Gene detail

Detailed information of Clavulariidae_g15528 in Trachythela sp. YZ-2020

Genomic Location: ctg000307:934554...947212
NR annotation: no NCBI-NR hit recorded
Species Trachythela sp. YZ-2020 · all data for this species · gene families

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CDS

Clavulariidae_g15528

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Clavulariidae_g15528

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Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03133 all species →	TTL	Tubulin-tyrosine ligase family	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR004344 all species →	Family	Tubulin-tyrosine ligase/Tubulin polyglutamylase	Interproscan
IPR051437 all species →	Family	Tubulin tyrosine ligase-like monoglycylase	Interproscan
IPR011761 all species →	Domain	ATP-grasp fold	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45870 all species →	TUBULIN MONOGLYCYLASE TTLL3	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0036211 all species →	Biological Process	protein modification process	Interproscan
GO:0015630 all species →	Cellular Component	microtubule cytoskeleton	Interproscan
GO:0018094 all species →	Biological Process	protein polyglycylation	Interproscan
GO:0070736 all species →	Molecular Function	protein-glycine ligase activity, initiating	Interproscan
GO:0005524 all species →	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0046872 all species →	Molecular Function	metal ion binding	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	Pathway	Map ID	Source
K16608	TTLL3_8; tubulin monoglycylase TTLL3/8	EC:6.3.2.-	Cytoskeleton proteins	ko04812	deepkoala

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.