Gene detail

Detailed information of scaffold171.g32.t1 in Morbakka virulenta

Genomic Location: scaffold171:1039932...1082692
NR annotation: XP_047126984.1, uncharacterized protein LOC124808033 isoform X2 [Hydra vulgaris]

Gene Structure

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Sequence

CDS

Transcript

scaffold171.g32.t1

AGTTTTTAATTCTTGTCAAGTGACTGTAATTTAGTGTCAATGCAGAAATTTGAAGATCTTGCATCGGAGAACGAAGTGATCTGAAAAATAACTGATAAAAGTTTTGGATATCCATTTCGTAAATGCGTTACTCACAGATCCTAACAGCTCTGTAATTATGAAGTTTCTATGCCTGTGGTTCTCGTGTTTTCAGGTCTTGTTACTGCTGCCTTGGTCAACTGAACTTTCCGGAGGGCATTTAAAGAATTCATGGTCATTTTTAAGTGATTCTGAATCTTACCTGAAGATAAATGGAAGTACAAACATTGGCAATACTCTTAAGTTGCGCTTTAAAAGTCATGATTATAATGCTCGACTTTTGGGTGCTAAACTTGGACAACATTGGCTATCTTTAAATTTAGATGGTGGGATTTTTTCTGTTATTATTGATGGGAAAAGAATGGTTGTACCAAAATTAAGCAATGTGAAGGTTAATGATATGGAGTGGCATAACGTTAAGCTAGTTATAGATAAAAATGGAGGTCTTACACTGTGGTTAGATCGAATGGCCTTTTACATACCAATAGCTCGGCCAAAAACATCATCCTTCAAACTTCTGTGGAACGACATTTCATTTGGCAAGCAAATGAGTGACACTGGGGAAACGAATGCAATTCAAAATAGTTTTATTGGCTGCCTTCATTTGATGCATCCGTATTCCACAAACCCTGATCATGATTTAAACAACAATGTAGACAAAGGACGCTTTGTTGCTAATGGTTGTCTTGATGCCTGTGTCATTCAGTCTTGTGCAAACCATGGCAAGTGCATTAATCGAGTGAACCATGCAGTTTGTGATTGTTTAGGAACTGGATTCGATGGGTCTACCTGTGAACAAGGTATAGTGAAATTTGAATCAGGAAAAATTGTTAATGATGGAAAATGGCACTTTATCAAGTTTGAGCGCCACCTCCGGCTTTTGTCCTTTTATCTTGATGGATTCCTTGTTGGTAGTTCAACTTTAAGTTCTGACGTCCTTCAATTACGTATAGTGAAATTTGAATCAGGAAAAATTGTTAATGATGGAAAATGGCACTTTATCAAGTTTGAGCGCCACCTCCGGCTTTTGTCCTTTTATCTTGATGGATTCCTTGTTGGTAGTTCAACTTTAAGTTCTGACGTCCTTCAATTACGTATGTCTGGTGGTGAGGAATTAGTGTATTTTGGTGGAAGTAAACAAATGTCGGCGAGTCTTCTCCTTGAAAACAAAGCAAATTTTACCGGTTGTTTGCAACAAGTGCGCTTTAATCGTGTAGACATTATACATTCAGTGCTATACTTAAAGGACTGGCGATTGGCATTTTACGGCGACAGGTCAAGGACCTGTAAGTAGCCATTAATATAGAAAGGTTGGAATTTACTCTACTATATTAAAAAAAGAAGAGATATTGACTATTTTCAATATTTAGTCGAGTCTATATAGTACAGTACAAATAAGTATACAAATGATCAAGAATATTGGATAAGAGGTCATGGTTTTCATCATTTAAAAATACGAACCAAGTAACATTACAGGTCATTGAAAAAAGAAACCATTGTTGTTCATGTAAGGCAGAGGAATTTCACGGTGTAAAGTAAAAGCAAAACAGTAGAATTTTATTTTTAGAATTCATCAAATTTCTGGTTTACACAAATTCCAATTTTCTTGTACTTCCTTTTACATAACTTTAATACAGCATTATCTGTTAAATAGCAGAAAAGTATCATTGTTTATTATGATAACATATTTATCTAAGCTCACCATATGTTCAGTGTACATTAACAAAACAACAACGTCGTGTTACAAGGAAGTAGAAAAATGAAATTTGATCATTTTATACTACAGGTTCACCTCAAGAGAGACTTATGTTACCTTAACTCTTCAAAGGCTAGACAACACTGATTAAACTGCACAATAATGTTTTTATGCTTTTTCAACAAGAAGAGTTAAATCAGTTGCACTAGTTAATGGCCCTATATGGATTTAAAAAACAATATTTGGTCCCTAAATCCAAATATAGCCATAAAAAGGTTCAGTTGGTTCACGTTTCCAAGGTGTTGATACAGCCACTGGTGAATGTTTTCCAAGTTGTCATTGACAATAAATTACTGTCACACCTTTATCGGATACAACTCGTAAATAGACTTATTTTAATTGCAATACTGATAAATAATTCTTTATAAACGTAAAAAGTAGGAAGAAAACATTTAAATAAGATATTCTTATAAGAGAAGAGAGCTGCATGAAAAAAACCTTCATTTTATACTTTTTTGTCCACTCTCATTGTAGCTTTCCTTTTGAGTAGATTTCATTTGGCATGTTGCAACTCATCTAGGTTTATACTTATGAAAGGGAGATTCGACCTATTATCTTTCaatagtaataacatggtttttgcgggtgatttgaaattaatgggattattaattgcaaattaccggaaaaaacatgttattcctaattaattatataacaaaattgtcTACGAGGAATAATAAATCTTTATCTGACAACAACTGAAATCTTGCCATCTTTGTGTTTGTTGTTCTGTTTTATTTTCGtcagatttattggagccaatcatatgaattgtttacaaaatactgtcttctgattggctaaaaatgtatcgtacgatatttttgtaattgacatggtgattacaaaaaactggggcggttacaagaaaatcactctcacatacgctttccaactcaagctgtatgtaataaatcttataattaATA

Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02210	Laminin_G_2	Laminin G domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001791	Domain	Laminin G domain	Interproscan
IPR000742	Domain	EGF-like domain	Interproscan
IPR050372	Family	Neurexin-related cell adhesion and synaptic protein	Interproscan
IPR013320	Homologous_superfamily	Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR15036	PIKACHURIN-LIKE PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
-	-	-	-

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K24341	EGFRAM; pikachurin	-	Domain-containing proteins not elsewhere classified	ko04990	deepkoala