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Detailed information of XP_058959646.2 in Pocillopora verrucosa

Genomic Location: chr4:19573508...19609678
NR annotation: no NCBI-NR hit recorded
Species Pocillopora verrucosa · all data for this species · gene families

Gene Structure

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Sequence

CDS

LOC131786607

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rna-XM_059103663.2

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Protein

XP_058959646.2

MAIWPTALISVLFVVIHFAGVTWAANAARNREITANSTCGSPPEIFYSVVERKKSPRYRIKSYCNATDSILSHNASKMVDGKYETWWQSSASIDKVSITIDLRGEYQKYYYVNKLVITFGEYYRPGQLVFYKSSDYGQSYQPWHYFVSTADECRKKFNRPPQSNPVRVDQVLCTVYPTESKDINDVVSLIVVGPRGDVENPSDKLLEWMNVTNVRLQFMSLFRIFDPLAVKWHHYAVREVEVDAYCVCNGQGNGIDCKFNDTLGENECVCQEGACGIDCGRCCPAYNQYPWKPGNRGPLVADKDAACQLCNCHNHSAVCVYNETVAQMKKSLNIHGNYSGGGVCQNCQDNTEGINCEVCKPFFYRPRNKLQWDKDACRACNCSVAGTKNATLPGVLYLDCLRDENTVPLRPGMEPGSCVCKNNTFGRQCDQCKPGFFNLSTENPTGCQECMCHTPGTVNGSNVCEPGASGHCTCKKNVEGKHCMHCKDTYYDLHKDNVYGCTECDCDVGGSYGPVCNKASGQCKCKANVTQRQCNSPKDEFYFPTLHFIRSHGYHISASQEGNKTWSASVDIVQGVNSTGIFTLIFSYTSAVRVTVMISVESTIVAVSLDSCAQKCYQNLSAVLGERSLSGTLVVNVTYPASVVDFKPLEVVAIPQEFYQATLLNNSTGPEFLANCSVLDNNMGDGVVKEFCLAQVFSLTVDYLGGALACNCSMTGSVNSTCQKYGGQCHCKPGVTGRTCDQCMAGFYNFTSRGCSACGCVGEDKICDAESGQCTCPPNTVGRTCNQCNYTFWGWNETVGCEACNCSSVGSMNLQCNLTTGICSCKPGVQGEKCTECMNGYKNFSTSGCSPCNCNGNGSLSEVCDKVSQQCPCKNNSAGLLCDRCKNGYFYLTSSNPEGCTNCVCMGISTNCSSTRHYRKKNQVDLNVWKLGSYTDNQNYIEVSQISVMDDSVPVTMIAANVSTNKTLYWKASANFTDHSLIGAYGGNMSFKLFFKPLANGTLAVSQPKVILKGIRNISIEHALAAVSADQATARTVTMREIAWVYSDSLLLVSREDFLLVLARAQALFITASFYSAGQGLYLTSLGDVKIDDVSEMVSDAGRAYDVEQCNCGDGYTGLSCERCARGYHRVNVSDDMFLGKCEPCNCNGHTEDCDPATGQCLNCAHNTTGFHCEICLDGFYGNATHGTPGDCKKCPCEEPRTTTALCKAGADGQPECLNCSEGYKGDICGSCQLGFFGEPLMPGGNCSRCQCNNNSDVCNTTTGECLNCQYNTTGFHCERCENGTWGNATAQQCQACVCDGVGAYHNVCNHVTGQCECKPHVTGLNCSRCEPYSYNFTSGGCTPCECNKFGSSSLQCNESGICQCKNHTLGDKCDLCEWGYFGLPNATCQDCNCNDTGSDNHTRCDRTTGQCYCKPGVTSRVCDQCMVQHTNFSGDGCDPCPRCTRLGLQGDLNTTLTILKDAQQKADTVSNLKKLWPELEEVEGLIAEAKKSSAEFDILVKGLLQNITELEKSTPNRTVGELQDMLTRTSQESENLTSIVSRELLQIEELNRNTQSSKDNLTALNGTVTEILDQLTKLRDHADSVLGSINGIINKTYETEMQRVDEEVQSVESAHSLAMSAQYNVTSHKNMSENLNKTMLQAQGSYLISNGMFDLMKPQIVTITDRTNEAVALMNQTKNLIDKARNTTDHALELLQIVTGILNSSSQYVSTGHSYYKNTSDLIGGLQADMNTLENSLTAVGPEVSAANQSVLENATKHAANLTALARERQSVFNNTLAHGARAVDAIKTFEEVVVLGNQSLETSQQVNSSLQEIMNRLENLTVVSSDLQTRVASSRDKSETLLNETLDRDINLPGLRANVTSSNRTYMNAVMTGESVDTQYSSLLSSRDLLMQAAEVGSNSHSIVSDSKSATDNFEEAMYRSNPVNDGVPALLNQVDRLEERMQSINQSAERAAVLMNQAFDNVQNASKSLDSVDDTVQESDRLRNITVSLQAQLKQNMTALDEKLRRAREYVAKIRLALNVQGSTVVRYNPTSRLINKTTYTEIRMDFRATRVQGALFYLSDESNSALAVTLEAGSYVRFQYTLGTGPITITNWAVPVRPGHWYTAYATRYKTDGRLTVTDHSRNFSRTYESDSDTISSVIDTDFRLNDLVHIGGLPDGVMVNKSDRYFDGCIDNVVLNQEALNLWEPVEVQGNRSFCSRRPAVQMDTVPGSSFFGIPDGHLKQTMGEFNITGESKMEFEFRTFFETAFVAGVLNGQNYAYGVYLNDSRVVFFFKTYNRTYTVHSNSNSYSDGRWYKVHVVRGLRNTSLAVRPVGLSDGGAVDHVTIMTKTTEYLADGQALLFGGKDPNSAISAPVGSPFAGALRYVNISSPLSGSLMTRPLNNANMNLSLEGVSFKGLLPVVEEGIRFLGNSYAAVETGEAQMKSLEISFKTLSPSGVLVYSAGGEGPWFYLALFHGNIYLVHVTDLEKIVSTVSKDETLNDGAYHTVKIEFGPAGSNVYLDGNSLSEVFAKGYVSLNGSLWIGGVDDRTNIPREFPVINAFKGDMKILKVNGKDVNIFSGRSLGVSLAGVSPELNVIPTALPTTPPPTKPPPTCGRSHPPLRNSSREDEARLDGSDYMAFHASAEVLNFTRTRFVISVKFRSLVPNGVLLYAANDLQMPTHFISLELVNGRLVFKYNAGFKTVKVLSTFNNYSDGGYFYTVRLLRINQFGAMLVVSNKDYGNQRQGDDKVPLEINTPFYYGGVPRGINLTHLECHGVGFLGCMGPLEIQDGNFESKTFNPRTDRDERDSNYTFKACYSEIQAQVGFSGDGHIVYDSNYSLPEETNIGIIFRTTTRSGLLLSITNSSGPGSVTLEQLEGQVVLIFNNAHNSSVIRWTDPSIPEDGQYNASFHLCDNKFHRVLVSRNKGIVELRVDDHAPLQGVVPSAFTLNQGKFHIGGVPDGSGYQTHSGLSHKGFTGCVQGLKIDEQAVGLLRLNPSQLHNVQLGCNAPRQA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00052 all species →	Laminin_B	Laminin B (Domain IV)	Domain	Interproscan
PF02210 all species →	Laminin_G_2	Laminin G domain	Domain	Interproscan
PF00053 all species →	Laminin_EGF	Laminin EGF domain	Domain	Interproscan
PF06009 all species →	Laminin_II	Laminin Domain II	Coiled-coil	Interproscan
PF00054 all species →	Laminin_G_1	Laminin G domain	Domain	Interproscan
PF00055 all species →	Laminin_N	Laminin N-terminal (Domain VI)	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002049 all species →	Domain	Laminin-type EGF domain	Interproscan
IPR000742 all species →	Domain	EGF-like domain	Interproscan
IPR000034 all species →	Domain	Laminin IV	Interproscan
IPR001791 all species →	Domain	Laminin G domain	Interproscan
IPR013320 all species →	Homologous_superfamily	Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily	Interproscan
IPR050440 all species →	Family	Laminin/Netrin Extracellular Matrix	Interproscan
IPR008211 all species →	Domain	Laminin, N-terminal	Interproscan
IPR008979 all species →	Homologous_superfamily	Galactose-binding-like domain superfamily	Interproscan
IPR010307 all species →	Domain	Laminin domain II	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10574 all species →	NETRIN/LAMININ-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0009887 all species →	Biological Process	animal organ morphogenesis	Interproscan
GO:0009888 all species →	Biological Process	tissue development	Interproscan
GO:0007155 all species →	Biological Process	cell adhesion	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

No KEGG orthology assignment for XP_058959646.2.

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.