Functional Domain Search

Search every annotated genome in CnidoSite by protein domain, not just by gene ID. Enter an accession (IPR016024, PF12848, K13752, GO:0005615, PTHR19143) or a free-text term (kinase, Armadillo, homeobox). One query covers 148 annotated genomes.

InterProPfamKEGG pathwayGene OntologyPANTHER
Examples: IPR016024 PF12848 K13752 homeobox  ·  matching is exact on the identifier and partial on the description.

Found 22 gene–annotation pairs matching PF01554 across 1 genomes (restricted to Cassiopea xamachana) · 4 ms.

Species with hits:← all speciesCassiopea xamachana 22
SpeciesGene IDPfam termMatchSourceBrowser
Cassiopea xamachanaCxam_g20521.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse
Cassiopea xamachanaCxam_g15062.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse
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Cassiopea xamachanaCxam_g9363.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse
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Cassiopea xamachanaCxam_g7723.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse
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Cassiopea xamachanaCxam_g2452.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse
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Cassiopea xamachanaCxam_g2399.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse
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Cassiopea xamachanaCxam_g12615.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse
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Cassiopea xamachanaCxam_g4349.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse
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Cassiopea xamachanaCxam_g7724.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse
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Cassiopea xamachanaCxam_g10926.t1PF01554MatEInterproscanJBrowse

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