAAAAATCTCAGGTTTTCAACCATTTTTTCATATTCAGATAACTGCAAAATTGCACCTTTTTGGCAGCCAATGCAGCTAAGAATTGAGTCCTGGCTTCCAGAATTTCACACATGGTCGCTGGTGGGTTACTCGCATTGCTACCACTGACTAGAATGTTAAGAAAAAGTGATTGAGAATGAAATTTTGAGACATTTTCTAATATGTGTCTTACATTTTGCTCTGTTGATATATTTTAACTGAAATTAAAATTATTCTCCTGATAACAACTTCCATCTCTGTGCAAAACAAATTAATGAGAATTGCTGCCTGGCTGTCATGTTCCTGTTTTATTTTTCAGTGGAATGGAAGAAAGTTTTGGTACCAAAATTCCCTATATTTGCAATATTATTGGTAACCAAAGAATTGTCTTAAGGGACTATGAAATATTTTCAGGGGGAGGGAGGGACTGAAAAACCAGCCTTACACAGAGAAATATTATGTATTGCCCCCTGCCAATGAGGGTAAGTTTAGATCTGCCCCCTCCTAATCTTCTAAATATTTTAACCAGGCCCCCCATCACCCAAGGGAGGGGACACTCTTTCTCTTGgttactttttatagtggagcatcatccccttctctgtgaacctggatgtgcccatatcatcttacttacaaataaactaaaaGTaaaaaaaagtgtagcagctttatttaatgtcgataacttgtaacagtaatacaactgacaaacctgaggttgacagtgcactcattttactcccccctctccatcagagctctgttttacaagtatttgaagctacttaaggatggaacggaaagaagttgaagcaaggatgtgagatgcgaggatcaatcttggcacatcctgcacaaaggctgtgcacagaccgactgtgccatcTCttaaaatgtcatgtgaccaaataggtgaattgctcatggctttggtactaattactgtcagttatttgttatatttttcttctcttttttttcactaaatcatgctttattgagagcaaatcagtctgttggtgagacagtaagttagtggtattagcctgctcacaaaaaAATTAGATACAACCCTCCCTCTTTTCATTTACACATTTACATGTTACCCCCTCCCTTAGGCTATAAGTCTATACGCACATAATAACTTTATGTTAACTTT

Protein

Uniprot

Uniprot term	Description
Q5U374	Kelch-like protein 12 OS=Danio rerio OX=7955 GN=klhl12 PE=2 SV=2

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01344	Kelch_1	Kelch motif	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006652	Repeat	Kelch repeat type 1	Interproscan
IPR015915	Homologous_superfamily	Kelch-type beta propeller	Interproscan
IPR011043	Homologous_superfamily	Galactose oxidase/kelch, beta-propeller	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24412	KELCH PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan