Gene detail

Detailed information of pspe_0.1.m1.31292.m1 in Pachyseris speciosa

Genomic Location: Sc0000243:761062...769976
NR annotation: CAH3035850.1, unnamed protein product, partial [Porites lobata]

Gene Structure

More details in Jbrowse

Sequence

CDS

pspe_0.1.m1.31292.m1

ATGACGTCACGAGTTTCCGAGGAGACTTATATGATTATTACAACTCGTGCTTTCATACGTTTCGTTGTAGATTGTCCATCCCCACTGAAATCCGTGACTAAAGTGATCACCCCAAGGCAGGATCCGATGAAAGAGCCGAGTGGATATTCCATTCCTACGCGATCGATCAAGAAGAAGGTCTCCTTTGCTGACGCTGCTGGTTTCACGCTCGAGAACGTGAAAACCATATCTCCAGACAATAGCGAAGATGACGTGACTCTCAATAATACAACCCTGACCAGCGAGGACTGTGGCTTGGAGATGCATTGTCCGCGGCGTAGGACGAAATTCCTGTCGCCATGTTTTGTTGAGCCTTGCAAAACGGATTCTTTCATGGAGCGCGTCTTCCAACAGAACGTTTGCCTCGAAAGCGTCTCTTGCAACGACTTGGTTGTTACGGGGATCATTCGAGTGACAAACATTGATTATGCCAAAGAGGTGACAGTGAGATTCACGTTTGATGGCTGGAACAGTGTCCGAGATATTTGGACGGATTATTTGTCGTCAAATGTAGATGGAAAAACGGAACAATTTAGTTTTCGAATCACAGTTCCAGTGGATATTGAAGTTGACTTTGAAATCGAATTTGccattcgttatcgtgtggcCGAGTATGAGTTCTGGGACAACAACTTCGGGAGAAACTATAAGAGTGATGGCCAGCAACGCAAGAACACCGAGAACTTCCAAAATCATGACCACtactactactactactactactactactactactactactactactactactgctactatcactactaccactactaccactactaccactactactactactactactactactactactactactactgctactgctactgctactactactaccactactactactactactactactactactactactactactgctgctgttactgctactgctacttctactgctgctactactactactactactactactactaccactactaccactactactactgctactactactactactactactactactactactactactactactactactacttctactactgctgttactgctactgctacttctactgctgctgctactactactactactactactactactactactactactactactactactactactactactactttcaCTACTAccagtactactactactactactactactactactactactactactactactgctactactgctactactgctactactactactactactactactactactactacgactactactacgactactactacttctactactgctgttactgctactacttctactactgctgttactgctactgctacttctactgctgctactactactactactactactactactactactactactacttctactactgctgttactgctactgctactacttctactactgctgttactgctactgctacttctactgctgctgctgctactactactactactactactactactactactactactttcaCTACTAccagtactactactactactactactactactactactactactactgctactactgctactactgctactactactactactactactactactactactactactactactactactactacgactactactacttctactactgctgttactgctactgctactacttctactactgctgttactgctactgctacttctactgctgctactactactactactactactactactactacttctactactgctgttactgctactgctactacttctactactgctgttactgctactgctacttctactgctgctactactactactactactactacttctactactgctgttactgctacttctactgctgctgctactactactactactactactactactactactactgctgctactgctactgctactgctactgctactgctactgctactgctactgttgctgctgctgctactgctactactactacccctaa

Transcript

pspe_0.1.m1.31292.m1

Protein

Uniprot

Uniprot term	Description
Q8BRJ4	Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ppp1r3e PE=1 SV=2
P0C7L8	Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Ppp1r3e PE=2 SV=1

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
--	--	--	--	--

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR038175	Homologous_superfamily	CBM21 domain superfamily	Interproscan
IPR005036	Domain	CBM21 (carbohydrate binding type-21) domain	Interproscan
IPR050782	Family	Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12307	PROTEIN PHOSPHATASE 1 REGULATORY SUBUNIT	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0000164	Cellular Component	protein phosphatase type 1 complex	Interproscan
GO:0005979	Biological Process	regulation of glycogen biosynthetic process	Interproscan
GO:0008157	Molecular Function	protein phosphatase 1 binding	Interproscan
GO:2001069	Molecular Function	glycogen binding	Interproscan