Gene detail

Detailed information of pspe_0.1.m1.32860.m1 in Pachyseris speciosa

Genomic Location: Sc0000267:408637...415561
NR annotation: XP_015754659.1, PREDICTED: TNF receptor-associated factor 5-like [Acropora digitifera]

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CDS

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pspe_0.1.m1.32860.m1

GAACAGATGCCACAGCATGCCGACACATGCATGAAGCAAGAGATCATGTGTCCAGATTGCAAGAAATCTGTAATGCGTGACTTAATGGACCACCACCGTTCATCCCTATGCTTTCATGCGAGGGTCCTGTGCCCTCTAGGCTGTGGGACATCATTGCCAAGAAGCCATACCATTCTGCACATGAGTAACTGCAAAGAGAAAGCCATCAGATGCCATGTGCCTGGGTGCTTGAAAGTCGTTAAGAGAACAAACATGAATTTTCACATAGAAGAAGCAGCATCTAGCCACTTCAATTTGCAGTCAGGGGAAATACAAAGGCTGCGTCGTCTCCTTAGTGATGGGAGTCTTAGTAACTACAACCCAGCACCCAAGGAAGAGAAAGTTGTCTCCTTCAACTGGAATGTGAGAGGTTTTATGTCCCTACATCCAGACAATTTACAGCCCCTTACAAGTAGAACAATGACCCTGGGAAGAAACAAGTGGAGGGGCTTGTACATGGCAGAAAAAACACTGATGTTGCAGCTGGTCTCAGCTACTGCTCCACAGACAATTCAGATACGGATTGTGATGAGGCCTGGAGAACATGAGGAGCATACCTTCATTCTCCAGCAAGAAACGCTGAAAGAAGGAGACATGCCGGGGGTCAGCATGGCTGACATGAATAAGTGGGTGGACAGTGATGgagaaattaatattaaatttattattgttcATCTGCAATTTTAGGCATTTAAATTACTTAGACAAAGGCTTTATCCTAAAGGCTTTATCCTAACAACCCaggagagagagaagagagtcTAGCTTGAAACATACATAAAGCCCATGTTGCTGTAGTTTCATTAAGATTGAATGACATTTGGTAagataaaaaatgaaaatgttagTTCTGTCCAAAATGGTCCTGGTGCCATGTTATGCCTCGTCAGATGTCAGTTTGAAGAGCACTGCTATAAGAATTCTGATGACATTCAATATTGTGCAATAACCACTGATGAAGTAACCACCTTTTACACAAAAActtaaatatttgaaacaagagGTGACattccaaaaaaagaaaataaaaaggtTTTCCAAACAAGCTTCAGTTATCTGTTACCTCATAGACACTTGAAATCAAAAGACCaattaacaaaggaaaaagTGAGGAGTTGTTTGCTACACTCCGAGTTTACCAACATTTGTCAGACATATTGGTTTATAGCAATCTATGTTTCTTAATTACTACTTATCAAAATTATAGTTCAAGGCTGaattgctcaaagcatggttagcgttaaccattggttaagatatATTACagcctataggttgtcatggtatttaaccctggtcaGCGCTAACCAAGCTTCGAGAACCTGGGCCCTGAAGAGTGGTTACCAGTAAATTATTAATGAGgtattaaaaaacaaactcaatgCATGCCACTCCAATTAGTTGAAACCTTGGAACAAAAATGCAATCCAACTCAACCAGCATGAATGCCTATTAAGTAtagagtttctttttttttttttttttttgaaaaataaattgtaaGGCCAGATGAACACTTTGCCCTTTGCAAATAGCTCCTTTAATTCGTTTTTCATTATTGAAGGCTCAGGAATAATATGAATAATTGTCTCAATTACAAATTAATCAGTTTAATTCTGTAGCTTGTATTTACCTTATATAACTATTCACTTTCTGGGGTCAGGAAGAGCCTGGCTTTGGTAAAGCTCACAGGGGCTTTCCTGTCTCCATGAGtctgagaaaacaaaattaaaggcAGAGCATAGATGTGCAGGtgtttgatggactggaaccaAATTTTTCAGTAGCATAacctgatgaaaaaaaaatatcagtCAAGGGTCTATGTGTACAAAGGCAGAATTGCAAGTCAAATTTACTCTCTGTACAGCCTGATAAATAGTTAATATTATTCTCTGAAGTgaaggtgaatagtggtggatatttacagAGCCATGAAGCGGCGAGGTAACTACtgtatccaccactttcaccgacactgacgtgaataattgttttagtatataccacacatgtTAAATAATCAGCAATTGAAAATTGGTTAATTTCACCTTGCTGTTGGAACCATGCTGCAAAACggtaaatatttcattttatttgcttatATAGTGTTCTACAGTTCATGTACTTCTTCTATGCCTTAAAATTTTAGTTTGGAAAGATTAATAAACAACTCAACATTAAATACAGTGAAGCAAAATTTTTTTGccaatttgtattttttggaACAGCCGGCTAGTTCATTGATAAAATTTTGCTTCTCAGTAACTGAAGCGAAACGGgaagccattttgtttttctccatttgctagtacttgctattcacctccaagctagccaatcagaatgcgaggAAAGCACTCtttacttgtgtggtatatactaattggGAATATCTGGTACTTATTATGGTCAATGTAACAAAGAAAAGCTAaagaactggaacaaaatagTCTGGATCTAAGTGTATTGCGACCATTTATTGGTGTTATTGATGTCTGCGTCGTTTTAAACTGACTTTCTTGTTCTCTTGCTTGAAAACCCTAATATTAATTAAGGCCCCACTTTCAAGTACTGGTACTAGTATCTATTTCTGAACTCTGATTATAACAGTTAAAGATGGCCACGGTGCTGAACTGTATTTTACACCAAGAACATGTTTAAGATAAATTCCAGAAATTGTCTGTTGTAAATTAATCGCTAGCTGCTTTGATGTTAAGTGGATGTTTTGTGAAAATACAAATAATTTAAtattaagcttaaatatttCGATCAGTC

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02176	zf-TRAF	TRAF-type zinc finger	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001293	Domain	Zinc finger, TRAF-type	Interproscan
IPR013083	Homologous_superfamily	Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10131	TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0008270	Molecular Function	zinc ion binding	Interproscan