Gene detail

Detailed information of XP_058960892.2 in Pocillopora verrucosa

Genomic Location: chr11:20994549...21000283
NR annotation: no NCBI-NR hit recorded
Species Pocillopora verrucosa · all data for this species · gene families

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Sequence

CDS

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rna-XM_059104909.2

TGTTGATAAATTTTGCAGGCAGGCGCAGCTGGGTGAAGTTCACTCAATGTTATCGGCATCAGAAGACTACTCCATAATCCGCTGAAAGTTTCGCCGGGTATAAGTTGCCTAGTTTTGTTTGCCGGCCGGTGAAGAGAATATTTGGCTTTACATCAAAATGGAGAGAATTCGAAACGGTGGACCGAAAGCAAATGGCTTTGCGACGGGGAAAAAGCTAAATGGAGTTGATCAACTGGCGTGGCACAAAATTTCATACAAAGCATTGTTCGGCCTTCTCTTTGTCACTCCGGCCCTGGTACAGTATAGTTTGGGTTTGCCTTATTGGTGCTATCCACTAACCTTCGCCGTCTTGTTTCTGCCAGTATTTGGTGTCTTCATGGTGGCATTCAACCGAATGTGTGTCGCTGAAAGCGGTACGAAATCAACGAATGTCAAACGGTTCATTGAATTCACAGACCAGGTTCTCGCTTCAAAATACGCCAATCGAAAAATACCAATGATAGTCCTTTACGAGGCTTACGCTGATGGCAAGCTAGACTTCAAATGTGATGTGCTAGAAGCTTTAGAAAACCGTCACCAATTCTGTACCTACGAACTGACATTTGAACATATCAAGTTTTTGCTCTGTAATTTTATTCCTGAAGTGATTTTTCATTCAAGGAATCAAGACGCCGAACAAGTTTGTGATCACTATGACCGTGGCAATGACTTTTATCACGGATTTCTTGGCCCCATAATGATTTACACATCAGGAATATGTAGAGATGAAACGGAAAATCTCGAAGATATGCAGGTGAACAAGCTGAAGAGCGTGTGCGAAAAGTGTCAGTTGAAAGAAGGCGAGCGGCATTTAGACATCGGCTGTGGGTGGGGTACCCTGGTCAATTATGCAGCAGAAAATCACGGAACCTACTCAACTGGCGTTACTATAGCCAATCGTCAAGTAGAGTGGGCTGAGGGAGTAGCAGAAGAGAAGAAGCTTGGTAGCCGCAGTAAATTTCTCTGCCTAGACTACCGTGATATACCAAACGTGAAATTCAACAAAATCACATGTCTGGAAATGGCAGAGCATGTTGGTGTGAGGAAATTTCAATCCTTCCTGGCTCAGGTTCGTGACATGCTGGAGGATGATGGCATCTTCTTCCTTCAAATTGCTGGGTTGCGTCGAACCTGGCAGTGGGAAGATTTCATTTGGGGTCTGTTTATGGCAAAATATATCTTCCCAGGTGCAGATGCAAGCTGTCCATTGGGTTGGGTTGTCACTCAACTGGAGAAGGCTGGCTTTGAAGTCCATTCTTCAGAAACCATTGGGGTACACTACTCGCTGACAATCAATCACTGGTACAATAATTGGATGAAGCCCCAAACCCAAGCTGCCATGACAGAAAAGTATGGCAGAATTGTACGAATCTGGAATATTTTCCTGGCATGGTCAACCATAATAGCTCGTCAAGGCAATTCAACTTGCACTCAGCTGGTATGCCATAAAAATCTAAATGTGTATGATCGCTTGAAATTGTTCAAGGTGAAATCTAAGTGAGTACTTTTTATTCTAGCATGAAACAAATCTAGGTGTCTTGTGAAAGAGTCTTGAATCGTGATCTAGAATATTAATGTTTGTTAACCTTTGTGACAACTACACAGTTGTCATGGGGAATTTTATCAGCTTAACTACATTGTGACTTAAATTTGAAGGGACAAGTTATTATTTACATGATGAAAAATGTGTCAAGATGTACTTGTTATTAAGTCTCATCTGCAGTTTAAGCATGATTCCATCATgactaaaaataatttgacacttttcttttttatttacacCGATCATAATGATTtgagttttgtttctttccctCATTTGAATTTATGTTGAACATCAGTAATTTTTGGCCAGTTGAACTGGCCAATGGAaggatttttttgaaaattaaaagcaagttCTCTGACTGActtgagaattttattttacctaGTCAGAAATGTGTTTCCACTTTCATTAGTATCAAATTTGATTTCCTTCATGTTACATATTTAACAATATTAGTCCATTTAGATTGACAGTTGTCAGATAGAATTTTTGAGAAATGGAAATTTAACTGGCTCAAATATCCACAAAGCATATATCTTTCCCTGAGAACTGTTTAATATATGAACATGTTTGATGAACAGACTTGTAAGCTGCTGCAAAACGCTCTCTCTGATTCTATTTCTTGATTAGTTGTGTGATAGTAACTACacagtgaaaagaaaatagagaGTTTTGAATTTACACATGAGTAagcaaagaggaaaatttacatttcattaCTAATGGGaacacagctttttttttcctttctgcaCTGTAAGATTTACTTTTGGTGAAGAAATGGGAGGTGGTCAGATAGAACAGCTGTTTTATATAGCAGCATAACTATGATTGAACAACATCTGTCTAGCTCATTAGTCACTTACAATGTTTTGTGAATAGCTAACCACATCAATGACTATGAGTTAGTCATTGCCTCAAAAAGTTAAGAATTTGTTGAGCAAGAATGGTTTCTAGTGTGATATTCTAAGCACATATTTTGTGAGAAGTGCcatgatatttattttaaaacacagAGGAATTTCTTTGGATTGTGTGACTGAAATTGTATTTATGACCACTCCCTTATTTAATGGAATATAAAATTAAGTATACACAAGGGGATTTGAATGAAGATTCTAAATAAGGGTTTCTGTTCACATCAGTCATTTTCATATATCCTATCATGGAGAGATTTTACTTCCTTTATCAAGTTCAATGCCTTTGTAGGTAGactttttatgatttcaatttttctttcctctctctctttcaCTCCTCTATTTGTTGATGTTGTGGTTTTAAATCAGAATTTCAAGCTTGCACAgtataaaatgattaaaataattttccttatcTGTTGTTTTTCAAGCTATGAACTTAAGACTGTAAGCTACATTCTACTGAAAAGAAGATTATTGTTATGGTTAAATTAAAGCAAACCAATGCCCGCCGATTAAAGTTATAAATTGCTTGCTAATGTATAGAAAAACATGGATCAGTGATTCCCTCAAGGACTAAATCAAAATGATTCCCATAATTTTGCTTGAGACTATTCCTCCAAAATGGTCTCAAGTCAATATATATTAGATTAATGACaaatttgttctcttttaaataattttctgctATCCTTATTGCAATCAGTGTTgatgtaaaaaatttatttatttaaatcatcatcagtaaaaataatatttattggTAAAGTAACTATCAGTAATTGAAAGTTAGGGATGAAAGCATACTTGTAGCAGGTTTAATTCTGGCGAAATTTCCTTGAAGAGGAGCATTTTGGCCAAACtagataaatttttctttaaatatgaattcttaaatgttttgttcagtCGTTCATTTTGTGTTTACATTGCGGGGCTGAAATTTGTTCTGTCAGCGCCTATACTTGCTTTTGCAGTATCAATTGATTGTTGATATTAAAacagcaataattttttttcatgtgagCTCAACACAGGGAATTTCCCTAGTGGCATTTGCTTAGCATTTAGAATGATTGGTCTGTAACTACATGCTCTCTCTACCAGTTTAAAGATTTAAGATTTGAAGTACATTTTAATATCATTGTTCACAAGCCAGTGTTATTGtatatctttaatttctctgttttcattTGTGGGTATGTTATGGAGTGATGAAAGTGTGATGGTTGCAAAGAGAAtgagactgaaatttgtttcaTTGGAGGActtaaataagaaaatttggAGTGCGGTTTTTAAATGATCCTGTGCCTTGACTTGATAACTAAGTAAAGGTGACTTTTCTTTGTGTCTGCATATCTTGCTGCAAAAAACTTAGATTTTTTTAGAAATcctaatgaaaaatttacatacAAAAATTGAGCATTTACAATCGTTGCTTGAAAAGCATATGGTAGAACCTCAGTCGACAATTTGAACTGCAGATGAAAATTAATACAGTTCACAGTACTAGGGAATTTGTTGAGTTGATTGACTGCAAAATGCACGTCAAGGGAGAATCCATTCAAGTTATTGAGGTTCCACCACATGTAGAGGTGATAACTATCATAGTATTCTGAGTGCTTACTTGCACTTATTGTAAGGAAGAGCAGTTTTCTTGGCTGCGCCAAGTTGTAAAATATTGCTCATGAAAAGTATGGCTGTGGGCTAAAACTAGCATAACTAAGTTGTAGTCATGATACAAAAGTGTGGCAAAAAATACTAACAGCTGGGCTAAAAGAAAGTATTCTTGCTGGCAAGAATATCTCCTGTGTTTTTTCCAACACCTTTGTATCTTGGATTTTTGTCAACTGAATCAACAATACCATAGTGTTACTGGCAGTAAAACTCTTACTGTACAGGACAATGTGCCATGCATGTGAattgaaattcatttatttttattattaatagtgCCATGTGACTTACTTATGATGCCTATACTTGATGCTAGATTATATTTCTGTTATGTTATCAGTAATGTTACAGTTCTTACATAATGCTATATTTTTATGTAAAACGGATTATTGCATGTTGCTTGGGATATTTTTCACAAAGACCAGATTTGATCTTCAGATGCAGgctttttgtactttttaagTTTCTCATGAAAGATTTTCAGTTCagtaaaagtaattttaatttcaaagaactGTCATTCAAGATTCCATACTAGTCTTTCCTTTTCTGGGTGTAACagtgaaatttttcaaatatttcagtgCTTTGGTATGGCAAAAATACCATATTAAGGAGAGACTGTAATTAGTAAATGGTATTTATATGCTGGAACTGATTCTATTGCAAAAGGAGAATTCAGCTGTATTTATCCTGagggttgtcaaaaagattttgagCAACTGGACTACTTCCTAAAGTAGGCAGCATTAGAGGTCAAAAGCTCCAGGCAAGGGCTATGGGAACCACCAGCTTTTGGAATAGCCAATGTG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Protein

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02353 all species →	CMAS	Mycolic acid cyclopropane synthetase	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR029063 all species →	Homologous_superfamily	S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily	Interproscan
IPR052290 all species →	Family	Sphingolipid C9-methyltransferase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45197 all species →	SYNTHASE, PUTATIVE (AFU_ORTHOLOGUE AFUA_7G04190)-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO term	Category	Description	Source
GO:0071216 all species →	Biological Process	cellular response to biotic stimulus	Interproscan

Search by domain instead of by gene. Any accession above (InterPro, Pfam, PANTHER, GO, KEGG) can be used as a query on the Functional Domain Search page, which searches all 148 annotated genomes at once.

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	Pathway	Map ID	Source
K20238	E2.1.1.317; sphingolipid C9-methyltransferase	EC:2.1.1.317	Enzymes with EC numbers	-	deepkoala

Searching by KO or pathway ID across all species is available on the KEGG Pathway page.