Gene detail

Detailed information of Clavulariidae_g12708 in Trachythela sp. YZ-2020

Genomic Location: ctg000256:1054384...1074911
NR annotation: no NCBI-NR hit recorded
Species Trachythela sp. YZ-2020 · all data for this species · gene families

Gene Structure

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Sequence

CDS

Clavulariidae_g12708

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Transcript

Clavulariidae_g12708

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Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01412 all species →	ArfGap	Putative GTPase activating protein for Arf	Domain	Interproscan
PF08518 all species →	GIT_SHD	Spa2 homology domain (SHD) of GIT	Family	Interproscan
PF12796 all species →	Ank_2	Ankyrin repeats (3 copies)	Repeat	Interproscan
PF12205 all species →	GIT1_C	G protein-coupled receptor kinase-interacting protein 1 C term	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001164 all species →	Domain	Arf GTPase activating protein	Interproscan
IPR013724 all species →	Domain	GIT, Spa2 homology (SHD) domain	Interproscan
IPR002110 all species →	Repeat	Ankyrin repeat	Interproscan
IPR036770 all species →	Homologous_superfamily	Ankyrin repeat-containing domain superfamily	Interproscan
IPR022018 all species →	Domain	ARF GTPase-activating protein GIT1, C-terminal	Interproscan
IPR038508 all species →	Homologous_superfamily	ArfGAP domain superfamily	Interproscan
IPR037278 all species →	Homologous_superfamily	ARFGAP/RecO-like zinc finger	Interproscan
IPR047161 all species →	Family	ARF GTPase-activating protein Git-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46097 all species →	G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR KINASE INTERACTING ARFGAP	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0005096 all species →	Molecular Function	GTPase activator activity	Interproscan
GO:0005515 all species →	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0007420 all species →	Biological Process	brain development	Interproscan
GO:0008277 all species →	Biological Process	regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway	Interproscan
GO:0031267 all species →	Molecular Function	small GTPase binding	Interproscan
GO:0032012 all species →	Biological Process	regulation of ARF protein signal transduction	Interproscan
GO:0036465 all species →	Biological Process	synaptic vesicle recycling	Interproscan
GO:0045202 all species →	Cellular Component	synapse	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

No KEGG orthology assignment for Clavulariidae_g12708.

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.